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《DB13_T2598-2017花生品种真实性与纯度鉴定SSR法.pdf》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、ICS67.060B22DB13河北省地方标准DB13/T2598—2017花生品种真实性与纯度鉴定SSR法2017-11-22发布2017-12-22实施河北省质量技术监督局发布DB13/T2598—2017前言本标准按照GB/T1.1-2009给出的规则起草。本标准由河北农业大学提出。本标准起草单位:河北农业大学。本标准主要起草人:杨鑫雷、刘立峰、崔顺立、郭丽果、陈焕英、穆国俊、李洪珍。IDB13/T2598—2017花生品种真实性与纯度鉴定SSR法1范围本标准规定了利用SSR标记对花生品种真实性与纯度进行鉴定的术语和定义、原理、试剂材料、操作程序、数据分析和
2、判定规则。本标准适用于利用SSR法对花生品种真实性与纯度鉴定的试验过程。2规范性引用文件下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。GB/T3543.2-1995农作物种子检验规程扦样GB/T3543.4-1995农作物种子检验规程发芽试验GB/T6682-2008分析实验室用水规格和试验方法3术语和定义下列术语和定义适用于本文件。3.1品种真实性(VarietalGenuineness)供检品种与文件记录(如标签等)是否相符。3.2品种纯度(Varie
3、talPurity)品种在特征特性方面典型一致的程度,用供检样品中本品种的种子数占样品种子总数的百分率表示。3.3简单重复序列SSR(SimpleSequenceRepeat)基因组中以几个核苷酸(一般为2个~6个)为重复单元的长达几十至几百个核苷酸的串联重复序列,又称微卫星标记。注:由于基本单元重复次数的不同,形成了SSR长度的多态性。3.4聚合酶链式反应PCR(PolymeraseChainReaction)一种用于在体外扩增DNA序列的技术程序。注:模板DNA经高温变性为单链,在DNA聚合酶和适宜温度下,两条引物分别与DNA模板两条链上的一段互补序列发生退火
4、,并在DNA聚合酶的催化下以四种dNTP(deoxy-ribonucleosidetriphosphate,脱氧核苷三磷酸)为底物,使退火引物延伸从而合成DNA。如此变性退火和合成DNA反复循环,使位于两段已知序列之间的DNA片段呈几何倍数扩增。1DB13/T2598—20173.5引物Primer结合在模板DNA上的互补短链,提供3'-OH末端作为DNA合成的起点,延伸合成模板DNA的互补链。3.6核心引物CorePrimerSSR标记分析优先选用多态性高、稳定性好,识别能力强的一套引物的引物。3.7标准样品StandardSample代表已知品种特征特性的育种
5、家种子作为标准样品。4原理花生基因组中存在着大量简单重复序列(SSR),由于SSR单元在不同基因型间重复次数不同,因此同一位点的SSR在不同品种间往往具有丰富的长度多态性。利用PCR技术扩增每个位点的简单重复序列,通过电泳分析其长度多态性,达到区别不同花生品种的目的。5试剂或材料警示:丙烯酰胺、甲叉双丙烯酰胺具神经毒性,配制时应注意防护。除非另有说明,使用分析纯试剂和重蒸馏水应符合GB/T6682规定的一级水。5.1三羟甲基氨基甲烷(Tris):分子式为C4H11NO3,CAS77-86-1。5.2氯化锂(LiCl):CAS7447-41-8。5.3乙二胺四乙酸二
6、钠盐(EDTA·Na2):分子式为C10H16N2O8Na2·2H2O,CAS60-00-4。5.4十二烷基硫酸钠(SDS):分子式为C12H25NaO4S,CAS151-21-3。5.5聚乙烯吡咯烷酮(PVP):分子式为(C6H9NO)41,CAS9003-39-8。5.6β-巯基乙醇:分子式为C2H6OS,CAS60-24-2。5.7酸酚(acidphenolpH4.3)。5.8异戊醇:分子式为C5H12O,CAS123-51-3。5.9Tris饱和酚(pH8.0)。5.10三氯甲烷:分子式为CHCl3,CAS67-66-3。5.11无水乙醇:分子式为C2H6
7、O,CAS64-17-5。5.12硫氰酸胍:分子式为CH5N3·CHNS,CAS593-84-0。5.13二水柠檬酸钠:分子式为C6H9Na3O9,CAS6132-04-3。2DB13/T2598—20175.14乙酸铵:分子式为C2H7NO2,CAS631-61-8。5.15十二烷基肌氨酸钠:分子式为C15H28NO3·Na,CAS137-16-6。5.16异丙醇:分子式为C3H8O,CAS67-63-0。5.17氯化钠:分子式为NaCl,CAS7647-14-5。5.18氢氧化钠:分子式为NaOH,CAS1310-73-2。5.19TaqDNA聚合酶:保存条件
8、为-20℃
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