海南木豆丛枝植原体质粒全序列测定及分析-论文.pdf

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1、热带作物学报2014，35(7)：1404—1408ChineseJournalofTropicalCrops海南木豆丛枝植原体质粒全序列测定及分析李玲婷，车海彦，曹学仁，杨毅，罗大全中国热带农业科学院环境与植物保护研究所农业部热带作物有害生物综合治理重点实验室海南海口571101海南省热带农业有害生物监测与控制重点实验室摘要提取木豆叶片基因组总DNA。通过克隆，测序木豆丛枝植原体海南株系质粒(pPPWB—Hn)的完整DNA序列．并使用生物信息学软件对该质粒全长序列进行分析。分析结果显示：pPPWB—Hn质粒全长4218bp，含有4个开放阅读框，分别编码Rep、dnaG、

2、threoninesynthase和未知蛋白。其中，Rep是2次跨膜蛋白，dnaG是单次跨膜蛋白，Rep和dnaG均与质粒自主复制有关。Rep和未知蛋白可能分布在细胞质中，dnaG可能定位到细胞膜上或膜外。Threoninesvnthase可能定位到线粒体膜上或线粒体内腔。系统进化树显示：pPPWB—Hn与植原体16SrⅡ组的pPNWB(AY270152)，pTBBperi(DQ119297)2~pTBBcap(DQ119296)处在同一进化分支。关键词木豆丛枝植原体；质粒；序列分析中图分类号$432．42文献标识码ATheCompleteSequenceAnalysis

3、ofaPlasmidfromPigeonPeaWitches-broomPhytoplasmainHainanLILingting，CHEHaiyan，CAOXueren，YANGYi，LUODaquanEnvironmentandPlantProtectionInstitute，CATAS／KeyLaboratoryofIntegratedPestManagementonTropicalGrops，MinistryofAgriculture，P．R．China／HainanKeyLaboratoryforMonitoringandControlofTropicalAgr

4、iculturalPests，Hmko~Hainan571101，ChinaAbstractThecompletenucleotidesequenceofplasmidfrompigeonpeawitches—broomphytoplasmahasbeendetermined．Theplasmid，pPPWB-Hn，was4218bpinlengthandcontained4putativeORFs．ORF1encodedareplicationprotein(Rep)withtwotransmembranedomains．ORF2encodeddnaGwithasing

5、letransmembranedomain．ORF3encodedthreoninesynthase，andORF4encodedanunknownfunctionprotein．Threoninesynthaseandunknownproteinarenottransmembraneprotein．TheRepanddnaGwererelativelytoautonomousreplicationoftheplasmid．TheRep，dnaG，threoninesynthasandunknownproteinwerepresumablytobelocalizedtot

6、hecytoplasm，themembraneorcytoplasm，themitoehondrialmembraneormitochondrialcavity，andcytoplasmrespectively．ThephylogenetictreeshowedthatthesequencewasclusteredinthesalnecladewithpPNWB(AY270152)，pTBBperi(DQ119297)andpTBBcap(DQ119296)，whichbelongedto16SrIlgroupphytoplasma。KeywordsPigeonpeawi

7、tches"-broomphytoplasma；Plasmid；Sequenceanalysisdoi10．3969~．issn．1000—2561．2014．07．026木豆fC肌c帆(L．)Millsp．1Y-名三叶豆、鸽析．确定引起海南木豆丛枝的植原体属于16Sr11豆、树豆，是一种重要的经济作物和粮食作物[1-2]。组中的亚组iii[9-Ⅻ。目前除台湾、海南外，中国尚在中国木豆主要种植在云南、广西、海南等地，用未见其它地区有关于木豆丛枝病的研究报道。于喂养家畜和家禽，枝条可作为柴薪．提取物可制质粒是一种可以自我复制的染