基于AFLP分子标记和DNA条形码对无籽刺梨的鉴定-论文.pdf

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1、林业科学研究2015，28(1)：116～121ForestResearch文章编号：1001—1498(2015)01-0116-06基于AFLP分子标记和DNA条形码对无籽刺梨的鉴定李旦，周安佩，张德国，高健，何承忠，李永和(1．西南林业大学，云南昆明650224；2．贵州兴仁县石漠化综合治理领导小组办公室，贵州兴仁5623003．云南生物多样性研究院，云南昆明650224)摘要：利用AFLP分子标记和DNA条形码技术，对采自贵州省兴仁县和贵州省安顺市的刺梨、无籽刺梨和光枝无籽刺梨共19份样本材料进行鉴定。结果表明：AFLP标记分析l9个样本间的遗传相似系数在0．719

2、0～0．9972之间，平均相似系数为0．9365。采用UPGMA法进行聚类分析，将19个样本聚类为2组，刺梨为单独1组，其他l8份样本为1组。DNA条形码分析结果显示ITS无变异位点，将4种叶绿体序列片段(psbA．trnH、atpF—atpH、psbI．psbK、trnL—F)合并后以联合序列作为数据分析的基础，19份样本的平均误差为0．0006，除刺梨外，其他l8份样本之间的遗传距离均为0，而刺梨与无籽刺梨、光枝无籽刺梨之间的遗传距离均为0．0058。两种方法的鉴定结果一致，无籽刺梨与刺梨是独立的2个种，兴仁县无籽刺梨与安顺市的光枝无籽刺梨为同一个种。本研究结果明确了无

3、籽刺梨的系统地位，从分子水平和基因水平上解决无籽刺梨的分类分歧，为今后开展无籽刺梨种质资源的收集、保存、开发和应用等奠定了理论基础。关键词：刺梨；无籽刺梨；AFLP分子标记；ITS序列；cpDNA序列中图分类号：$718．46文献标识码：AIdentificationofRosasterilisBasedonAFLPMolecularMarkersandDNABarcodesLIDan，ZHOUAn-pei，ZHANGDe—guo，GAOJian，HECheng-zhong，LIYong—he‘，(1．SouthwestForestryUniversity，Kunming6

4、50224，Yunnan，China；2．RockyDesertificationComprehensiveTreatmentOficeofXing’renCounty，Xing’ten562300，Guizhou，China；3．YunnanAcademyofBiodiversity，Kunming650224，Yunnan，China)Abstract：NineteenRosaroxbunghii，R．sterilisandR．sterilisvar．feiocladaspecimencollectedfromXing’renandAnshuninGuizhouofCh

5、inawereidentifiedbyAFLPmolecularmarkersandDNAbarcodes．TheresultsofAFLPshowedthatgeneticsimilaritycoeficientamongthe19specimenrangedfrom0．7190～0．9972andtheaveragewas0．9365．TheresultofUPGMAclusteranalysisshowedthatthe19specimencouldbedividedintotwogroups．R．roxbunghiiwasdistinctfromtheothersa

6、ndformedonegroupseparately，whichtheothersfallintoanothergroup．TheresultofDNAbarcodesshowedthattherewasnotvariablesiteinITSsequencesand4cpDNAsequencesshowedhighlyclosedaffinity．Basedoncombinedsequences，theaverageerrorwas0．0006，whilethegeneticdis—tancebetweenR．roxbunghiiandtheotherswas0．0058

7、．Theidentificationresultsoftwomethodswereconsistent．R．sterilisandR．roxbunghiiweretwosegregatedspecies．TheR．steriliscollectedfromXing’renandR．sterilisvar．1eiocladacollectedfromAnshunbelongtothesamespecies．Theresultsofthisstudydeterminedthephylogeny收稿日期：2014-07-