中国2000-2008年间甲型副伤寒沙门菌脉冲场凝胶电泳和多位点序列分析

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1、·81O中华预防医学杂志2010年9月第4H4卷第9期ChinJPmvMed，September2010。Vo1．44．No．9．论著．中国2000-2008年间甲型副伤寒沙门菌脉冲场凝胶电泳和多位点序列分析韩辉周海健崔志刚杜鹏程阚飙【摘要】目的分析我国2000-2008年间甲型副伤寒沙门菌流行株的分子分型及病原进化上的特征。方法应用以SpeI为限制性内切酶的脉冲场凝胶电泳(pulsed—fieldgelelectrophoresis，PFGE)方法和基于9个管家基因位点(aroC、thrA、hisD、purE、sucA、dnaN、heroD、adk

2、和purA)的多位点序列分析(multilocussequencetyping，MIST)分型方法，对我国2000-2008年间分离自10个地区的118株甲型副伤寒沙门菌流行株进行分析。结果应用PFGE方法将118株甲型副伤寒沙门菌分为32个型，其中包含5株以上的优势PFGE带型有5种。而应用MIST方法，所有菌株只分出了2个序列分型(sequencetype，ST)，各菌株的管家基因序列高度保守，呈现高度克隆化。结论中国20o0—2008年间甲型副伤寒沙门菌菌株应用MIST这种分型方法很难区分，MIST不适于甲型副伤寒沙门菌的暴发调查和流行病学监测

3、。目前中国的甲型副伤寒是由高度克隆化的菌株引起全国范围的扩散流行。随着年份的变迁，也积累了散在的变异。【关键词】沙门菌，甲型副伤寒；电泳，凝胶，脉冲场；序列分析；序列标记位点Multilocussequencetypingandpulsed-fieldgelelectrophoresisanalysisofSalmonellaParatyphiAisolatesfrom20ooto2oo8，ChinaHANHui，ZHOUHai-jian，CUIZhi-gang，DU一cheng，KANBiao．StateKeyLaboratoryforInfect

4、iousDiseasePreventionandControl，NationalInstituteforCommunicableDiseaseControfandPrevention．ChineseCenterforDheaseControlandPreventh3I，Berig102206，ChinaCorrespondingauthor：，vBiao，Email：kanbiao@icdacn【Abstract】0bjectiveToanalyzemolecularandevolutioncharacteristicsofSalmonellaPar

5、atyphiAisolatesfrom2000to2008．China．MethodsUsingpulsed．fieldgelelectrophoresis(PFGE)methodwitIlSpeIrestrictionenzyme，andmultilocussequencetyping(MLST)methodbasedonhousekeepinggenes(aroC，thrA，hisD，purE，sucA，dnaN，hemD，adk，andpurA)，thegenomicvariationsof118SalmonellaParatyphiAisol

6、atesfrom10regionsduring2000to2008wereanalyzed．ResultsUsingPFGEmet}lod．118SalmonellaParatyphiAisolateswereclusteredinto32PFGEpatterns．and5patternswerepredominantf5isolatesorabove)．However，only2MLSTtypeswereidentifiedforallisolateswithMLSTmetIlod．AmongallSalmonellaParatyphiAisola

7、tes，thesequencesofhousekeepinggeneswerehighlyconservativeandshowedahighdegreeofcloning．ConclusionForChineseepidemicSalmonellaParatyphiAisolatesduring2000—2008．MISTmethodshowedlowdiscriminationpowerandtheMLSTmetIIodshouldnotbeappliedtooutbreakandepidemiologicalsurveillanceofSalm

8、onellaParatyphiA．Currently，nationwideparatyphoidfevere