Pyrosequencing技术及其应用guangzhou.ppt

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1、Pyrosequencing™Technology-PyroMarkTMIDDNA分析系统JiabingCaoApplicationDepartmentGeneCompanyLtd关于BiotagePyrosequencing这项专利技术完全由Biotage公司拥有Biotage的前身即PyrosequencingAB成立于1997年,总部位于瑞典第三大城市Uppsala2003年并购另外两家公司后更名为BiotageAB公司通过直接销售部门及代理商已向全世界40多个国家提供了超过600套Pyrosequencing系统随着Pyrosequencing技术应用领域的不

2、断拓展,近两年来,其市场也呈现快速增长的趋势作为一家高技术公司,强大的技术支持队伍是我们引以为傲的资源超过30%的职员从事客户与技术支持工作ANewLightonGeneticAnalysis一种全新的基于酶级联反应的新型遗传定量分析技术一套完整的实验方案;诸多领域的广泛应用……挑战你的极限想象力Pyrosequencing遗传分析技术PyrosequencingTMtechnologyPPiATPlighttimeCGTTCCACCT相应位置的峰代表该种dNTP的掺入情况峰高与掺入的核苷酸数量成正比多余的dNTP在加入下一种dNTP前就被降解Pyrogram™Pyr

3、osequencing焦磷酸测序技术的特点唯一得到定量序列结果的技术极高的准确性Built-InQC重现性极佳,接近100%通用型技术平台功能多样,应用领域极广可以用于任何遗传多态性的分析甲基化研究的最佳平台高通量、低成本,快速临床微生物诊断手段实验设计灵活自动化程度高,操作简单AseasyasPCR,asreliableassequencing强大的技术支持ESGCTAGTAGAGC/CESGCTAGTAGAGT/TESGCTAGTAGAGC/TWhatare”InbuiltControls”?SincePyrosequencingshowspolymorphism

4、swithsequencecontext,youcanalwaystrustthevalidityofthedata.1分子的dNTP掺入,释放出1分子的PPi,生成1分子的ATP,产生单位强度的光信号TGGCCGGGTCACGAGGCCCTA...TripleDoubleSingleWhyPyrosequencingisquantitative?1.00.00.50.50.01.0Expected1.090.050.550.560.021.05Average0.02n.d.0.030.03n.d.0.03CVC/CC/GG/Gn=190Pyrosequencing:

5、QuantitativeAccuracyTestPyrosequencing:facility&convenience实验设计方便,使用AssayDesignSW方便快速设计反应的最佳引物。实验快速,96个样本,SNP反应10分钟左右,SQA测序反应1小时左右,2分钟完成数据结果分析。实验准确性好,重复性高:准确性接近99%重复性接近100%高通量,一次可以完成96个不同样本的反应和分析。自动化程度高,准备好PCR单链后,反应和结果分析软件自动进行,利于标准化。操作简单,方便学习和使用。AseasyasPCR,asreliableassequencingPyroseq

6、uencing的运用遗传变异方面WhatPyrosequencingcando inGeneticVariationAnalysisSNPAnalysisInsertionandDeletionMutationAnalysisAlleleFrenquencyDeterminationCpGMethylationEstimationGeneCopyNumberTranscriptionEstimationPyrosequencingTM技术运用于SNP与突变的研究SNPDiscoverySNPConfirmationAlleleFrequencySNPRelevance

7、SNPDiagnosticsVerifySNPastrueSNPFrequencyofSNPinpopulationsValidateSNPasmarkerforphenotypeUtilizationofSNPmarkers由于PyrosequencingTM技术可以通过光信号强度来定量,所以除了可以进行双等位点分析外,还可以用于三等位、四等位位点的分析,而且能准确判断纯合与杂合软件设计周到,具备强大的数据处理能力,可以通过一个反应来分析多个相邻位点准确性好,重现性高优势SNP位点在不同人群中的分布频率,是群体遗传学研究中的一项重要内容这些位点在正

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