中国美利奴羊igfbp-5基因外显子区的pcr-sscp多态性分析

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1、新疆农业科学2010,47(8):1615—1618XinjiangAgriculturalSciences中国美利奴羊IGFBP一5基因外显子区的PCR—SSCP多态性分析沈敏,杨永林,何其宏2,马春萍2,刘守仁(1.新疆农垦科学院兵团绵羊繁育生物技术重点实验室.新疆石河子8320002.新疆紫泥泉绵羊育种中,新疆石河子832025)摘要:【目的】以IGFBP一5作为候选基因,寻找与绵羊生产性能有关的SNP位点。【方法1利用PCR—SSCP和DNA测序快速筛查SNP位点;分析该位点在中国美利奴羊中的基因型和等位基因分

2、布情况;并通过多重比较分析不同基因型与中国美利奴羊部分生产性能的关联性。【结果与结论】在绵羊IGFBP一5基因外显子1区发现一个新的SNP位点(C136G),并建立了PCR—SSCP的基因分型方法。对212只中国美利奴羊的检测结果显示有CC、CG和GG3种基因型,基因型频率分别为0.50、0.41和0.09,C等位基因频率为0.70,G等位基因频率为0.30。不同基因型与中国美利奴羊早期生长和羊毛生产性能具有一定的影响:GG基因型个体的初生重、剪毛后体重以及剪毛量显著高于CC基因型(P<0.05);CC基因型个体的毛丛

3、长度明显长于CG基因型个体(P<0.05)。关键词:胰岛素样生长因子结合蛋白5;单核苷酸多态性;生产性能;中国美利奴羊中图分类号:$826.86;S188文献标识码:A文章编号:11301—4330(2010)08—1615—04AnalysisonPCR—SSCPPolymorphismofIGFBP一5geneinChineseMerinoSHENMin,YANGYong—Ling。,HEQi—Hong2,MAChun—Ping2,LIUShou—Ren(1.KeyLaboratoryforSheepBreedin

4、gBiotechnology,XinjiangProduction&CortstructionCorps,XinjiangAcademyofAgriculturalReclamation,ShihhotzeXinjiang832000;2.ZiniquanInstituteofSheepBreeding,ShihhotzeXinjiang832025,China)Abstract:【Objective]ToseektheSNPsassociatedwiththeproductionperformanceofsheepr

5、egardingIGFBP一5asacandidategene.【Method]ThepolymorphismofsheepIGFBP一5genewasdetectedbyPCR—SSCPandDNAsequencing.TheSNPlociwerescreenedbyuseofPCR——SSCPandDNAsequencewhosegenetypeaneAlleledistributioninChineseMerinowereanalyzedcomparativeanalysiswascarriedoutonthea

6、ssociationbetweendiferentgenotypesandseveralproductionperformanceofChineseMerino.【ResultsandConclusion]PCR—SSCPmethodwasestablishedaccordingtoSNPloci(C136G)withintheexon4ofsheepIGFBP一5gene.Usingthismethod,212ChineseMerino(XinjiangJunkentype)sheepsweretestedandil

7、lustratedthreeuniquebindinggenotypes:CC,CGandGG.FrequenciesofthegenotypeCC,CG,GGandalleleC,Gwere0.50,0.41,0.09and0.70,0.30,respectively.DifferentgenotypesslightlyaffectedearlygrowthandseveralwooltraitsofChineseMerino.Binhweight.post—sheafingweightandgreasyfleece

8、weightinindividualsofgenotypeGGwassignificantlyhigherthanthatinindividualsofgenotypeCC(P<0.05);StaplelengthinindividualsofgenotypeCCwaslongerthanthatinindividualsofge

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