南美白对虾养殖底泥细菌多样性研究-论文.pdf

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1、第41卷第3期西北农林科技大学学报(自然科学版)Vo1．41No．32O13年3月JournalofNorthwestA＆FUniversity(Nat．Sci．Ed．)Mar．2Ol3网络出版时间：2013一Ol一2517：19网络出版地址：http：／／www．cnki．net／kcms／detail／61．1390．S．20130125．1719．008．htmi南美白对虾养殖底泥细菌多样性研究金风杰，蒋德明，王亭芳，孙霏，常忠义，赵云龙，高红亮(华东师范大学生命科学学院，上海200241)[摘要]【目的】研究南美

2、白对虾养殖池一个养殖周期的底泥细菌多样性，为指导水产养殖提供参考。【方法】于2011年7—9月，采集上海市金山区水产养殖基地南美白对虾养殖池塘的底泥，提取底泥中细菌的总DNA，扩增细菌16SrDNA的V3可变区，采用DGGE指纹图谱技术以及基因测序技术，对该养殖周期的底泥细菌多样性进行研究。【结果】不同月份虾池底泥中存在一定数量的共有优势菌群，7月和8月的共有优势菌群分别为黄杆菌属和绿弯菌门细菌，8月和9月共有优势菌群为梭菌属细菌，7月份和9月份共有优势菌群为拟杆菌门细菌和硫酸盐还原菌；同时，7—9月底泥中还各自分布有除

3、硫单胞菌属、蛭弧菌属、6一变形菌门、酸杆菌门、厚壁菌门、聚球藻属等细菌。【结论】南美白对虾养殖底泥中细菌多样性丰富。[关键词]南美白对虾养殖池；底泥；DNA提取；PCR—DGGE指纹图谱；细菌多样性[中图分类号]X835；Q785[文献标志码]A[文章编号]167卜9387(2013)03—0193—06DiversityofbacteriaonsedimentsofPenaeusvannameiaquacultureJINFeng—jie，JIANGDe—ming，WANGTing—fang，SUNFei，CHANGZ

4、hong—yi，ZHAOYun-long，GAOHong—liang(CollegeofLifeScience，EastChinaNormalUniversity，Shanghai20024l，China)Abstract：[Objective]ThediversityofbacteriaonsedimentsofPenaeusvannamezculturedpondsintheculture—cyclewasinvestigated．[Method]Sedimentswerecollectedduringdiffere

5、ntperiodsofthecul—ture—cycleofP．vannameifromJulytoSeptember2011inJinshanaquaculturebase，Shanghai．ThetotalDNAofbacteriawasextractedandthe16SrDNAV3regionwasaugmentedusingPCR．ThenthediversitywasanalyzedbyDGGEfingerprintandDNAsequencingtechnology．[Result]Theresultsof

6、thefinger—printshowedthattherewereacertainnumberofcommondominantbacterialcommunitiesindifferentmonths，FlavobacteriumandChloroflexibacteriumdominatedinJulyandAugust，Clostridiaceaebacteri—umdominatedinAugustandSeptember，andBacteroidetesbacteriumandsulfate-reducingb

7、acteriumdora—inatedinJulyandSepember．MeanwhileDesulfuromonasalkaliphilus，Bdellovibriobacteriovorus，delta-r0￡P06nfr口Z，Acidobacteria，Firmicutesbacterium，andSynechococcusexistedinthethreemonthsaswel1．[Conclusion]ThebacteriadiversityofthesedimentswasrichinP．vannameic

8、ulturedpond．Keywords：Penaeusvannameiculturedpond；sediments；extractionofDNA；PCR—DGGEfingerprint；bacteriadiversity[收稿日期]2012-07—02[基金项目]公益性行业(农业)科研专项(200903056)[