基于SSR标记的中国绿豆种质资源遗传多样性研究-论文.pdf

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1、中国农业科学2013，46(20)：4197．4209ScientiaAgriculturaSinicadoi：10．3864~．issn．0578—1752．2013．2O．003基于SSR标记的中国绿豆种质资源遗传多样性研究刘岩，程须珍，王丽侠，王素华，白鹏，吴传书(中国农业科学院作物科学研究所，北京100081)摘要：【目的】分析中国栽培绿豆种质资源的遗传多样性、亲缘关系和遗传分化，为资源的有效利用、新基因的挖掘和新品种选育奠定基础。【方法】利用40对SSR5I物对18个不同地理来源(共272份种质)的绿豆群体进行遗传多样性分析。【结果】共检测到125个等位基

2、因，平均等位基因数(NA)为3．1个，平均有效等位基因数(NE)为I．8个，平均Nei’S基因多样性()为0．4233，平均多态性信息含量(PIC)为0．3497，平均期望杂合度(肫)为0．4241，平均Shannon信息指数(，)为0．6754，比较发现，河北、山东和安徽是绿豆资源遗传变异较为丰富的地区；平均观测杂合度(胁)为0．1001，种群内总近交系数(FiS)为0．6759，表明中国绿豆种质间存在一定程度地近交现象；18个参试群体整体水平上的基因流(Nm)值为0．6936，种群间遗传分化系数(Fst)为0．2649，遗传变异水平较高；基于Popgene软件的

3、聚类结果可将272份参试个体聚为2大类，将18个参试群体分为3大类，群体间地理来源越近，亲缘关系也越近。【结论】中国绿豆种质资源遗传多样性较高；地理生态条件等对绿豆种质资源的遗传变异影响很大；群体间遗传分化较大，但同时也存在一定程度地近交现象。关键词：绿豆；SSR；遗传多样性；亲缘关系GeneticDiversityResearchofMungbeanGermplasmResourcesbySSRMarkersinChinaLIUYan，CHENGXu·zhen，WANGLi—xia，WANGSu-hua，BAIPeng，WUChuan—shu(Instituteo

4、fCropScience,ChineseAcademyofAgriculturalSciences,Beo'ing100081)Abstract：[Objective]Thepurposeofthisresearchwastoinvestigatethegeneticdiversity，relationshipanddifferentiationofcultivatedmungbeangermplasmresourcesinChina，andprovideusefulinformationoneffectiveutilizationofresources，newge

5、nesminingandbreeding．[Method]Thegeneticdiversityof18mungbeangroupsfromdifferentareaswasanalyzedbyusing40SSRmarkers．【Result]Atotalof125alleleswereidentifiedwithanaverageof3．1allelesperlocus．Theaverageofeffectivenumberofalleles)，Nei’Sgenediversity(，polymorphisminformationcontent(PIC)，exp

6、ectedheterozygosity()，andShannon’Sinformationindex∽were1．8，0．4233，0．3497，0．4241，and0．6754，respectively．Hebei，ShandongandAnhuiprovinceshadahighergeneticvariationthanotherprovinces．Theaverageobservedheterozygosity(爿b)was0．1001andtheaverageofinbreedingcoeficientamongpopulation(Fis)was0．67

7、59，indicatingthatacertaindegreeofinbreedingexistedinChinesemungbeangermplasm．ThegeneflowfNm=0．6936)andtheaveragegeneticdifferentiation(Fst=0．2649)alsoshowedahighgeneticvariationwithinChinesemungbean．Atotalof272individualsweredividedinto2groupsand18populationsweredividedinto3groupsbas