浙江省水稻立枯丝核菌5.8S rDNA-ITS区间多样性-论文.pdf

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1、浙江农业学报ActaAgriculturaeZhefiangensis，2014，26(3)：702-707http：／／www．zjnyxb．cn邱海萍，毛雪琴，姜华，等．浙江省水稻立枯丝核菌5．8SrDNA—ITS区间多样性[J]．浙江农业学报，2014，26(3)：702-707．DOI：10．3969／j．issn．1004-1524．2014．03．28浙江省水稻立枯丝核菌5．8SrDNA—ITS区间多样性邱海萍，毛雪琴，姜华，王艳丽，孙国昌'(浙江大学农业与生物技术学院，浙江杭州310058；浙江省植物有害生物防控重点实

2、验室——省部共建国家重实验室培育基地，浙江省农业科学院植物保护与微生物研究所，浙江杭州310021)摘要：对浙江省82个水稻立枯丝核菌菌株及13个标准融合群菌株5．8SrDNA—ITS(ITS)区间测序和分析，结果表明，ITS在标准融合群菌株间的差异远大于AG1一IA融合群的水稻菌株间的差异，进化分析表明，ITS的差异可以有效甄别不同标准融合群菌株，但对AG1．IA融合群的水稻菌株区分能力非常有限。单倍型分析表明，这82个水稻菌株可以分为10个单倍型。田间菌株的单倍型多样性(Hd)为0．2087，核苷酸多样性为0．00033。其中单

3、倍型Hl为优势单倍型，占全部菌株的87．8％，而其他9个单倍型则各只有1株菌株。中性检验结果表明Tajima’SD测验值为一2．26012(P<0．01)，Fu和Li’SD测验值为一5．20827(P<0．02)，暗示浙江省水稻纹枯菌菌株显著偏离中性假说，在历史上可能出现过种群扩张，并存在很强的选择作用。关键词：立枯丝核菌；水稻；转录间隔区；序列测定；单倍型中图分类号：Q78文献标志码：A文章编号：1004—1524(2014)03-0702-06DiversityresearchonRhizoctoniasolaniisolate

4、dfromZhejiangProvinceusingsequenceanalysisof5．8SrDNA．ITSintervalQIUHai—ping，，MAOXue—qin，JIANGHua，WANGYan—li，SUNGuo—chang'(CollegeofAgricultureandBiotechnology，ZhejiangUniversity，Hangzhou310058，China；StataKeyLaboratonyBreedingBaseforZhejiangSustainablePestandDiseaseCont

5、rol，InstituteofPlantProtectionandMicrobiology，ZhefiangAcademyofAgriculturalSciences，Hangzhou310021，China)Abstract：Eighty-twoR．solanistrainsand13standardanastomosisgroupstrainswereusedinthesequenceanalysis0f5．8SrDNA-ITS(ITS)interva1．ThedifferencesinsequencesofITSinterva

6、lamonganastomosisgroupstrainsweremuchlargerthanthatamongtheAG1一IAstrains．PhylogeneticanalysisshowedthatthedifferencesinsequencesofITSintervalcouldefectivelydistinguishstrainsfromdifferentanastomosisgroups．Butwhenthestrainsbelongingtothesameanastomosisgroupwereconcerned

7、，theusageofthedifferencesinsequencesofITSintervalwasquitelimited．Haplotypeanalysisshowedthat82ricestrainscouldbedividedinto10haplotypes．Haplotypediversity(Hd)ofthesefieldisolateswas0．2087，andthetotalnucleotidediversitywas0．00033．H1wasthedominanthaplotype．accountingfor8

8、7．8％ofallstrains．whileeachoftheotherninehaplotypesonlycontainedonestrain．NeutraltestresultsshowedthatTajima'sDtestval