从线粒体细胞色素b基因推测雪鸡属系统进化关系

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1、从线粒体细胞色素b基因推测雪鸡属的系统进化关系指导教师:王金富教授研究生:龚一峰(分子遗传与动物育种)摘要用雪鸡属(Tetraoga!lus)及其5个近缘种属的线粒体细胞色素b(mtDNAcyto-b)基因并通过邻接(NJ)法构建了它们的系统进化树,以马鸡属(Crossoptilon)为外群(Outgroup),研究了雪鸡属在近缘属中的进化位置和关系,以及它的进化历程。结果表明:日本鹌鹑(CoturnixJaponica)}[1蓝胸鹌鹑(Coturnix@加em缸)的BP(bootstrappercentage)

2、值为92%,阿尔泰雪鸡∽口,胁fcw)和喜玛拉雅雪鸡(Zhima切,Pm/s)的BP值为100%,(阿尔泰雪鸡、喜玛拉雅雪鸡)和藏雪鸡(z肋BfⅡnw)的BP值为100%;石鸡属叫lectoris)、鹌鹑属(Coturn妫、雪鸡属和勺鸡属(Pucrasia)组成一个单系群:石鸡属和鹌鹑属的共同祖先与雪鸡属的祖先是姐妹群。各属总的平均遗传距离为O.112,雪鸡属的平均遗传距离为O.042。雪鸡属各种间的遗传距离依次为:阿尔泰雪鸡到喜玛拉雅雪鸡为0.012,喜玛拉雅雪鸡到藏雪鸡为O.067,阿尔泰雪鸡到藏雪鸡为O.0

3、68。结合雪鸡属各种间的遗传距离、分布特征和形态特征,推测藏雪鸡很可能是这三种雪鸡种中最为原始的种,并且在1.7百万年前,栖息在新疆西南部和西藏中西部的体色较深的藏雪鸡亚种tibetanus向西进入喜玛拉雅山区,逐步演变成喜玛拉雅雪鸡。后来,常出现在阿尔泰山区和东昆仑山的体色较浅的喜玛拉雅雪鸡亚种koslowi进化成了阿尔泰雪鸡。里海雪鸡(zc呷f旧和高加索雪鸡∽c口“c口jicⅪ)的采样受地域限制,所以本课题未涉及它们的系统进化地位。因此,要完全明白所有雪鸡种的分类地位则需要更为进一步的调查和研究。但同时,我们

4、能根据雪鸡属成员的分布范围和形态特征给出这样一个假说,藏雪鸡是雪鸡属所有成员中最为原始的种,高加索雪鸡起源于阿尔泰雪鸡,里海雪鸡则起源于喜玛拉雅雪鸡。关键词:雪鸡,细胞色素b基因,系统学,线粒体DNA论文类型:A(基础研究)VHIPhylogeneticRelationshipsofTetraogallusInferredFromSequencesofMitochondrialCytochromebGeneDissertationSupervisor:Prof.WangJin-fuStudent:GongYi—f

5、eng(MolecularInheritanceandAnimalBreeding)ABSTRACTAphylogenetictreeofNeighbor-joiningfNJ)distancematrixcalculatedwithKimura2-parameterwasperformedandCrossoptilonauritumwasusedasoutgrouptostudythephylogeneticpositionofthegenusTetraogallus,tounderstandthephylog

6、eneticrelationships,andtoinfertheevolutionaryprocessofTetraogallusNumbersnearthebrancheswerebootstrapprobability(BP)valuescomingfrom1000replications.Somebootstrapprobabilityvalueswere92%(Coturnixchinensis/Coturnixjaponica),100%(Tetraogallusaltaicus/Tetraogall

7、ushimalayensis),and100%((Tetraogallusaltaicus/Tetraogallushimalayensis)/Tetraogallustibetanus).Theoverallaveragedistancewas0.112,andaveragegeneticdistanceamongTetralgalluswas0.042.ThegeneraAlectoris,Coturnix,Tetrao-gallusandPucrasiaformedamonophyleticgroup.Th

8、etwogenera,AlectorisandCoturnix,shouldhaveacommonancestor,whichwasthesistertaxonoftheancestorofthegenusTetraogallus.TheinterspecificgeneticdistancesofthegenusTetraogalluswere0.012(T.altai

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