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《2010—2013年浙江省猪流行性腹泻病毒临床检测及PEDV-S基因型分析-论文.pdf》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在应用文档-天天文库。
1、浙江农业学报ActaAgriculmraeZhejiangensis,2014,26(3):581—587http://www.zjnyxb.cn杜晓莉,王一成,吴润,等.2010-2013年浙江省猪流行性腹泻病毒临床检测及PEDV—S基因型分析[J].浙江农业学报,2014,26(3):581—587.DOI:10.3969/j.issn.1004—1524.2014.03.0820102013年浙江省猪流行性腹泻病毒临床检测及PEDV—S基因型分析杜晓莉,王一成’,吴润,徐丽华,袁秀芳,李军星,
2、周晓丽,(甘肃农业大学动物医学学院,甘肃兰州73000;浙江省农业科学院畜牧兽医研究所,浙江杭州310021;3南京农业大学动物医学院,江苏南京210095)摘要:2010年以来,全旧大部分地区暴发新生仔猪严重流行性腹泻,给养猪业造成巨大经济损失。为分析猪流行性腹泻病毒(PEDV)在浙江省的流行和遗传变异情况,对2010-2013年收集的临床腹泻样品,以针对PEDV—S基因N端序列的RT—PCR检测病原,并测序其中的41份样品的扩增序列,分析PEDV—S1基因型变异情况。临床检测结果表明:PEDV临
3、床检出率由2010年的42.86%提高到2013年的70%以上,并且浙江省各地的检出率都在50%以上;一年中7至8月份检出率明显降低。PEDV—S1基因N端序列分析结果表明,临床检测株的s1基因与传统毒株PEDVcV777的s基因序列及中国最早检测到的基因序列亲缘关系较远,可能浙江省PEDV的流行株可能属于一个新的基因型。同时研究结果提示PEDV—S基因的变异可能是现有CV777毒株疫苗免疫保护力不佳的原因。关键词:猪流行性腹泻;S1基因;遗传变异中图分类号:S855.3文献标志码:A文章编号:10
4、04—1524(2014)03-0581-07Genotypingandclinicaldetectionofporcineepidemicdiarrheavirusduring2010——2013inZhejiangProvinceDUXiao.1i,WANGYi—cheng’,WURun,XULi.hua。,YUANXiu—fang,LIJun.xing,ZHOUXiao—li,(CollegeofVeterinaryMedicine,C.ansuAgriculturalUnwe~ity,Lan
5、zhou730070,China;InstituteofAnimalHusbandryandVeterinarian,ZhejiangAcademyofAgriculturalSciences,Hangzhou310021,China;CollegeVeterinaryMedicine,NanjingAgriculturalUniversity,Nanjing210000,China.)Abstract:Since2010,porcineepidemicdiarrheainnewbornpiglet
6、sseriouslyoutbrokeinmostpartsofChinaandcausedhugeeconomiclossestothepigindust~.Fortheanalysisofepidemicandgeneticvariationofporcineepidemicdiarrheavirus(PEDV)inZhejiangProvince,PEDVinclinicalsamplescollectedduring2010—2013wasdetectedbyRT—PCRbasedonN—te
7、rminalofSgene,andfragmentsof41sequenceswereanalyzedforvariationofS1gene.TheresultsshowedthatthePEDVclinicaldetectionrateincreasedfrom42.86%in2010toover70%in2013.ThedetectionratewassignificantlylowerinJulyandAugustandwasmorethan50%acrossZhejiangprovince
8、.SequencinganalysisshowedthattheSgeneofclinicaldetectedstrainswereheterogenouswiththatofPEDVCv777.indicatingthatthecurrentepidemicstrainprobablymakesanewgenotypeandthemutationofPEDV一收稿日期:2013-11-28基金项目:浙江省“三农六方”科技协作项目(2012R22A60C01)作者简介
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