大豆籽粒不同发育时期基因表达谱分析-论文.pdf

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1、2012年4月中国油料作物学报2012，34(2)：129—135Chinesejournalofoilcropsciences大豆籽粒不同发育时期基因表达谱分析陈欢r，杨美英，王真慧，孙呖，王刚，魏玮，关瑜，王法微，李海燕’，陈光(1．吉林农业大学生物反应器与药物开发教育部工程研究中心，吉林长春，130118；2．吉林农业大学生命科学学院，吉林长春，130118；3．东北师范大学分子表观遗传学教育部重点实验室，吉林长春，130024)摘要：以花后15d的大豆籽粒作为对照，通过Solexa高通量测序方法对花后35d、55d和65d

2、的大豆籽粒进行转录水平上的检测，并结合GO功能注释和pathway分析，共有差异表达unigene为9905个，其中调控脂肪酸合成途径的显著差异表达基因12个，蛋氨酸代谢途径关键基因6个。以花后55d的eDNA为样本，荧光定量PCR检测了12个差异表达基因，其结果可与测序结果互为印证。关键词：大豆；油脂；蛋白质；脂肪酸；蛋氨酸；差异表达基因中图分类号：$565．103文献标识码：A文章编号：1007—9084(2012)02-0129—07GeneexpressionprofileofdevelopingsoybeanseedsC

3、HENHuan，YANGMei—ying，WANGZhen—hui，SUNYang，WANGGang2，WEIWei，GUANYu，WANGFa—wei，LIHai—yan’¨，CHENGuang(1．MinistryofEducationEngineeringResearchCenterofBioreactorandPharmaceuticalDevelopment，JilinAgriculturalUnive~ity，Changchun130118，China；2．CollegeofLifeSciences，JilinAgri

4、culturalUniversity，Changchun130118，China；3．KeyLaboratoryofMolecularEpigeneticsofMOEandInstituteofGenetics&Cytology．NoaheastNormalUniversity，Changchun130024，China)Abstract：Solexahigh—throughputRNA—sequencingwereperformedon35DAF(daysafterflowering)，55DAFand65DAFsamplesa

5、ttranscriptionallevel，whileseedsat15DAFservedascontro1．Totally9905differentialexpressedunigeneswereCO—expressedgenes．CombinedwithGOfunctionalannotationandpathwayanalysis，12no-velCO—-expressedunigenesthatregulatedfattyacidbiosynthesispathwayand6novelCO——expressedunigen

6、esthatregulatedmethioninemetabolismwerefound．qRT—PCRwasfocusedon12diferentiallyexpressedgenesfromeDNAmaterialsof55DAF．ResultswereconsistentwiththosefromSolexasequencing．Keywords：Soybean；Oil；Protein；Fattyacid；Methionine；Differentialexpressedgene大豆原产于我国，是食用油和蛋白质的重要来种子品质

7、已成为突破传统育种限制的有效途径。已源。大豆油不仅是应用最广泛的食用油，在转化为工有研究表明，在种子质体中过表达细胞质的同型Ac-业用油方面也有巨大潜力；另外，大豆蛋白质中含有Case基因可导致脂肪酸含量的增加j。Ohlrogge等人体和动物不能合成的八种必需氨基酸，亦有完全蛋将油菜种子贮藏蛋白napin启动子启动的拟南芥AD白的美称¨j。因此培育高油、高品质的大豆新品种是CaseI基因转入油菜，使脂肪酸含量增加了6％左大豆育种的主要目标，尤其是利用基因工程手段改善右。在大豆蛋白质改良方面，Dinkins利用基因枪收稿日期：201

8、2-01-04基金项目：科技部863项目(2011AA1000691008)；国家转基因生物新品种培育重大专项(2010ZX08010—002)；吉林省优秀创新团队项目(2ol11815)作者简介：陈欢(1983一)，女，吉林省德惠市人，博士研究生