欢迎来到天天文库
浏览记录
ID:53028195
大小:436.44 KB
页数:6页
时间:2020-04-14
《基于AFLP分子标记和DNA条形码对无籽刺梨的鉴定-论文.pdf》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、林业科学研究2015,28(1):116~121ForestResearch文章编号:1001—1498(2015)01-0116-06基于AFLP分子标记和DNA条形码对无籽刺梨的鉴定李旦,周安佩,张德国,高健,何承忠,李永和(1.西南林业大学,云南昆明650224;2.贵州兴仁县石漠化综合治理领导小组办公室,贵州兴仁5623003.云南生物多样性研究院,云南昆明650224)摘要:利用AFLP分子标记和DNA条形码技术,对采自贵州省兴仁县和贵州省安顺市的刺梨、无籽刺梨和光枝无籽刺梨共19份样本材料进行鉴定。结果表明:AFLP标记分析l9个样本间的遗传相似系数在0.719
2、0~0.9972之间,平均相似系数为0.9365。采用UPGMA法进行聚类分析,将19个样本聚类为2组,刺梨为单独1组,其他l8份样本为1组。DNA条形码分析结果显示ITS无变异位点,将4种叶绿体序列片段(psbA.trnH、atpF—atpH、psbI.psbK、trnL—F)合并后以联合序列作为数据分析的基础,19份样本的平均误差为0.0006,除刺梨外,其他l8份样本之间的遗传距离均为0,而刺梨与无籽刺梨、光枝无籽刺梨之间的遗传距离均为0.0058。两种方法的鉴定结果一致,无籽刺梨与刺梨是独立的2个种,兴仁县无籽刺梨与安顺市的光枝无籽刺梨为同一个种。本研究结果明确了无
3、籽刺梨的系统地位,从分子水平和基因水平上解决无籽刺梨的分类分歧,为今后开展无籽刺梨种质资源的收集、保存、开发和应用等奠定了理论基础。关键词:刺梨;无籽刺梨;AFLP分子标记;ITS序列;cpDNA序列中图分类号:$718.46文献标识码:AIdentificationofRosasterilisBasedonAFLPMolecularMarkersandDNABarcodesLIDan,ZHOUAn-pei,ZHANGDe—guo,GAOJian,HECheng-zhong,LIYong—he‘,(1.SouthwestForestryUniversity,Kunming6
4、50224,Yunnan,China;2.RockyDesertificationComprehensiveTreatmentOficeofXing’renCounty,Xing’ten562300,Guizhou,China;3.YunnanAcademyofBiodiversity,Kunming650224,Yunnan,China)Abstract:NineteenRosaroxbunghii,R.sterilisandR.sterilisvar.feiocladaspecimencollectedfromXing’renandAnshuninGuizhouofCh
5、inawereidentifiedbyAFLPmolecularmarkersandDNAbarcodes.TheresultsofAFLPshowedthatgeneticsimilaritycoeficientamongthe19specimenrangedfrom0.7190~0.9972andtheaveragewas0.9365.TheresultofUPGMAclusteranalysisshowedthatthe19specimencouldbedividedintotwogroups.R.roxbunghiiwasdistinctfromtheothersa
6、ndformedonegroupseparately,whichtheothersfallintoanothergroup.TheresultofDNAbarcodesshowedthattherewasnotvariablesiteinITSsequencesand4cpDNAsequencesshowedhighlyclosedaffinity.Basedoncombinedsequences,theaverageerrorwas0.0006,whilethegeneticdis—tancebetweenR.roxbunghiiandtheotherswas0.0058
7、.Theidentificationresultsoftwomethodswereconsistent.R.sterilisandR.roxbunghiiweretwosegregatedspecies.TheR.steriliscollectedfromXing’renandR.sterilisvar.1eiocladacollectedfromAnshunbelongtothesamespecies.Theresultsofthisstudydeterminedthephylogeny收稿日期:2014-07-
此文档下载收益归作者所有