2012年上海市虹口区麻疹流行株基因特征分析.pdf

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1、中华流行病学杂志2014年4月第35卷第4期ChinJEpidemiol，April2014，Vo1．35，No．4·429··监IJ·2012年上海市虹口区麻疹流行株基因特征分析李淑华汤显钱晓华袁政安李崇山杨彦基于晓楠龚向真【摘要】目的鉴定2012年上海市虹口区麻疹流行株基因型，了解2000-2012年上海市麻疹流行株基因特性。方法采集疑似麻疹病例咽拭子标本，使用Vero—SLAM细胞分离麻疹病毒，使用RT-PCR扩增分离培养阳性病毒N基因羧基末端450bp片段并测序，与GenBank中的部分流行株构建系统进化树，分析麻疹病毒基因型，同时进行流行病学调查。结果34份

2、咽拭子标本中分离到麻疹病毒7株，进化树分析显示，6株为H1基因型，1株为D8基因型。流行病学调查显示，D8基因型为上海自2000年开展病毒监测以来的首次外来输入病毒。结论2012年虹口区麻疹分离株与历年上海市麻疹流行株属于同一基因型，Hla亚型为优势流行株，首次出现D8基因型，为外来输入病毒。【关键词】麻疹病毒；输入病例；D8基因型GeneticcharacterizationoftheisolatesofmeaslesvirusesinHongkoudistrictofShanghai，Chinain2012LiShuhua，TangXian，QianXiaohua

3、，YuanZheng’an，LiChongshan，YangYa，YuXiaonan，Xiangzhen．1HongkouDistrictCenterforDiseaseControlandPreyentionofShanghai．Shanghai200082，China；2ShanghaiMunicipalCenterforDiseaseControfandPreventionCorrespondingauthor：，Xiangzhen，Emai1：hkshequ@163．comThisWOrkwassupposedbygrantsfromtheShanghaiMu

4、nicipaZHealthandFamilyPlanningCommission(No．20114067)andtheExcellentAcademicLeadersofShanghai尸l曲licHealth(No．GwDTf01225)．【Abstract】ObjectiveToascertainthegenotypeofmeaslesvirusesisolatedin2012andgeneticcharacterizationofmeaslesvirusesinHongkoudistrictofShanghaiduring2000—2012．MethodsMea

5、slesviruswasisolatedfromthroatswabspecimenscollectedfromsuspectedmeaslescasesand450bpfragmentofCterminusonnucleprotein(N)genewasamplifiedbyRT．PCR．SequenceanalysiswasconductedtoascertainthegenotypeandtocomparethedifferenceofnucleotidewithothermeaslesvirusstrainannouncedbyGenBankduring200

6、0—2012．Measlesvirusgenotypewasanalyzed．Epidemiologicalinvestigationwasconducted．ResultsPhylogeneticanalysisshowedthat7measlesvirussampleswereisolatedfrom34throatswabspecimenswim6OfthembelongedtoH1genotype，1belongedtoD8genotypeofH1genotype．HlaappearedthemainpartofShanghaimeaslesvirus．Epi

7、demiologicalsurveyshowedthatD8wasanimportedcase．alsothefirstcasedetectedsince2000．ConclusionThegenotypedistributionofmeaslesvirusinHongkouwasidentifiedthesameaselsewhereinShanghai．D8wasanimportedcase，detectedforthefirsttimesince2000．Theresultssuggestedthatviralgenesequencingand