实验十一 DNA凝胶回收.ppt

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1、实验十一DNA凝胶回收一、实验原理通过一定的方法将琼脂糖凝胶上需要的目的DNA带回收下来,用于下游实验。琼脂糖凝胶电泳片断回收的常用方法1.柱回收试剂盒是目前最简单快速的回收方法,只需要将电泳凝胶中的产物条带切下,用溶解Buffer彻底溶解,上包埋有纯化填料的纯化柱,离心,再洗涤一次,离心后用洗脱缓冲液洗脱。全程不过10多分钟,得到的产物溶液可以直接用于后继实验。这个方法几乎不需要什么技巧就能得到稳定的结果,也是目前最多商品化试剂盒选择的方法。但是这个方法不适合用于大片断的回收。2.低熔点琼脂糖传统手工操作方法之一,低熔点琼脂糖制备凝

2、胶,电泳后切割目的条带,在TE溶液中65度保温融化,用传统的酚氯仿抽提,乙醇沉淀。这个方法现在用的人已经不多了。以前经费紧张,低熔点琼脂糖贵,比较经济方法就是常规琼脂糖电泳后,在目的条带前方挖槽,灌入低熔点琼脂糖,凝胶后再电泳一小会儿,等条带进入低熔点琼脂糖区域再切出来,这样就非常节约了。二、实验目的1.从含有目的基因片段凝胶块上回收DNA。2.回收目的基因片段为下步连接反应作准备仪器及耗材:天平、台式离心机、微量移液器及吸头、EP管。材料:含有目的基因酶切产物的凝胶块试剂:AxyPrepDNA凝胶回收试剂盒;无水乙醇;三、实验仪器、

3、材料和试剂四、实验步骤1.在紫外灯下切下含有目的DNA的琼脂糖凝胶,用纸巾吸尽凝胶表面液体并切碎。计算凝胶重量(提前记录1.5ml离心管重量),该重量作为一个凝胶体积(如100mg=100μl体积)。2.加入3倍凝胶体积的BufferDE-A,混合均匀后于75°C加热(低熔点琼脂糖凝胶于40°C加热),间断混合(每2-3min),直至凝胶块完全熔化(约6-8min)。*BufferDE-A为红色溶液。在熔化凝胶的过程中,可以帮助观察凝胶是否完全熔化。3.加0.5倍BufferDE-A体积的BufferDE-B,混合均匀。当分离的DNA

4、片段小于400bp时,需再加入1个凝胶体积的异丙醇。加BufferDE-B后混合物颜色变为黄色,充分混匀以保证形成均一的黄色溶液。4.吸取步骤3中的混合液,转移到DNA制备管(置于2ml(试剂盒内提供)离心管)中,12,000×g离心1min。弃滤液。5.将制备管置回2ml离心管,加500μlBufferW1,12,000×g离心30s,弃滤液。6.将制备管置回2ml离心管,加700μlBufferW2,12,000×g离心30s,弃滤液。以同样的方法再用700μlBufferW2洗涤一次12,000×g离心1min。确认在Buffe

5、rW2concentrate中已按试剂瓶上的指定体积加入无水乙醇。两次使用BufferW2冲洗能确保盐份被完全清除,消除对后续实验的影响。7.将制备管置回2ml离心管中,12,000×g离心1min。8.将制备管置于洁净的1.5ml离心管(试剂盒内提供)中,在制备膜中央加25-30μlEluent或去离子水,室温静置1min。12,000×g离心1min洗脱DNA。*将Eluent或去离子水加热至65℃将提高洗脱效率

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