DB32∕T 2561-2013 鹅坦布苏病毒的检测 RT-PCR 方法.pdf

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1、ICS65.020.99B22备案号:40447-2014DB32江苏省地方标准DB32/T2561-2013鹅坦布苏病毒的检测RT-PCR方法MethodofRT-PCRdetectingGooseTembusuVirus2013-12-20发布2014-01-20实施江苏省质量技术监督局发布DB32/T2561-2013前言为规范鹅坦布苏病毒分子生物学检测技术,提高鹅坦布苏病毒检测的灵敏度、稳定性、特异性,特制定本标准。本标准按GB/T1.1-2009《标准化工作导则第1部分:标准的结构和编写》编写。本标准的附录A为规范性附录

2、。本标准的附录B为规范性附录。本标准由江苏省农业科学院提出。本标准起草单位:江苏省农业科学院。本标准起草人:黄欣梅、李银、刘宇卓、赵冬敏、韩凯凯。DB32/T2561-2013鹅坦布苏病毒的检测RT-PCR方法1范围本标准规范了鹅坦布苏病毒分子生物学检测技术RT-PCR的所用引物序列、所涉及的样品范围、操作流程、反应条件等技术标准。本标准适用于检测鹅脾脏和病毒细胞培养液中鹅坦布苏病毒核酸。2规范性引用文件下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括

3、所有的修订单)适用于本文件。GB16548—2006病害动物和病害动物产品生物安全处理规程NY/T541—2002动物疫病实验室检验采样方法3方法原理聚合酶链式反应(PolymeraseChainReaction),简称PCR,是一种分子生物学技术,用于放大特定的DNA片段,可看作生物体外的特殊DNA复制。PCR技术以其快速、敏感和特异等优点在动物疫病检测中得到广泛应用,而且随着PCR技术的不断改进,这种针对病原核酸的诊断方法表现出更准确、灵敏和特异的特点。本标准选取了鹅坦布苏病毒非结构蛋白NS5基因保守区域,设计了一对特异性引物

4、,经过了PCR条件的优化、特异性试验、敏感性试验等,对鹅坦布苏病毒的鉴定具有很高的准确性。4仪器设备和主要试剂4.1仪器设备PCR仪,离心机,电泳槽,微量移液器,凝胶成像系统。4.2主要试剂TRIZOL,氯仿,异丙醇,无水乙醇,焦炭酸二乙酯(DEPC)处理的灭菌双蒸水,AMV反转录酶,5×AMVBuffer,10mmol/LdNTPs,随机引物,RNA酶抑制剂,25mmol/LMgCl2,10×EXTaqDNA聚合酶Buffer,EXTaqDNA聚合酶,2.5mmol/LdNTP,DNAMarkerDL-2000,琼脂糖。5引物上

5、游引物:5′-GCGGCTCAAGTGGGA-3′;下游引物:5′-CCTCGGTTGTTTGTTTCT-3′。6样品采集按照NY/T541-2002动物疫病实验室检验采样方法,病死或扑杀发病鹅,无菌采集脾脏、肝脏、脑、肺脏、肾脏等组织置于-20℃保存,最好用脾脏进行检测。按照GB16548-2006病害动物和病害动物产品生物安全处理规程,无害化处理病死鹅。1DB32/T2561-20137方法步骤7.1样品处理取病料0.5g~1g按1:10加入DEPC(diethypyrocarbonate焦碳酸二乙酯)水,置研钵中剪碎并研磨,

6、反复冻融研磨3次,将研磨好的组织以4℃12000r/min离心10min,取上清200µL备用。阴性对照:没有发病的正常鹅脾脏。阳性对照:鹅坦布苏病毒细胞培养物(见附录A)。7.2GTMUVRNA的提取取已处理的待检样品,以GTMUV病毒细胞培养物为阳性对照,以正常脾脏作为阴性对照,无菌水为空白对照,每管依次加入Trizol600µL,振荡混匀后,室温放置10min,加入氯仿200µL,剧烈振荡后,室温放置1min,4℃12000r/min,离心15min,取上层水相750µL,加入500µL异丙醇,混匀,-20℃放置15min,

7、4℃12000r/min,离心10min,去上清,缓缓加入75%乙醇1mL洗涤,4℃8000r/min离心5min,去上清,室温干燥20min,加入DEPC水10µL,使之充分溶解。7.3RT-PCR7.3.1反转录反应5×AMVBuffer4μL,10mmol/LdNTPs2μL,随机引物1μL,RNA酶抑制剂0.5μL,RNA模板10μL,AMV反转录酶1μL,H2O(DEPC处理)1.5μL,总体积为20μL,瞬间离心混匀,65℃反应15min,42℃孵育1h,95℃5min,同时设立阴性、阳性对照,产物于-20℃保存备用。

8、7.3.2PCR的反应按25µL体系进行,含25mmol/LMgCl21.5µL,灭菌水15.75µL,反转录产物2.5µL,10×EXTaqDNA聚合酶Buffer2.5µL,2.5mmol/LdNTP1.5µL,上、下游引物50pmol/µL各

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