高分辨率熔解曲线方法在指导华法林使用起始剂量基因分型中的应用及临床各种基因分型方法的比较.pdf

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1、生堡心血管病杂志2012年6月第40卷第6期ChinJCardio1．June2012。Vo1．40No．6·477·．临床研究．高分辨率熔解曲线方法在指导华法林使用起始剂量基因分型中的应用及临床各种基因分型方法的比较崔广林丁虎徐宇军陈琛汪道文【摘要】目的探讨高分辨率熔解曲线(highresolutionmelting，HRM)方法对需接受华法林治疗患者进行CYP2C93(1075A／C，rs1057910)和VKORC1(-1639A／G，rs9923231)基因分型和估计华法林起始剂量的可行性，同时比较不同基因分型方法的优缺点和使用价值。方法建立

2、检测CYP2C93(1075A／C，rs1057910)和VKORC1(一1639A／G，m9923231)两个多态性位点基因型的HRM方法，在接受华法林治疗的100例患者中进行基因型的检测与分析，并与传统的PCR一限制性片段长度多态性(PCR—RFLP)，TaqMan探针法及DNA测序法相比较。结果3种方法检测CYP2C9$3(1075A／C，~1057910)和VKORC1(一1639A／G，~9923231)的基因型完全一致，与DNA测序法相符合。而HRM方法更简单、经济、快速，临床应用的可行性高。100份临床标本的检测结果显示VKORC1—1

3、639AA、AG、GG3种基因型分别有73(73％)、23(23％)和4例(4％)；CYP2C91075AA、AC、CC3种基因型分别有94(94％)、6(6％)和0例。敏感性和特异性分析结果发现HRM方法检测这两种突变的敏感性和特异性均为100％。结论HRM的方法能有效的检测CYP2C93(1075A／C；rs1057910)和VKORC1(一1639A／G；rs9923231)基因多态性且与其他方法相比临床操作的可行性高。【关键词】华法林；多态性，限制性片段长度；高分辨率熔解曲线Developmentofthehighresolutionmelt

4、ingmethodforgenotypingCYP2C93(1075A／C，rsl057910)andVKORC1(．1639A／G．rs9923231)GEGuang．1in，D，^，UYu-jun，删Chen，ⅣGDao—welkDepartmentofCardiology，InstituteofHypertension，TongjiHospital，TongiiMedicalCollege．HuazhongUniversityofScienceandTechnology．Wuhan43oo3oChinaCorrespondingauthor：Ⅳ

5、GDao—wen，Email：dwwang@time．eca【Abstract】objectiveToestablishthehigh—resolutionmehingcurve(HRM)approachforgenotypingCYP2C93(1075A／C，rs1057910)andVKORC1(一1639A／G，rs9923231)andexploreitsvalueonestimationoftheWarfarininitialdoseincomparisonwithva~oustraditionalgenotypingmethods．Met

6、hodsCYP2C93(1075A／C，rs1057910)andVKORC1(一1639A／G，rs9923231)genotypingwasdetectedin100patientsreceivingWarfarintherapybythenewlydevelopedHRMmethodandtraditionalgenotypingmethodsincludingPCR—restrictionfragmentlengthpolymorphism(PCR—RFLP)，TaqManprobeandDNAsequencing．ResultsTheres

7、ultsofthegenotypesobtainedfromabovementionedmethodstodetectCYP2C93(1075A／C．rs1057910)andVKORC1(一1639A／G，rs9923231)weresimilarandconsistent．TheHRMmethodissimpler．moreeconomical，andfastercomparedtothetraditionalmethods．ThefrequenciesoftheVKORC1—1639AA．AG．GGgenotypesfromthese100cl

8、inicalsampleswere73(73％)，23(23％)，4(4％)，respectively；Fr