生物信息学导论.doc

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1、生物信息学导论内容介绍生物信息学是随着计算机技术、网络技术以及分子生物学技术的大发展,和随着人类基因组计划的启动而兴起的一门新的交叉学科。它综合运用生物学、数学、物理学、信息科学以及计算机科学等诸多学科从事对生物信息的获取、加工、储存、分配、分析和解读,从而发现其中许多重大生物学规律,对生物医学和生物制药的发展有着极大的推动作用。本课程首先概括的介绍生物信息学产生的历史、现状及发展态势。然后着重介绍生物信息学基础知识,生物信息数据库的使用,生物信息工具的应用以及相关算法等方面的内容。主要包括生物信息学的概述、生物信息数据库、数据库的查询及搜索、序列的同源性比较、蛋白质序列及结

2、构信息分析、生物信息学与药物设计、相关生物信息学网站的介绍及一些生物信息学软件的应用。本课程旨在提高学生利用信息技术解决生物学领域内问题的能力,以便发掘和造就学生跨学科学习的本领,进而拓宽学生的知识面、培养学生从事创造性科学研究的兴趣。参考材料:1.《Bioinformatics-AnIntroduction》2ndEdition,JeremyRamsden,2009,Springer.2.《BioinformaticsForDummies》2ndEdition,Jean-MichelClaverie,CedricNotredame,2007,Wiley.Introducti

3、ontoBioinformaticsContents:Bioinformaticsisanewinterdisciplinewhichoriginallyarosewiththerapiddevelopmentofcomputertechnology,internettechnology,biotechnologyandthestartofthehumangenomeproject.Itcombinesbiology,mathematics,physics,informaticsandcomputersciencetoretrieve,process,archive,assi

4、gnandanalyzebiologicaldata,thustodiscoverbiologicallaws.Bioinformaticshasgreatlypromotedthedevelopmentofbiologicalmedicineandbiologicalpharmacy.Thiscoursewillfirstlyintroducethehistory,currentstatusandoutlookofbioinformatics.Then,basicknowledgeofbioinformatics,suchasbiologicaldatabases,appl

5、icationofbioinformaticsoftwaretoolsandalgorithmdevelopment,willbenarratedindetail.Thecoursecoversbasicbiologicalconceptions,searchinimportantbiologicaldatabases,DNA/proteinsequencecomparison/alignment,proteinstructurepredictionandanalysis,computer-aideddrugdesign,importantbioinformaticwebsi

6、tesandsoftwaretools.Thiscourseaimstoimprovestudents’abilityinsolvingbiologicalproblemswithcomputationalapproaches,bringupstudents’ideasofinterdisciplineanddevelopstudents’interestincreativescientificresearches.Literatures:1.《Bioinformatics-AnIntroduction》2ndEdition,JeremyRamsden,2009,Spring

7、er.2.《BioinformaticsForDummies》2ndEdition,Jean-MichelClaverie,CedricNotredame,2007,Wiley.

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