黄瓜（Cucumis sativus L.）果瘤基因Tu的精细定位-论文.pdf

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1、第32卷第3期上海交通大学学报(农业科学版)Vo1．32No．32014年6月JOURNALOFSHANGHAIJIAOTONGUNIVERSITY(AGRICULTURALSCIENCE)Jun．2O14文章编号：1671～9964(2014)030069—06DOI：10．3969／J．ISSN．1671—9964．2014．03．011黄瓜，Z·SSZ·SL．)果瘤基因Tu的精细定位杨绪勤●张微微，任国良，何欢乐，潘俊松，蔡润(1．上海交通大学农业与生物学院，上海200240；2．中国科学院辰山植物园上海辰山植物研究

2、中心，上海201602)摘要：黄瓜果实果瘤性状是非常重要的农艺性状，以黄瓜(CucumissativusL．)华北有瘤品系$52(P)和欧洲无瘤品系S06(P2)为亲本，构建826株F2(S06×$52)群体为试验材料，对黄瓜果瘤基因进行精细定位研究。田间调查和遗传分析发现F。群体的果实表现型为有果瘤与无果瘤，卡~-dt(x：0．583~3．84)检验表明其分离比符合3：1，表明黄瓜果瘤性状是单基因控制的显性性状。早期研究中基因被初步位于第5染色体的标记SSR16203和CSC933之间，本研究利用公布的黄瓜基因组序列在这

3、两标记之间设计了100对SSR引物，通过分析在两亲本的多态性，最后筛选得到4对SSR多态性标记。然后利用SSR16203和C—SC933标记和这4个多态性引物对826株F群体进行进一步交换单株分析，最后将基因定位于两翼标记SSR7和SSR18之间，剩余的交换单株分别为11株、16株，物理距离为263kb。经过FGENESH基因预测软件(http：／／www．softberry．corn)分析，该区间仅含有候选基因31个。本研究为进一步果瘤基因的最后克隆提供良好的研究基础。关键词：黄瓜；果瘤基因；精细定位；SSR标记中图分类

4、号：$642．2文献标识码：AFineMappingoftheWartyFruitGeneTuinOucumber(CucumissativusL．)YANGXu—qin，ZHANGWei—wei，RENGuo—liang，HEHuan—le，PANJun—song，CAIRun(1．SchoolofAgricultureandBiology，ShanghaiJiaotongUniversity，Shanghai200240，China~2．ShanghaiChenshanPlantScienceResearchCente

5、r，ChineseAcademyofSciences／ChenshanBotanica1Garden，Shanghai201602，China)Abstract：WartyfruittraitiSoneofthemostimportantexternalqualitytraitsincucumberthatisrelatedtothemarketvalueofthiscrop．AF2populationincluding826individualswerederivedfromthecrossingofwartyfruit

6、line$52(P1)fromnorthern-Chinaandnon-wartyfruitlineS06(P2)fromEurope．TheF2populationwereusedasmaterialstofinemappingofwartyfruitgeneTuincucumber．WefoundthatthisF2populationcouldbedividedintotwotypes，i．e．，wartyfruitandno—wartyfruitbyfieldinvestigation．value(Y一0．583~

7、3．84)oftheF2populationwasconsistentwitharatioof3wartyfruits：1smoothfruit，whichshowedonesingledominantgenecontrolsthewartyfruittrait．Inpreviousreport，theTugenewaspreliminarilymappedbetweentheCO—dominantSSRmarkerSSR16203andtheSCARmarkerCSC933on—收稿Et期：2013—01—13基金项目：

8、国家“973”课题(2012CBl13900)；国家自然科学基金(31271291)作者简介：杨绪勤(1988一)，男，博士生，研究方向：作物遗传育种，E-mail：xuqin800715@163．corn；蔡润(1955一)为本文通讯作者，男，教授，博士生导师，研究方向：植物分子遗传，E-mail：c