ms常见问题及解答( materials studio )

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1、MS常见问题及解答1、问:用MS构造晶体时要先确立空间群,可是那些空间群的代码是啥意思啊,看不懂,我想做的是聚乙烯醇的晶体,嘿嘿,也不知道去哪可以查到它的空间群答:A、要做晶体,首先要查询晶体数据,然后利用晶体数据再建立模型。晶体数据来源主要是文献,或者一些数据库,比如CCDC。(你都不知道这个晶体是怎么样的,怎么指定空间群呢?要反过来做事情哦:)B、我不知道你指示的代码是数字代码还是字母代码,数字代码它对应了字母的代码,而字母的代码它含盖了一些群论的知识(晶系,对称操作等),如果要具体了解你的物质或者材料属于那一个群,你可以查阅一下相关的手

2、册,当然你要了解一些基本的群论知识.MS自带了一些材料的晶体结构,你可以查询一下.2、问:各位高手,我用ms中的castep进行运算。无论cpu是几个核心,它只有一个核心在工作。这个怎么解决呢?答:请先确认以下几个问题:1,在什么系统下装,是否装了并行版本。2,计算时设置参数的地方是否选择了并行。3,程序运算时,并不是时时刻刻都要用到多个CPU3、问:我已经成功地安装了MS3.1的Linux版本,串行的DMol3可以成功运行。但是运行并行的时候出错。机器是双Xeon5320(四核)服务器,rsh和rlogin均开启,RHEL4.6系统。其中h

3、osts.equiv的内容如下:localhostibm-c*****olemachines.LINUX的内容如下:localhost:8现在运行RunDMol3.sh时,脚本停在$MS_INSTALL_ROOT/MPICH/bin/mpirun$nolocal-np$nproc$MS_INSTALL_ROOT/DMol3/bin/dmol3_mpi.exe$rootname$DMOL3_DATA这一处,没法执行这一命令并行运算时,出现以下PIxxxx(x为数字)输出ibm-c*****ole0/home/www/MSI/MS3.1/DMol

4、3/bin/dmol3_mpi.exelocalhost3/home/www/MSI/MS3.1/DMol3/bin/dmol3_mpi.exe请问这是什么原因?谢谢!答:主要是rsh中到ibm-c*****ole的没有设置把/etc/hosts改为127.0.0.1localhost.localdomainlocalhostibm-c*****ole在后面加个ibm-c*****ole也希望对大家有帮助!4、问:在最后结果的dos图中,会显示不同电子spd的贡献,我想问的是,假设MS考虑的原子Mg的电子组态为2p63s2,那么最后的dos结

5、果中的s,p是不是就是2p,跟3s的贡献.比如更高能量的3p是否可能出现在dos中?如果可能的话,在这种情况下,如何区分2p和3p的贡献,谢谢.答:A、取决于你的餍势势里面没有3p电子,DOS怎么会有呢?自然,你的1p1s也不会出现在你的DOS中。B、我觉得原子没有d轨道但是计算出来的DOS图上有d轨道的贡献,这可能是电子跃迁所引起的,虽然按照教科书上的d轨道上没有电子,但是不排除有电子跃迁过去,但及时跃迁也应该只是很少的而且一般也都是这样。C、我考虑的是dos并非指电子出现的几率,而是能级的密度.3p构成导带能级不可能吗?没有d电子出现d的

6、贡献可以理解是跃迁过去,那是不是也不否认3p的可能?既然不可能有3p,怎么会有1s1p?毕竟一开始计算中已经做了近似?D、第一性原理计算高于费米面的能带本来就不怎么可靠的。现在,计算的带隙小于实验值,很大的原因就来源于价带计算不准。p能量高于s不太好理解这里有成键反键的因素p的反键是有可能小于s的成键的另外有时候原子电子组态没有d电子的时候计算结果也出现了d轨道估计是做轨道投影的问题。vasp就有这个问题,但是可以消除这个错误的。5、问:那位高手能够介绍一下MS中CASTEP的势能模型的适用范围?比如说LDA的(PWC,VWN),GGA的(P

7、W91,BP,PBE,BLYP,BOP,VWN-BP,PRBE,HCTH),能够简述一下其大致差别更好答:LDA局域密度近似(LDA):局域密度近似(LDA)是第一阶梯。它仅仅采用空间点r处的电子密度n(r)来决定那点交换-相关能密度的形式。交换-相关能密度由密度相同的均匀电子气完全确定。泛函的交换部分就准确的用均匀电子气的微分表达。各种不同的局域密度近似(LDA)仅仅是相关部分表示方法不同,所有现代应用的局域密度泛函都基于Ceperly和Alder`s在80年代对均匀电子气总能量的MonteCarlo模拟。广义梯度近似(GGA):GGA是J

8、acob阶梯的第二个台阶,将电子密度的梯度也作为一个独立的变量(

9、?n(r)

10、),在描述交换-相关能方面,梯度引入了非定域性。GGA泛函包含了两个主要的方向:一个称

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