生物资讯与生物晶片领域发展计画.ppt

《生物资讯与生物晶片领域发展计画.ppt》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在行业资料-天天文库。

1、生物資訊與生物晶片領域發展計畫申請學校：國立虎尾技術學院申請系別：資訊工程技術系光電工程技術系Outline計畫背景人類基因組計畫生物資訊學生物晶片計畫目標相關教學內容與發展特色生物資訊/生物晶片實驗室規畫預期成效ThescienceofusinginformationtounderstandbiologyBIOINFORMATICSComputationalManagementGenesProteinsBiologicalInformationofallkindsofDatabasesAnalyticalSoftware網際

2、網路上各種生命科學相關資料之取得及應用BioinformaticsFlowChart(1)1a.Sequencing1b.Analysisofnucleicacidseq.BasecallingPhysicalmappingFragmentassembly-genefindingMultipleseqalignmentevolutionarytreeStretchofDNAcodingforprotein;Analysisofnoncodingregionofgenome2.Analysisofproteinseq.3.Mo

3、lecularstructureprediction3Dmodeling;DNA,RNA,protein,lipid/carbohydrateSequencerelationship4.molecularinteractionProtein-proteininteractionProtein-ligandinteraction5.MetabolicandregulatorynetworksBioinformaticsFlowChart(2)6.Gene&Proteinexpressiondata7.DrugscreeningE

4、STDNAchip/microarrayLeadcompoundbindstightlytobindingsiteoftargetproteinLeadoptimization–leadcompoundmodifiedtobenontoxic,fewsideeffects,targetdeliverableAbinitiodrugdesignORDrugcompoundscreeningindatabaseofmolecules8.GeneticvariabilityDrugmoleculesdesignedtobecompl

5、ementarytobindingSiteswithphysiochemicalandstericrestrictions.NowinvestigatedatthegenomescaleSNP,SAGE生物晶片何謂生物晶片技術？簡單地說，生物晶片技術是結合了分子生物學、電子學、微機械、和生物訊息等專業領域的綜合產物。而生物晶片是指將待測物品置於玻璃、矽片、塑膠等不同材質載體之上，利用適當的儀器加以判讀，其作用對象可以為基因、蛋白質或細胞組織等等。生物晶片依其功能可分為基因晶片(Genechip、DNAchip)蛋白質晶片(Pr

6、oteinchip)微流體晶片(Microfluidicschip)實驗室晶片(Lab-on-chip)等四大類基因晶片而基因晶片依DNA樣品製備的方式不同又可分為二種：第一種是由Affymetrix公司研發出來，以半導體製程方式開發的光學蝕刻法(photolithography)與化學合成法相結合的光引導原位合成法(Light-Directedsynthesis)。第二種是美國史丹佛大學所使用的接觸式點樣法，利用預先合成好的DNA固定到玻璃片上，這種高密度矩陣方式整齊排列的晶片，很多人稱它為微陣列技術(Microarray)

7、。基因晶片實驗流程Step1.DNAsequence收集及資料庫Database建立Step2.DNAprobe探針設計，微點陣設計與固定化(Microarrayerprinting)Step3.雜交反應試驗(Hybridization)計畫目標生物晶片與cDNA晶片的資料管理系統計劃基因晶片與生物資訊整合系統計劃光學生物晶片檢測系統計劃生物晶片與cDNA晶片的資料管理系統計劃以成立生物晶片實驗室及發展cDNA晶片相關的資料管理系統為主設計一些生物晶片為主的課程，如分子生物學，DNA及RNA之製備與操控，基因晶片之原理與介紹等

8、相關基礎課程，再配合基因晶片實驗室之實習課程為輔基因晶片與生物資訊整合系統計劃以成立基因晶片與生物資訊研究所為導向，以整合資訊工程以及微機電(Microelectromechanicalsystem,MEmS)技術，整合若干管道集反應器於一塊晶片上(Lab-on-a-chip