番茄 NAC 家族基因的鉴定及其功能预测-论文.pdf

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1、安徽农业科学。JournalofAnhuiAgn．Sci．2014。,i2(2o)：6549—6552，6561责任编辑李占东责任校对李岩番茄NAC家族基因的鉴定及其功能预测张亚莉，张铖，陈晓旭，刘爱香，孙利军(I．南通大学医学院生物化学教研室，江苏南通2~6001；2．南遇大学公共卫生学院生命分析化学研究所，江苏南通226019)摘要利用生物信息学方法对番茄NAC转录因子家族成员、序列傈守逮分子量、等电点等基本信息进行分析，结果显示，番茄NAC家族包含101个蛋白质，分为12亚族(I一ⅪI)。功能预测显示，20个MG基因可能与植物抗逆相关，8个

2、MC基因可能与植物所参与的渗透胁迫和衰老有关，24个^c基因可能与发育相关。该研究为番茄NAC转录茵手家族基因功能分析提供信息基础，从而对番茄品种的改良提供候选基因。关麓词番茄lNAC转录因子；功能预测中图分类号S188文献标识码A文章编号0517—6611(2014)20—06549—04IdentificationandFunctionPredictionAnalysisofNACGeneFamilyinTomatoZHANGYam，SUNU-janetal(DepartmentofBiochemistry，SchoolofMedicine，

3、NantongUniversity，Nantong，Jiangsu226019；InstituteofAnalyticalChemist珂f0rLifeScience，SchoolofPublicHealth，NantongUniversity，Nantong，Jiangsu226019)AbstractNACtranscfiptionfactorofthememberofthetomatofamily。sequence。NACdomain．molecularweightandisoelectriepointwerean—alyzedbyusin

4、gbioinformaticsmethod．101predictedproteinswereidentifiedandanbeclusteredinto12groups．Functionpredictionshowedthat20ofthembelongtoNACsubfamily(responsetobioticorabiotic)，8ofthembelongtoNTL9subfamily(senescenceandosmoticstress)，and24ofthembelongtoVNDandCUCsubfamilyrdevelopmentp

5、rocesses)．ThisstudywiUprovidetheinformationbasisforthegenefunctionanaly．sisofthetranscriptionfactoroftomatoNAC．whichwi11providethecandidategenesforimprovementoftomatocultivars．KeywordsTomato；NACtranscriptionfactor：FunctionpredictionNAC(NAM_／ATAF／cuc)转录因子家族是植物特有的性。如J。NAC家族转录因子

6、在植物生长发育中也具有重要功一类转录因子，最早在矮牵牛NAM拟南芥／2和能。CUC1、2、3主要与拟南芥的叶原基及花器官的形成有CUC2基因编码蛋白的N端中发现一段高度保守的氨基酸关，而NSTI、NST2、NST3、VND6、VND7等NAC类转录因子与序列，并命名为NAC结}鸡》域¨]，并将包含NAC结构域的蛋次生壁加厚有关。白称为NAC转录因子。NAG转录因子是植物中最大的一类番茄作为一种具有重要营养价值和经济价值的蔬菜作转录因子，生物信息学分析表明：水稻基因组中有151个成物，随着番茄基因组测序的完成，已成为植物学研究中一种员；拟南芥有l1

7、7个]，烟草和大豆中各有1S2个成员-4]。重要的模式植物。NAC家族基因的功能鉴定主要集中在拟NAC转录因子在植物生长发育及抗逆反应中都具有重要的南芥和水稻中，而对番茄NAC家族基因的功能研究较少，研调控作用J。究发现番茄Sf』、C1、Ic3、SINAM1参与番茄对逆境的响在植物非生物胁迫中，5个水稻NAC基因SNAC1、应。笔者利用生物信息学方法对番茄NAC转录因子SNAC2／OsNAC6、OsNAC5、OsNACIO／ONACI22ONAOM5和3家族进行功能预测，为番茄NAC转录因子家族基因功能分个拟南芥ANACO19、ANA6"055和

8、ANAOY72／RD26基因正向调析提供信息基础，从而对番茄品种的改良提供候选基因。控抗旱或抗盐胁迫反应，并受ABA或JA的诱导表达和调