2010—2013年浙江省猪流行性腹泻病毒临床检测及PEDV-S基因型分析-论文.pdf

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1、浙江农业学报ActaAgriculmraeZhejiangensis，2014，26(3)：581—587http：／／www．zjnyxb．cn杜晓莉，王一成，吴润，等．2010-2013年浙江省猪流行性腹泻病毒临床检测及PEDV—S基因型分析[J]．浙江农业学报，2014，26(3)：581—587．DOI：10．3969／j．issn．1004—1524．2014．03．0820102013年浙江省猪流行性腹泻病毒临床检测及PEDV—S基因型分析杜晓莉，王一成’，吴润，徐丽华，袁秀芳，李军星，

2、周晓丽，(甘肃农业大学动物医学学院，甘肃兰州73000；浙江省农业科学院畜牧兽医研究所，浙江杭州310021；3南京农业大学动物医学院，江苏南京210095)摘要：2010年以来，全旧大部分地区暴发新生仔猪严重流行性腹泻，给养猪业造成巨大经济损失。为分析猪流行性腹泻病毒(PEDV)在浙江省的流行和遗传变异情况，对2010-2013年收集的临床腹泻样品，以针对PEDV—S基因N端序列的RT—PCR检测病原，并测序其中的41份样品的扩增序列，分析PEDV—S1基因型变异情况。临床检测结果表明：PEDV临

3、床检出率由2010年的42．86％提高到2013年的70％以上，并且浙江省各地的检出率都在50％以上；一年中7至8月份检出率明显降低。PEDV—S1基因N端序列分析结果表明，临床检测株的s1基因与传统毒株PEDVcV777的s基因序列及中国最早检测到的基因序列亲缘关系较远，可能浙江省PEDV的流行株可能属于一个新的基因型。同时研究结果提示PEDV—S基因的变异可能是现有CV777毒株疫苗免疫保护力不佳的原因。关键词：猪流行性腹泻；S1基因；遗传变异中图分类号：S855．3文献标志码：A文章编号：10

4、04—1524(2014)03-0581-07Genotypingandclinicaldetectionofporcineepidemicdiarrheavirusduring2010——2013inZhejiangProvinceDUXiao．1i，WANGYi—cheng’，WURun，XULi．hua。，YUANXiu—fang，LIJun．xing，ZHOUXiao—li，(CollegeofVeterinaryMedicine，C．ansuAgriculturalUnwe~ity，Lan

5、zhou730070，China；InstituteofAnimalHusbandryandVeterinarian，ZhejiangAcademyofAgriculturalSciences，Hangzhou310021，China；CollegeVeterinaryMedicine，NanjingAgriculturalUniversity，Nanjing210000，China．)Abstract：Since2010，porcineepidemicdiarrheainnewbornpiglet

6、sseriouslyoutbrokeinmostpartsofChinaandcausedhugeeconomiclossestothepigindust~．Fortheanalysisofepidemicandgeneticvariationofporcineepidemicdiarrheavirus(PEDV)inZhejiangProvince，PEDVinclinicalsamplescollectedduring2010—2013wasdetectedbyRT—PCRbasedonN—te

7、rminalofSgene，andfragmentsof41sequenceswereanalyzedforvariationofS1gene．TheresultsshowedthatthePEDVclinicaldetectionrateincreasedfrom42．86％in2010toover70％in2013．ThedetectionratewassignificantlylowerinJulyandAugustandwasmorethan50％acrossZhejiangprovince

8、．SequencinganalysisshowedthattheSgeneofclinicaldetectedstrainswereheterogenouswiththatofPEDVCv777．indicatingthatthecurrentepidemicstrainprobablymakesanewgenotypeandthemutationofPEDV一收稿日期：2013-11-28基金项目：浙江省“三农六方”科技协作项目(2012R22A60C01)作者简介