浙江省61株嗜肺军团菌血清1型菌株的SBT序列分型.pdf

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1、第42卷第3期卫生研究VoI_42No．35202013年5月JOURNALOFHYGIENERESEARCHMav2013文章编号：1000-8020(2013)03—0520-07·实验研究·浙江省61株嗜肺军团菌血清1型菌株的SBT序列分型朱水荣潘军航姚苹苹张俊彦梅玲玲张政浙江省疾病预防控制中心，杭州310051摘要：目的了解浙江省空调冷却塔／冷凝水中嗜肺军团菌血清l型(Lp1)菌株的序列分型特征。方法选取2005～2011年间浙江省l0个地区空调冷却塔／冷凝水中分离的61株Lpl型嗜肺军团菌菌株，采用欧盟军团茵感染

2、工作组(EWGLI)军团茵序列分型(SBT)方法，PCR扩增7对管家基因，对扩增产物进行测序、比对、递交，以获取等位基因号以及SBT序列型，运用DNAsp5．0软件对测序结果进行核苷酸多态性分析，采用SplitsTree及eBURST软件对分型结果进行聚类分析。结果61株Lpl型嗜肺军团菌可分为11种SBT序列型，其中5株(5／61)均为新发现序列型；ST-1型在10个地区(市)的冷却塔／冷凝水中均有分布，该序列型菌株占81．9％(50／61)。7个管家基因的核苷酸多态性(Pi)范围为0．01095(m)～0．05355(

3、pilE)。聚类分析显示，浙江省Lpl型菌株分属多个克隆系，但主要分属sT．1序列群、sT．154序列群和ST．149三大序列群，另有1株为不属于任何序列群的单体。结论聚类分析表明浙江省空调冷却塔／冷凝水中分离的Lpl型嗜肺军团茵存在遗传多样性，序列群分布与国内部分省份的结果相似，以ST一1序列型为主。关键词：嗜肺军团菌血清1型SBT序列分型空调冷却塔／冷凝水中图分类号：R123．1文献标识码：ASequence-basedtypingfor61Legionellapneumophilaserogroup1isolates

4、inZhejiangProvinceZHUShuirong，PANJunhang，YAOPingping，ZHANGJunyan，MEILingling，ZHANGZhengZhejiangCenterforDiseaseControlandPrevention，Hangzhou310051，ChinaAbstract：ObjectiveToanalyzethesequencecharacteristicsoftheserogroup1Legionellapneumophila(Lp1)strainsisolatedfro

5、mthecoolingtowerwaterinZhejiangprovincebysequence—basedtyping(SBT)．Methods61strainsofLplisolatedfromcoolingtowerwaterintencitiesofZhejiangProvincefrom2005to2011weregenotypedbySBTmethod．ThenucleotidepolymorphismofthesequencingresultswasanalyzedbyDnaSP5．0，andtheSBTr

6、esultswereclusteranalyzedusingSplitsTreeandeBURSTsoftware．ResultsAll61isolatesofLplwereresolvedinto11STs，and5newSTsweref0undinthisstudy．TheSTwiththelargestnumberofisolateswasST1(n=50)，andtheseST一1strainswerefoundin10cities．Thenucleotidepolymorphism(Pi)oftheseseven

7、housekeepinggenesrangedfrom0．01095(m／p)to0．05355(pilE)．TheSTsoftheLplisolateswereclusteredtofourclonalcomplexes(CC)，andST一1，ST-149，ST-154werethethreemainclonalcomplexes(CC)．ConclusionGeneticdiversitywasshownintheserogroup1Legionellapneumophilastrainsisolatedfromco

8、olingtowerwater作者简介：朱水荣，女，副主任技师，研究方向：微生物检测，E-mail：shrzhu@126COm第3期朱水荣，等．浙江省61株嗜肺军团菌血清1型菌株的SBT序列分型521inZhejiangProvince．Keywords：Legionellapneumophilaser