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1、最新基因芯片技术在环境微生物群落研究中的应用【PPT】-药学医学精品资料基因芯片基因芯片,又称DNA微探针阵列(microarray),是一种最重要的生物芯片。它的工作原理与经典的核酸分子杂交方法是一致的,都是应用已知核酸序列作为探针与互补的靶核苷酸序列杂交,通过随后的信号检测进行定性与定量分析。基因芯片在一微小的基片(硅片、玻片、塑料片等)表面集成了大量的分子识别探针,能够一次分析大量的基因,进行大信息量的筛选与检测。环境样品及其环境微生物群落研究环境样品包括活性污泥、土壤、水、烟、气溶胶、淤泥、海洋沉积物等。而环境微生物群落研究包括环境样品的微生物分布、种类、功能、
2、动力学变化及气候、环境污染等环境因素改变对其微生物生态的影响等。功能基因芯片(FGA)功能基因芯片通常建立在催化生化反应的关键功能基因之上,这些基因包括了那些与研究对象有确定关系的基因,或至少是与研究对象的关系有待考证的基因。作为FGA候选基因应该具有的特点:(1)该基因是参与生化过程的关键酶或蛋白质编码基因;(2)进化保守但在不同微生物之间具有足够的变异,从而可以对不同菌株设计探针;(3)不同的基因在数据库的序列信息量是不同的,应该选择在公共数据库中具有翔实序列信息的有关基因。根据FGA的目的及其杂交靶标的种类,FGA分为功能分类基因芯片和基因表达芯片。前者的目的主要
3、是研究菌群是否具有这些特定反应过程及其功能的分布、变化、多样性,其杂交靶标是菌群DNA的PCR产物。而后者用于研究这些特定功能基因的生理活性及其基因表达情况,需提取环境样品的mRNA,其杂交靶标是菌群cDNA的PCR产物。FGA的探针主要是功能基因的PCR产物或合成的寡核苷酸,其中,前者通过对某些微生物功能基因保守序列设计引物,从而扩增出相关基因;而后者是通过数据库中的序列信息直接设计的。目前,FGA应用推广的限制性瓶颈在于功能基因数据库的不完整性和某些微生物的不易培养性。群落基因组芯片(CGA)群落基因组芯片(CGA)是一种将可培养微生物的全基因组DNA作为探针的技术
4、,它的特异性高,可以鉴定到种甚至菌株水平;敏感性强,只需0.2ng的待分析基因组DNA就可检测。CGA在微生物检测、鉴定、量化、不同环境样品的微生物菌群相关性或不同微生物基因组的相关性分析等方面将有着广泛的前景。宏基因组芯片(MGA)未培养微生物组成了地球上生物多样性的主体,据估计,自然环境中超过99%的微生物不能用传统的方法进行纯培养,因此,人们开始通过免培养的技术即宏基因组或直接从环境样品中抽提克隆微生物的混合DNA来研究环境样品中微生物基因组的功能和序列分析。目前,利用该技术已进行了酸矿外排液和SargassoSea的微生物群落、活性污泥和土壤细菌PHB代谢遗传学
5、等的研究。宏基因组芯片则是一种高通量文库筛选技术,是一种将芯片技术和宏基因组技术结合起来新技术,该技术无需分离培养菌株、无需了解菌群的基因序列。它的探针来源于环境DNA的宏基因组文库,可通过大肠杆菌作为宿主来构建,一般来说,MGA所包含的探针为1kb左右。该技术可以分析环境样品微生物结构和功能;可以通过不同环境样品宏基因组芯片的比较分析获得某环境样品菌群的代表DNA探针。目前,MGA技术仍在发展初期,但由于环境中存在大量的未知基因序列,因此它在环境方面将具有巨大的应用价值。使用时,直接删除本页!精品课件,你值得拥有!精品课件,你值得拥有!使用时,直接删除本页!精品课件,
6、你值得拥有!精品课件,你值得拥有!展望新功能基因、新功能蛋白的挖掘。环境样品基因表达谱芯片的建立和差异表达基因的寻找。环境新监测技术的开发。气候对环境微生物群落的影响研究。员工工作绩效考核主讲:管理语录培训是告诉员工该做什么,考核是检验员工做的怎么样,只有通过考核,才能知道员工的工作绩效和工作态度,可以说,没有考核就不存在管理。考核是企业文化理念在管理中的集中体现,公正、公开、公平是考核中的最重要原则,考核面前人人平等,不允许任何人在考核之中享有特权。目录一、什么是考核——考核的概念和原则二、为什么考核——考核的目的和意义三、考核什么——考核的内容和标准四、怎么考核——
7、考核的方法和程序五、谁考核谁——考核的主体与客体六、考核后怎么办——考核结果的应用1、问题的提出(1)作为主管人员,你想给工作出色的员工奖励,但又怕引起其他人的不满?(2)某员工能力不足,但你却不知道差距在哪里?(3)某员工能力较强,业绩不错,想给予晋升,却找不出晋升的依据何在?(4)想辞退某人,却又觉得很难为情,甚至无法面对他提出的质疑?一、什么是考核——考核的概念和原则2、考核时代的到来(1)初级阶段的管理——经验型,以人治为基本特征其考核带有极强的主观性和随意性,维护上司的权威和面子是考核的内在目的,因而其标准也是以上司的好恶来衡量