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时间:2018-01-03
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1、lncRNA芯片技术服务 长链非编码RNA(lncRNA)是一类转录本长度超过200nt的RNA分子,它们并不编码蛋白,而是以RNA的形式在多种层面上(表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等)调控基因的表达水平。随着越来越多的lncRNA被发现,人们开始关注到lncRNA在各种生物学过程以及疾病中所发挥的功能。通过lncRNA芯片,研究人员能够快速高通量地获得与特定生物学过程或者疾病相关的lncRNA信息。 LncRNA芯片服务 我们为您提供美国Arraystar公司lncRNA芯片的全程技术服务,该芯片覆盖目前所有权威数据库所
2、注释的长链非编码RNA,是目前市面上唯一一款以lncRNA为主,数据库版本最新,覆盖最全面的lncRNA芯片。 Arraystar公司lncRNA芯片产品列表:服务名称芯片规格描述HumanlncRNAMicroarrayServiceHumanlncRNAArray12×135K覆盖Refseq18,874条蛋白编码mRNA,以及NCBIRefseq,UCSCKnownGene,NRED,RNAdb等多个数据库的18,534条lncRNAMouselncRNAMicroarrayServiceMouselncRNAArray FullVersion4×4
3、4K覆盖NCBIRefseq,UCSCKnownGene,NRED,RNAdb,Fantom3等多个数据库的40,023条lncRNAMouselncRNAArrayStringentVersion4×44K覆盖Refseq19,465条蛋白编码mRNA,以及NCBIRefseq,UCSCKnownGene,NRED,Fantom3等多个数据库的13,868条lncRNA(stringent)RatlncRNAMicroarrayServiceRatlncRNAArray4×44K覆盖Refseq15,283条蛋白编码mRNA,以及NCBIRefseq,U
4、CSCKnownGene,等多个数据库的9,319条lncRNA 可靠的数据来源 lncRNA芯片覆盖所有来自Refseq(2009),UCSCKnownGene(2009),NRED(2009),RNAdb(2006),Fantom3等多个权威数据库注释为lncRNA的转录本,并在此基础上收录了相关文献中报道的lncRNA,是目前覆盖最为全面的lncRNA芯片。 优质的探针设计 ArraystarlncRNA芯片设计探针为~60mer的长寡核苷酸,这些长寡核苷酸探针在高严谨杂交条件下可得到高灵敏度及高特异性的理想实验结果。 与
5、mRNA表达相结合 lncRNA芯片还覆盖最新的Refseq数据库中所有mRNA(proteincoding)的转录本。因此,在一次杂交实验中,可以同时检测mRNA和lncRNA的表达水平,并根据相关的mRNA表达水平变化将鉴定出的lncRNA和已知的信号通路联系起来。 常规lncRNA芯片研究流程 康成生物lncRNA芯片技术服务实验流程1.样品总RNA抽提 若实验对象为组织样品,取适量(50-100mg)新鲜组织样品或正确保存的组织样品,加1ml的RNA抽提试剂Trizol(Invitrogen),匀浆后抽提RNA。 若实验对象为
6、细胞样品,每份样品取1×106~1×107细胞,完全吸去培养液后加1ml的RNA抽提试剂Trizol(Invitrogen),裂解后抽提RNA。2.RNA质量检测 使用Nanodrop测定RNA在分光光度计260nm、280nm和230nm的吸收值,以计算浓度并评估纯度。 使用甲醛变性琼脂糖凝胶电泳检测RNA纯度及完整性3.cDNA样品合成和标记4.芯片杂交 在标准条件下将标记号的探针和高密度基因组芯片进行杂交。5.图像采集和数据分析 使用GenePix4000B芯片扫描仪扫描芯片的荧光强度,并将实验结果转换成数字型数据保存,使用配套软件
7、对原始数据进行分析运算。6.提供实验报告 芯片扫描图 实验方法英文报告 RNA质检报告 芯片数据结果报告,包括差异表达lncRNA列表,差异表达基因列表
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