蒙古家马和蒙古野马线粒体细胞色素b基因遗传多样性及系统进化分析.pdf

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1、·162·生理生化中国畜牧兽医2o14年第41卷第6期蒙古家马和蒙古野马线粒体细胞色素b基因遗传多样性及系统进化分析海棠,黄金龙,赵一萍,韩海格,萨如拉,芒来(内蒙古农业大学动物科学学院,内蒙古呼和浩特010018)摘要:通过对马的线粒体细胞色素b(Cytb)基因序列的遗传变异分析,来探讨蒙古家马、蒙古野马和驴之间的亲缘关系和遗传多样性。对各类马和驴样本mtDNACytb基因进行PCR扩增和测序,运用现代分子生物学软件进行数据处理。结果共检测到15个单倍型,9O个突变位点,单倍型多样性(Hd)为0.9356,核苷酸多样性(Pi)为0.01022,平均核苷酸

2、差异数(K)为8.966,各群体间的遗传多样性相差不大。系统发育树和NETwork图中每一分支都至少包含2个群体的信息。4个类型蒙古家马总体上具有较高的遗传多态性,蒙古家马与蒙古野马之间的亲缘关系较近,且出现数个分支,蒙古家马分布在各独立的进化支中,说明蒙古家马母系来源非常广泛或经过多次驯化。关键词:蒙古家马;蒙古野马;细胞色素b基因;遗传多样性;系统进化中图分类号:S813.1文献标识码:A文章编号:1671-7236(2014)06—0162—06马属于奇蹄目、马科、马属。马又分为家马和野蒙古家马的起源进化前人研究较多。研究发现蒙古马,蒙古家马是世界上

3、最古老的马种且分布最广的野马对蒙古家马的血统没有贡献,蒙古家马与蒙古大家畜之一,起源于西伯利亚东部的蒙古高原,蒙野马的亲缘关系较近,且蒙古家马具有多个祖先或古家马品种遗传性多样,特别是地方品种的优异种经过多次驯化(安丽萍等,2006a;陈建兴,2012)。通质特性。蒙古野马分布在位于蒙古西北的准格尔戈过分析比较蒙古家马、阿拉伯马和蒙古野马的X、Y壁上。近年蒙古野马的数量急剧减少,濒临灭绝,已和常染色体上的部分内含子序列发现,野马和家马被列入世界动物保护协会的保护行动计划中(安丽在系统发育树中聚在一起,说明二者关系较近(Lau萍等,2006a)。蒙古家马和蒙

4、古野马在历史上的政等,2009)。通过比较GenBank登录的所有具有地治、经济及战争中发挥过重要的作用(徐龙鑫,理信息的家马细胞色素b(Cytb)基因全序列,发现2013),但随着社会的快速发展、现代农业的大力推世界各地家马具有丰富的遗传多样性(Cieslak等,进,马的役用作用逐渐减少,马匹数量也急剧下降,2010)。蒙古野马的起源很古老,并不是家马的直系而马匹数量的减少会导致基因多样性的不断丧失,祖先(Goto等,2011)。本研究通过对24匹蒙古马、使其适应环境的能力下降,因此,应该重视对马遗传5匹野马和1头驴的Cytb基因进行PCR扩增和测资源的

5、保护。哺乳动物线粒体DNA基因组的结构序,采用现代生物学软件分析了蒙古家马和蒙古野稳定、简单,很少受到序列重排的影响,并呈母系遗马mtDNACytb基因的遗传多样性及起源进化,对传(李金莲等,2006a)。因此,线粒体DNA成为研其亲缘关系进行分子验证,构建UPGMA系统发育究物种进化的首选材料,现今已经广泛的应用于动树及NETwork图来分析蒙古家马和蒙古野马群体物群体遗传研究和系统发育分析中。蒙古家马和蒙间的进化起源关系,为探讨部分蒙古家马和蒙古野古野马的关系,动物学家尚有争议且研究较少,关于马群体的起源提供新的分子水平依据,并为蒙古家马及蒙古野马种质

6、资源的合理利用和保护提供科学收稿日期:2013-11-22依据和建议。作者简介:海棠(1988一),女,内蒙古人,硕士生,研究方向:分子1材料与方法遗传学与马科学。1.1材料24匹蒙古家马Cytb序列来自内蒙古通信作者:芒来,男,教授,博士生导师,研究方向:分子遗传学与马科学。农业大学马业科学创新团队课题组人员陈建兴等基金项目:国家科技部国际科技合作与交流专项(2012)已登录到GenBank上的序列,登录号为:(2012DFB30070);农业部公益性行业科研专项JQ282733一JQ282738、Jq282751一JQ282768,包括(2010030

7、75);内蒙古自治区科技厅重大项目(20091404);内蒙古农业大学2009年度科技创新团巴尔虎马(BH)、乌审马(wS)、锡尼河马(XN)、乌珠队支持计划(NDTD2010—12)。穆沁马(WZ)各6匹。5匹野马样本(YM1、YM2、中国畜牧兽医2O14年第41卷第6期生理生化·163·YM3、YM4、YM5)来自蒙古国,1头驴(YL)样本来限公司进行PCR产物测序。自内蒙古锡林郭勒黄旗。1.2.3数据分析使用DNAMAN7.0软件对1.2方法Cytb基因序列进行编辑、校对和多重序列比对。用1.2.1DNA提取按照北京天根生化科技有限公Mega5.05

8、软件计算了碱基组成,构建了UPGMA司提供的血样DNA提取试剂盒提

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