dna条形码和分子标记的开发及利用高级培训班

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1、中国科学院计算技术研究所北京海淀中科计算技术转移中心ICTTRAIN-08-03-02关于举办“生物信息学最新技术”暨“分子鉴定原理及应用”高级培训班的通知各有关单位:随着分子生物学技术和生物信息学的发展，分子鉴定应用领域越来越广泛，其中基于DNA条形码技术、基因组技术等进行鉴定和分类的研究已成为生物分类学研究中引人注目的新方向和研究热点。DNA条形码、基因组等技术的出现极大地增强人类监测、了解和利用生物多样性资源的能力，其在生命科学、法医学、流行病学，以及医药、食品质量控制等领域均具有广泛的应用前景。“智能信息处理技术”为人力资源与社会保障部中国科学院北京分院国家级专业技

2、术人员继续教育基地培训点培训项目，“生物信息”为智能信息处理技术系列培训项目之一。为进一步推动我国生物信息学的发展，提高从业人员的技术水平，北京海淀中科计算技术转移中心（中科院计算所技术转移中心）举办“生物信息学最新技术”暨“分子鉴定原理及应用——“DNA条形码和下一代（nextgeneration）分子标记的开发及利用”高级培训班，并由北京嘉诚永恒科技有限公司具体承办，具体事宜通知如下：一、培训目标及特点：本培训分子鉴定应用，DNA测序，DNA条形码技术，基因组，遗传检测为主题，精心设计了具有前沿性，实用性和针对性强的理论课程和上机课程。培训邀请的主讲人均是有理论和实际研

3、究经验的人员。学员通过与专家直接交流，能够分享到这些顶尖学术机构的研究经验和实验设计的思路。学员通过集中专题学习后能够扩展思路，在研究技术方面领悟更多。二、培训对象：大中专院校生物信息、生物计算、生命科学、医学、化学、农学、计算机科学、数学类专业的课程负责人、一线教师、教研室骨干人员、教学管理人员；科研单位从事生物、生命科学、微生物研究的相关人员；生物、医药、化学及相关企业的领导与技术骨干。三、时间地点：2016年5月5日——5月8日武汉大学（时间安排：第1天报到，授课3天）四培训内容一分子鉴定的应用1、微生物、动物、植物资源普查2、检验检疫3、中药材真伪鉴定4、食品质量安

4、全5、疾病诊断和预防6、分子育种二DNA测序技术-遗传检测的利器1、第一代测序技术：Sanger测序原理2、第二代测序技术：Illumina，454,IonTorrent原理3、第三代测序技术：PacBio,Hellicos原理4、第四代测序技术:OxfordNanoPore原理5、Hybridizationbasedmethods6、测序技术的比较及展望三Sequence-independent分子标记的开发及应用1、Restrictionfragmentlengthpolymorphism（RFLP）2、RandomamplifiedpolymorphicDNA（RAP

5、D）3、Simplesequencerepeats（SSR）4、Singlestrandconformationpolymorphism（SSCP）5、Cleavedamplifiedpolymorphicsequence（CAPS）6、Sequencecharacterizedamplifiedregion（SCAR）7、Amplifiedfragmentlengthpolymorphism（AFLP）8、Inter-retrotransposonamplifiedPolymorphism（IRAP）9、REtransposon-microsatelliteamplifi

6、edpolymorphism（REMAP）四equence-dependent分子标记开发及应用1、常用的DNA条形码标记：ITS，ITS1，ITS2，trnH-psbA，rbcL-matK，COI等2、常用DNA条形码鉴定方法：sequencesimilarity-based（Blast，HiddenMarkovModel），tree-based，cutoff-based3、筛选最优DNA条形码指标⑴PCRamplificationsuccess⑵Sequencingefficiency⑶Speciesdistinguishingpower⑷DNAbarcodinggap

7、DNAbarcoding相关数据库⑴BOLD:BarcodeofLifeDatabase⑵BOMMD:BarcodeofMedicinalMaterialsDatabase五基于全基因组序列的新的分子标记的发现1、（真菌、动物）线粒体基因组⑴测序方案:实验方法纯化还是生信方法纯化⑵组装方法：denovovs.referencebased⑶注释流程:MFAnnotatorvs.FUMGA⑷特异性标记筛选流程2、（植物）叶绿体基因组⑴测序方案：实验方法纯化还是生信方法纯化⑵组装方法：denovovs.reference