基因克隆及常见问题分析.pdf

基因克隆及常见问题分析.pdf

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1、TIANGENBIOTECH(BEIJING)CO.,LTD.内容概要DNA克隆技术简介DNA克隆实验流程DNA克隆的要素DNA克隆常见问题与应对策略800免费电话:800-990-6057DNA克隆的目的目的基因的序列测定及筛选增加目的基因的拷贝,降低后续实验的难度研究基因表达其他(如点突变、SNP等)800免费电话:800-990-6057克隆方法(以PCR产物克隆为例)TA克隆—蓝白斑筛选非定向连接克隆,连接效率高,操作简单,易于长期保存。可进行测序后对正确克隆扩大培养。800免费电话:800-990-60

2、57克隆方法(以PCR产物克隆为例)零背景克隆—无需蓝白斑筛选800免费电话:800-990-6057克隆方法(以PCR产物克隆为例)酶切连接克隆800免费电话:800-990-6057内容概要DNA克隆技术简介DNA克隆实验流程DNA克隆的要素DNA克隆常见问题与应对策略800免费电话:800-990-6057克隆实验的流程网上检索引物设计扩增产物与克隆载体PCR扩增纯化连接转化、DNA制备培养感受态E.coli制备生物信息学PCR或重组克隆测序检测质粒提取分析等酶切鉴定筛选800免费电话:800-990-6

3、057DNA克隆的要素•目的DNA片段•连接酶•克隆载体•感受态细胞800免费电话:800-990-6057TIANGEN六种PCR耐热聚合酶高扩增效率高扩增、高保真Long高保真Pfu长片段扩增Taq高扩增、高保真、高特异性高特异性800免费电话:800-990-6057不同DNA聚合酶PCR产物对比DNA聚合酶扩增片段末端适合克隆类型克隆前处理Taq零背景克隆平端化(平端化酶)粘末端HotMasterTaqTA克隆无零背景克隆无Pfu平末端TA克隆加A(加尾酶)TaqPlus粘末端+平末端零背景克隆平端化(平端化酶)L

4、ongTaq粘末端+平末端TA克隆加A(加尾酶)TaqPlatinum粘末端+平末端800免费电话:800-990-6057目的DNA片段纯化纯化原因:多余引物、多余dNTP、多余镁离子等,可能会影响后续连接反应,建议纯化。PCR特异性好(单带)PCR特异性差(多带)超薄/普通/大量DNA产物超薄琼脂糖凝胶DNA回纯化试剂盒收试剂盒寡核苷酸DNA产物纯化普通琼脂糖凝胶DNA回试剂盒收试剂盒N96DNA产物纯化试剂盒大量琼脂糖凝胶DNA回收试剂盒通用型DNA产物纯化试通用型琼脂糖凝胶DNA剂盒回收试剂盒800

5、免费电话:800-990-6057DNA纯化常见问题及对策•凝胶回收无产物或者回收率低•回收DNA质量不好800免费电话:800-990-6057DNA纯化常见问题及对策凝胶无回收产物或回收率低1、胶块太大,未全部溶解1)将胶块切小,增加溶胶时间或是溶胶2、起始量少液体积3、电泳缓冲液老化,PH值2)增加回收起始量升高3)使用新配制的缓冲液进行制胶和电泳4、使用去离子水进行洗脱4)最好用试剂盒配备的洗脱液进行洗脱5、洗脱缓冲液用量过少5)根据起始量使用合适体积的洗脱液6、洗脱缓冲液未加在离心柱6)应加在离心柱正中间,并放置

6、1~2分中心钟,再离心800免费电话:800-990-6057DNA纯化常见问题及对策回收DNA质量不好洗脱产物含有乙醇残留洗脱时硅胶膜上有漂洗液残留,会使洗脱产物中含有乙醇,影响下游操作。在洗脱前可通过再次离心或置于50℃烤箱中5-10分钟,彻底去除漂洗液。800免费电话:800-990-6057DNA克隆的要素•目的DNA片段•连接酶•克隆载体•感受态细胞800免费电话:800-990-6057T4DNA连接酶作用机理催化相邻DNA链的5’-P末端和3’-OH末端以磷酸二酯键结合的反应,需ATP作辅酶。本酶不仅可

7、以催化粘末端/平末端之间的DNA的连接,也可以催化DNA与RNA之间以及少数RNA之间的连接。反应条件4℃/16℃过夜;37℃1-2h800免费电话:800-990-6057DNA克隆的要素•目的DNA片段•连接酶•克隆载体•感受态细胞800免费电话:800-990-6057T载体•Amp抗性•19个酶切位点•多种试剂盒满足您的实验需求800免费电话:800-990-6057零背景载体•携带致死基因(无需抗性筛选)•13个酶切位点800免费电话:800-990-6057零背景载体—特点•零背景:使用携带致死限制酶基因,无

8、需蓝白斑筛选•高效:高效连接酶,阳性率>95%•通用:适合平末端/粘末端PCR产物•快速:室温连接5分钟(平末端)/10分钟(粘末端)•耐受力强:可插入6bp-10kb的片段800免费电话:800-990-6057零背景载体—实验例800免费电话:800-990-6057零背景载体—平末端连接混匀内容物

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