materials-studio培训教程

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1、MaterialsStudio培训教程创腾科技有限公司初级班单位：华南师范大学2006.12创腾科技有限公司NeotridentTechnologyLimitedwww.neotrident.com华南师范大学目录MaterialsStudio快速入门教程⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯2Visualizer模块快速入门教程⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯11用第一性原理预测AlAs的晶格参数⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯36CO分子在Pd(110)表面的吸附⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯43Pd(110)面上的CO分子电荷密度变化⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯55模拟CO_Pd(1

2、10)体系的STM图⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯613使用DMol中的离域内坐标对固体进行几何优化⋯⋯⋯⋯⋯⋯64用LST/QST搜索过渡态⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯69气体在聚合体中扩散的测量⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯76聚合物与金属氧化物表面的相互作用⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯86计算共存相之间的界面张力⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯96运行简单的MesoDyn模拟⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯99使用粉末衍射图进行分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯108指标化粉末衍射图⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯117无机物的Rietveld精修⋯⋯⋯

3、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯125使用ReflexPlus来解析3-氯-反-苯乙烯酸的结构⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯133无机化合物FIN31的结构确定⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯1421创腾科技有限公司NeotridentTechnologyLimitedwww.neotrident.com华南师范大学MaterialsStudio快速入门教程该教程将介绍MaterialsStudio软件的基本功能，在这一部分，你将学到：1.生成Projects2.打开并且观察3D文档3.绘制苯甲酰胺分子4.观察并且处理研究表格文档5.处理分子晶体：尿素6.建造Alpha石英晶体7.建造多甲基

4、异丁烯酸盐8.保存Project并结束1.生成Projects(1).运行MaterialVisualizer从运行菜单中运行或者在桌面点击快捷方式。(2).生成Project生成名称为MyQuickstart的Project。2.打开并且观察3D文档(1).调整显示风格在3D结构上单击右键，并选择DisplayStyle。2创腾科技有限公司NeotridentTechnologyLimitedwww.neotrident.com华南师范大学右键菜单DisplayStyle对话框中的各选项的意义如下：Atom栏：DisplayStyle:Line：线状模型。Stick

5、：棍状模型。Ballandstick：球棍模型。CPK：球堆砌模型。Polyhedron：多面体堆积模型（晶体）。Lattice栏:Display:显示单个晶胞或者元胞。Range：显示在X、Y、Z方向上晶胞的数量。Lattice:显示晶胞边界的风格。在3D结构上单击右键并选择Lighting选项，该选项将指定加光情况：在此选项卡内可以设定三个光源，并改变光源的照射位置（照射位置用箭头显示）。3创腾科技有限公司NeotridentTechnologyLimitedwww.neotrident.com华南师范大学(2).改变3D结构的视图可以使用3DViewer工具栏上

6、的工具来改变3D视图。通过选择相应的工具并在3D结构上拖动来改变结构视图。Rotate:旋转结构视图。Zoom:向上或者右侧拖动可以增大所选结构的视图；向下或者向左侧拖动会缩小所选结构的视图。Translation:将结构沿着不同的方向平移。对于三键鼠标来说，左键执行所选操作，中键始终是平移操作，而右键则是旋转操作，同时按下左健和右键则会完成缩放操作。此外还可以将键盘和鼠标联用来完成上述操作。以下操作将改变3D结构的位置：FittoView:根据窗口的尺寸，为3D结构选择合适的大小。Recenter:将结构放置到窗口的中心，结构大小不变。ResetView:将结构放置

7、到窗口中原来的位置，并恢复原有大小。(3).选择对象的各种类型在3DView工具栏上选择3DViewerSelectionMode，并通过单击原子、键来选择相应的对象。该对象变为黄色表示已经被选中。通过鼠标的托拽操作可以选择一定区域内的所有对象，包括原子和键。在结构中的某个原子或键上双击鼠标可以选择整个结构。3.绘制苯甲酰胺分子化学家不得不每天处理大范围的小分子和中间体。快速生成该类分子对于每一个分子建模环境都是非常重要的。苯甲酰胺分子就是这样一种小分子，在下边我们将以该分子作为例子，进行研究工作。下面是要建造的苯甲酰胺结构：4创腾科技有限公司Neo