黄瓜黑色果刺基因染色体定位及候选基因分析.pdf

《黄瓜黑色果刺基因染色体定位及候选基因分析.pdf》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在行业资料-天天文库。

1、中国农业科学2014，47(1)：122—132SeientiaAgriculturaSinicadoi：10．3864~．issn．0578-1752．2014．01．013黄瓜黑色果刺基因染色体定位及候选基因分析刘书林，顾兴芳，苗晗，王烨17YiqunWeng，ToddCWehner，张圣平(中国农业科学院蔬菜花卉研究所，北京100081；USDAARSVegetableCropsResearchUnit，HorticultureDepartment，UniversityofWisconsin，Madison，WI53706，USA；DepartmentofH

2、orticultureScience，NorthCarolinaStateUniversity，Raleigh，NC27695—7609，USA)摘要：【目的】黄瓜作为重要的果莱类蔬菜，果实品质一直是黄瓜育种研究的重点果实品质包括内在品质和外观品质，其中外观品质对黄瓜的商品性具有重要影响。果刺颜色作为黄瓜重要的品质性状之一，对其进行遗传分析和基因定位将有助于了解果刺颜色遗传的分子机理，为黄瓜果实性状改良提供理论依据和技术支撑，同时也可为刺色基因的精细定位及克隆奠定基础。【方法】研究利用黄瓜白色果刺自交系GY14(P)和黑色果刺自交系NC76(P：)为亲本构建遗传群

3、体，进行黄瓜果刺颜色的遗传分析以F分离群体为试材，应用分离群体分组分析法(BSA)和2112对SSR5I物进行SSR分析，结合9930黄瓜全基因组序列信息和100份核心种质重测序结果开发新标记，对初定位区域进行标记加密采用JoinMap4．0作图软件和Maplnspect软件构建连锁群并完成连锁群与染色体的对应，实现黄瓜黑色果刺性状的基因定位。运用生物信息学，在定位区域进行候选基因分析。利用包含156个株系的重组自交系(RILs)群体，对黑色果刺基因紧密连锁的两侧翼分子标记进行验证，确定标记用于分子标记辅助选择(MAS)育种的准确性。【结果】研究表明，黄瓜自交系N

4、C76的黑色果刺符合质量性状遗传特点，由显性单基因控制，黑色对白色为显性。初步定位筛选获得了与基因连锁的8对SSR弓l物，将定位于黄瓜4号染色体(Chr．4)上，最近的连锁标记为SSR22231，遗传距离为10．8cM；根据初定位区域的序列信息，设计合成了新的SSRg『物212对和Indelgl物25对，利用这些】物对双亲和F群体DNA进行分析，最终构建了一个包含14个SSR标记和1个InDe1标记的分子标记连锁群，获得与连锁的两侧翼标记SSRB一181和SSRB一130，遗传距离分别为2．0ci和1．6cM，该区段物理距离为422．1kb，有6O个预测候选基因，

5、推测Csa4G003095和Csa4G001690是与黑色果刺形成相关性较大的候选基因。与紧密连锁的两侧翼标记用于MAS育种的准确率分别为96．8％和96．2％，其中SSRB一181对黑色果刺植株鉴定的准确率达到100％，将在MAS育种发挥重要作用。【结论】黄瓜自交系NC76的黑色果刺性状由显性单基因控制，该基因位于Chr．4上422．1kb范围内，两侧翼标记为SSRB-181和SSRB-130，遗传距离为3．6cM本研究结果为黑色果刺基因的精细定位和克隆及MAS育种奠定了良好基础。关键词：黄瓜；黑色果刺；染色体定位；SSR标记；候选基因MolecularMapp

6、ingandCandidateGeneAnalysisofBlackFruit、00—0，0·‘、DIneeneInGUCUmber(UCmissativusL．)LIUShu—lin，GUXing-fang，MIAOHan，WANGYe，YiqunWENG，ToddCWehner，ZHANGSheng—ping(InstituteofVegetablesandFlowersofChineseAcademyofAgriculturalSciences,Beijing100081；USDA-ARSVegetableCropsResearchUnit,Horticul

7、tureDepartmen~UniversityofWisconsin,Madison，WI5370~USA；DepartmentofHorticultureScience,NorthCarolinaStateUniversity,Raleigh，NC27695．7609,USA)收稿日期：2013-05．03；接受日期：2013．08．09基金项目：国家“863”计划课题(2012AA100101)、国家现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS一25)、中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(1610032011011)、农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验

8、室资助联系