基于IPA分析自噬对大鼠肝再生中树突状细胞的调节作用.pdf

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1、蝮付Hereditas(Beijino)2015年3月，37(3)：276-282www．chinagene．cn研究报告基于IPA分析自噬对大鼠肝再生中树突状细胞的调节作用王棋文1,2,3，靳伟1,2,3，常翠芳1,2,3，徐存拴1,2,31．河南师范大学，河南省生物工程重点实验室，新乡453007；2．河南师范大学，河南省．科技部共建细胞分化调控国家重点实验室培育基地，新乡453007；3．河南师范大学生命科学学院，新乡453007摘要：为探讨自噬对大鼠肝再生中树突状细胞(Dendriticcells。DCs)~调节作用，文章通过Perc

2、oll密度梯度离心结合免疫磁珠分选分离大鼠DCs，RatGenome2302．0芯片检测大鼠肝再生中自噬相关基因表达变化，利用IPA等欲件分析自噬在DCs中的生理活动。结果表明，LC3、BECN1、ATG7和SQSTM1等关键基因在部分肝切除后不同恢复时间段有明显表达变化；芯片中对应的自噬相关基因为593个，其中210个基因发生了有意义的变化。比较分析自噬生理活动情况，发现自噬在再生早期和晚期阶段增强，增殖期减弱。与自噬相关的生理活动主要有RNA表达、RNA转录细胞分化和增殖，其中涉及的信号通路主要有PPARct／RXRct激活、急性期反应、

3、TREM1信号通路、IL．6信号通路、IL．8信号通路和IL．1信号通路等，它们在肝再生阶段发生了不同程度的上调或下调。Cluster分析还发现，P53和AMPK信号参与调控DCs的自噬活动，在肝再生早期主要是AMPK信号，在肝再生末期P53和AMPK信号共同参与自噬的调节。以上研究结果说明DCs自噬可能在肝再生早期激活细胞免疫反应和后期清除DCs等方面发挥着重要作用。关键词：肝再生；自噬；树突状细胞；RatGenome2302．0芯片；IPARegulationofautophagyondendriticcellsduringratlive

4、rregenera-tionbyIPAQiwenWang，，WeiJin1,2,3，CuifangChang，，CunshuanXu，，1．KeyLaboragoryforBtoengineering．HenanNormalUniversity,Xinxiang45300LChina；2．Co；-曲nstruc'tionKeyLaboratory厂。rCe11DifferentiationandRegulation，HenanNormalUniversity,Xinxiang453007,China3．CollegeofLlyeScience

5、，HenanNormalUniversity,Xinxiang453007,ChinaAbstract：Tounderstandthemechanismunderlyingautophagyinregulatingdendriticcellsduringratliverrege—neration，weusedthemethodofpercolldensitygradientcentrifugationcombinedwithimmunomagneticbeadtoiso—latedendriticcells，theRatGenome2302．

6、0Arraytodeterminetheexpressionchangesofautophagy—relatedgenes，andIngenuityPathwayAnalysis9．0(IPA)todeterminetheautophagyactivities．TheresultsindicatedthatLC3，收稿日期：2O14-11-13：修回日期：2015-01-12基金项目：河南省重大科技攻关项目(编号：111100910600)，河南师范大学博士启动课题(编号：qd14175)和河南师范大学青年科学基金项目资助作者简介：玉棋文，博

7、士研究生，研究方向：肝再生的分子机理。E．mail：wangqiwen@htu．edu．el通讯作者：存拴，博士，教授，博士生导师，研究方向：肝再生的分子机理。E．mail：XUCS@x263．netDOI：10．1，j．yczz．14．391网络出版时间：2015-1．2815：17：44URL：http：／／www．cnki．net／kcms／detail／11．1913．R．20150128．1517．003．html第3期王棋文等：基于IPA分析自噬对大鼠肝再生中树突状细胞的调节作用277BECN1，ATG7andSQSTM1gene

8、shadsignificantexpressionchangesduringratliverregeneration．Therewere593genesrelate