珠磨法提取酵母基因组.doc

珠磨法提取酵母基因组.doc

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1、利用海砂提取酵母基因组1、挑GS115单菌落接种于50mL三角瓶6mLYPD培养基中,摇两瓶。将30℃,200r/min,培养过夜(16~18h)的酵母细胞分别吸取1.5mL菌液放在1.5mLEP管中,共8管,12000r/min,5min,离心收集细胞;2、用无菌水将细胞悬浮(借助10uL枪头),洗细胞,12000r/min,5min,离心;再次用无菌水洗细胞,只洗表面,去上清;3、加入200uL(0.275g)海砂,200uL裂解液,200uL酚氯仿(25:24),将细胞悬浮(借助10uL枪头),然后涡旋震荡1min,放在冰上

2、1min,重复四次;4、12000r/min,5min,离心,吸取上清液(260uL),两管合一管,共4管,每管520uL,加入等体积的酚氯仿(酚265uL,氯仿255uL),颠倒混匀,去蛋白,12000r/min,5min,离心;5、吸取上清液(500uL),加入等体积的酚氯仿(酚255uL,氯仿245uL),颠倒混匀,去蛋白,12000r/min,5min,离心;6、吸取上清液(480uL),加入等体积的酚氯仿(酚245uL,氯仿235uL),颠倒混匀,去蛋白,12000r/min,5min,离心;7、吸取上清液(460uL)

3、,加入2倍体积(920uL)的无水乙醇,放在—80℃,30min;8、12000r/min,5min,离心,去上清,加入400uL体积的70%乙醇,用手弹起沉淀,洗涤,12000r/min,5min,离心,去上清,再次加入400uL体积的70%乙醇,只洗表面,去上清,将DNA自然晾干;9、用20uL的超纯水溶解DNA,加入1uLRNaseA,37℃,消化30min;10、取5uLDNA溶液,用1%琼脂糖凝胶跑电泳。试剂配方:1、1MTris-Hcl(pH8.0):配50mLTris碱:6.06g水:50mL用浓盐酸约2.1mL调p

4、H至8.0,2、0.5MEDTA(pH8.0):配50mLEDTA二钠盐:9.306g水:50mL用NaOH(分子量40g/mol)约1g,调pH至8.0注意:EDTA难溶,需调到pH8.0才能溶解,溶解时超声并加热3、TE缓冲液(pH8.0):配制500mL1MTris-Hcl(pH8.0):5mL0.5MEDTA(pH8.0):1mL水:494mL,调pH至8.04、提取基因组裂解液配方TritonX-100:2%SDS(W/V):1%Nacl:100mMTris.Hcl(pH:8.0):10mM配100mL裂解液:Trito

5、nX-100:2mLSDS:1gNacl(分子量58.44g/mol):0.5844gTris.Hcl(pH:8.0):1MTris.Hcl(pH:8.0)1mL

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