七氟烷麻醉大鼠海马组织特异microRNA的差异表达及靶标预测.pdf

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1、论著·中国医药导报2013年12月第10卷第36期microRNA的差异表达及靶标预测杨宇帆潘波李思源t黄金勇，刘驰潘志强1．徐州医学院麻醉学院，江苏徐州221004；2．徐州医学院临床医学系，江苏徐州221004【摘要1目的定量检测和分析七氟烷麻醉SD大鼠海马miR一133a、miR一96、miR一183的表达，并结合生物信息学，分析预测差异表达miRNA的调控靶标基因。方法54只SD雄性大鼠以6Umin通气量不同浓度七氟烷(1．5％、2．5％、3．5％)麻醉4h，苏醒后不同时间(0h、4h、2d和10d

2、，每组6只)提取大鼠海马miRNA，并反转录为cDNA，用RT—qPCR方法对miRNA进行定量分析。使用3种生物信息学预测软件对miR一133a、miR一96、miR一183进行靶标分析。结果miR一133a、miR一96、miR一183在麻醉后大鼠海马中均有表达，但表达差异不一致，与未麻醉的大鼠相比，miR一133a差异最显著，麻醉后0h、4h、2d和10d分别下调2、l、2．5倍和1倍。信息学分析表明，mirsVscore在1．0以上得分有12个靶标基因，其中3个靶基因与记忆障碍有关。分别为溶质载体家

3、庭6成员1(Slc6a1)、腺苷酸环化酶(Adcyap1)和蛋白磷酸酶催化亚基(Ppp2c)，它们可能与七氟烷麻醉导致的记忆减退相关。结论miR一133a可能参与七氟烷致学习记忆下降相关，它可能通过多个基因参与对麻醉后记忆障碍的调控。【关键词】miRNA；七氟烷；学习记忆障碍【中图分类号】R614．2【文献标识码】A【文章编号】1673-7210(2013)12(c)一0030—04DiferentialexpressionandtargetpredictionofmicroRNAinhippocam—pu

4、sinSevofiurane-anesthetizedratsYANGYufanPANBoLISiyuanHUANGJinyong'LIUChiPAN幻Ⅱn1．InstituteofAnesthesia，XuzhouMedicalCollege，JiangsuProvince，Xuzhou221004，China；2．DepartmentofClinicalMedicine，XuzhouMedicalCollege，JiangsuProvince，Xuzhou221004，China[Abstract]Ob

5、jectiveToquantitativelyanalyzethediferentialexpressionofmiR-133a，miR-96，miR-183inhippocampusofSevoflurane-anesthetizedrats，combinedwiththebioinformaticspredictetothepotentialtargetsofthedifferentialexpressedmiRNAs．Methods54maleSD—ratswereanestheziedfor4hby

6、theuseof6L／minventilatorycapacitydiferentconcentra-tionsofSevofluraneincluding1．5％，2．5％and3．5％．Ratshippocampuswasharvestedafterdiferentaweakingtime(0h，4h，2dand10d)．miRNAswereextractedfromhippocampusandreversetranscriptintocDNA．Then，RT-qPCRwasusedtode—tecta

7、ndanalyzetheexpressionofthesemiRNAs．ThreebioformaticssoftwaresincludingTarget，PicTarandMicrowereuti·lizedtopredictthemiRNAtarget．ResultsThreemiRNAincludingmiR-133a，miR-9andmiR-183wereallexpressedinhippocampusofSevoflurane-anesthetizedrats．However，theirdife

8、rentialvalueswereinconsistent．OfthreemiNRAsfromSevoflurane-anesthetizedrats，miR一133awasmostdiferentiallyexpressedcomparedwithunanesthetized-rats，andhad2folddifferentialdown-regulationfor0haweaking，1foldfor4ha