最新GEO数据库使用.ppt

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1、GEO数据库使用__________________________________________________GEOIntroduction__________________________________________________GEO:GSM(样本编号）,GLP（检测平台）,GSE（基因数据结果）___________________________________________________________________________________________________________________________________

2、_______________________________________________________________________________________________________________________LoadingGEOdataset__________________________________________________GSE41804_family__________________________________________________GSE41804_series_matrix________________

3、__________________________________基因表达的分析确定要分析的基因，列出该基因mRNA的NCBI标记号如NM_101523，有的基因有多个转录本，可能有多个mRNA标记号。在下载的GEO数据库family.soft表中搜索该基因的标记号确定该基因对应的基因芯片号。用该基因芯片号在GEO数据库series_matix表中搜索该芯片号对应的所有样本的荧光信号值即基因表达值。分析不同样本中该基因的表达差异。根据样本数据确定该基因的高表达组和低表达组，进行相应的数据分析。进行多个基因的表达相关性分析。________________________

4、__________________________Thankyouforyourattention!__________________________________________________