SNT2482-2010马铃薯丛枝植原体检疫鉴定方法.pdf

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1、中华人民共和国出入境检验检疫行业标准犛犖/犜2482—2010马铃薯丛枝植原体检疫鉴定方法犐犱犲狀狋犻犳犻犮犪狋犻狅狀狅犳狆狅狋犪狋狅狑犻狋犮犺犲狊’犫狉狅狅犿狆犺狔狋狅狆犾犪狊犿犪20100110发布20100716实施中华人民共和国发布国家质量监督检验检疫总局犛犖/犜2482—2010前言本标准的附录A和附录B均为资料性附录。本标准由国家认证认可监督管理委员会提出并归口。本标准由中华人民共和国辽宁出入境检验检疫局、中国检验检疫科学研究院负责起草。本标准主要起草人:王秀芬、赵文军、刘伟、彭金火、牟海青、周铭、朱水芳

2、。本标准系首次发布的出入境检验检疫行业标准。Ⅰ标准分享网www.bzfxw.com免费下载犛犖/犜2482—2010马铃薯丛枝植原体检疫鉴定方法1范围本标准规定了马铃薯丛枝植原体的检疫鉴定方法。本标准适用于所有进境种薯、商品薯、组培苗和脱毒苗等马铃薯种质中马铃薯丛枝植原体的检疫鉴定。2原理2.1学名和分类地位学名:Potatowitches’broomphytoplasma缩写:PWB分类地位:细菌界(Bacteria),硬壁菌门(Firmicutes),柔膜菌纲(Mollicutes),非固醇菌原体目(Acholeplas

3、matales),非固醇菌原体科(Aeholeplasmataceae),植原体属(犘犺狔狋狅狆犾犪狊犿犪),三叶草丛蔟组(Cloverproliferationgroup,16SrⅥ)。其他资料参见附录A。2.2鉴定原理马铃薯丛枝植原体的分子生物学特性为本标准鉴定方法的主要依据。3仪器和用具3.1仪器设备:PCR仪、超净工作台、电泳仪、凝胶成像分析仪、冷冻离心机、电子天平(1/10000g)、pH计、水浴锅、振荡器等。3.2用具;可调移液器(0μL~20μL、20μL~200μL、200μL~1000μL)及相关吸头、研钵

4、、离心管(1.5mL、10mL)、PCR管(0.2mL)、量筒、烧杯、镊子等。4试剂4.1研磨液磷酸氢二钠(Na2HPO4)0.1mol/L磷酸二氢钠(NaH2PO4)0.03mol/LEDTA10mmol/L(pH8.0)蔗糖10%(质量浓度)PVP402%(质量浓度)调整pH至7.6,然后过滤除菌。使用前加入0.15%(质量浓度)牛血清白蛋白(BSA)和1mmol/L抗坏血酸维生素C。4.2犆犜犃犅缓冲液CTAB2%(质量浓度)TrisHCl100mmol/L(pH8.0)EDTA20mmol/L(pH8.0)氯化钠

5、(NaCl)1.4mol/LPVP401%(质量浓度)1犛犖/犜2482—20104.3其他试剂苯酚、三氯甲烷、异戊醇、异丙醇、乙醇、琼脂糖、溴化乙锭、犜犪狇DNA聚合酶、10×PCR缓冲液、dNTP液(2.5mmol/LdATP,dTTP,dCTP,dGTP)。5检疫鉴定5.1犇犖犃提取大约0.3g组织(叶柄、叶脉、茎)在3mL预冷研磨液中研磨,将粗汁液转移至2mL微量离心管中。4℃下4500r/min离心5min。将悬浮液转至新的2mL离心管中。4℃下13000r/min离心15min。去掉上清液。在750μL预热(5

6、5℃)CTAB缓冲液中悬浮沉淀[少量CTAB缓冲液(如100μL)更易悬浮沉淀,然后加入剩余的CTAB缓冲液(如650μL)]。55℃下孵育30min,间歇颠倒混匀。离心管在冰上冷却30s。加入750μL三氯甲烷∶异戊醇(24∶1体积比),涡旋振荡。4℃或室温下13000r/min离心4min。小心将上面水相转至一个新的1.5mL离心管中。加入1体积预冷异丙醇,涡旋振荡。冰上孵育4min后4℃或室温下13000r/min离心10min。去掉上清液。用500μL70%(体积分数)冷乙醇洗涤DNA沉淀,4℃或室温下13000r/

7、min离心1min。空气干燥DNA沉淀。用20μL灭菌蒸馏水悬浮沉淀。55℃下孵育离心管10min有助于DNA再悬浮。-20℃短期贮存或-80℃长期贮存。注:也可采用商品试剂盒提取。5.2引物序列引物采用植原体16SrDNA(参见附录B)通用引物P1/P7和R16F2n/R16R2。引物序列见表1。表1犘犆犚检测的引物www.bzfxw.com引物名称引物序列5’3’产物/bpP1AAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATT1800P7CGTCCTTCATCGGCTCTT通用引物R16F2nACGACTGCTAAGA

8、CTGG1251R16R2TGACGGGCGGTGTGTACAAACCCCG5.3巢式犘犆犚用引物P1/P7进行第1轮PCR。反应体系见表2。反应条件为:94℃/5min;94℃/30s,53℃/30s,72℃/1min,35个循环;72℃/10min。表2犘犆犚反应体系试剂名称加样量/μ

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