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1、第23卷笫3期呼伦贝尔学院学报No.3、,o1.2320I5年6月JournalofHulunbeierCollegePublishedinJune.20l5不同类型的疾病对群体演化的影响张丽娟一(呼伦贝尔学院数学科学学院内蒙古海拉尔区O21008)摘要:在标准Penna模型的基础上,引入了参数疾病的影响程度,和参数闽值,通过设定疾病的影响程度、域值(与年龄,疾病的影响程度有关)来控制种群的演化。在参数取不同值时,给出了种群数量的演变、年龄结构及坏基因比例图,并分析了结果。疾病的影响程度对种群规模稳
2、定所用时间长短、稳定后种群规模的走小、种群的年龄结构及存活下来的个体坏基因的分布有一定的影响作用。关键词:Penna~型;种群演化;疾病的影响程度;闽值中图分类号:029文献标识码:A文章编号:1009~4601(2015)03—0ll4一o31.模型体的影响程度,它等于个体这age年各个年龄得病1.1个休的构成影响程廖的累加(患病死)在本文中个体基因串与标准Penna模型中的l-3个体的繁殖机制个体基因串的定义一致。存活下来的个体的繁殖机制与标准Penna模1.2个体的死亡机制型中的繁殖机制一致。
3、随着时间的推移,种群中的每个个体都要经1.4个体基因的突变机制受死亡的考验,在标准Penna模型中,每一时刻,,个体基因的突变机制与标准的Penna模型一导致个体死亡的因素有三个:老死、生存环境导致致。死亡、患病死。在本文中,我们将“患病死”的在这个模型中有如下参数:基因串长为;域0ge值]'now、r,.疾病的影响程度;基因的突变数为一i机制进行了改进:设域值7}1o=T蔓一,如即突变率;最小繁殖年龄17;州咳0的群体数量age为N(O;环境的最大容量Nmax,~环境所能容纳的个体的数目。agP’
4、Of2.模型的结果及讨论果∑t2,age-]>:兰L一一则个体死亡。其中J=lage下面是计算机模拟结果。2.1群体规模的演化是疾病的影响程度,是第i个个体第j岁时的模拟过程中Nmax=l0,T=2,肚8,M=2,基因位上的符号(0或1),age是个体当前的年龄。参数本文中与在标准Penna模型中的定义一一样,它表示存活下来的个体所能承受的有害突变B=32,T:T。参数取不同的值”ageage..一的最大个数。∑是个体在age岁得病对个(0.01、0.6、I、1.4、100),种群规模随时间的变化如
5、图1。值得注意的是当=1时,此模型是标收稿13期:2015-01·l5作者简介:张丽娟(1983一)女,汉族,呼伦贝尔学院数学科学学院讲师,硕士。研究方向:应用数学。资助项目:呼伦贝尔学院青年项目(YJQ~ZC201203);内蒙古教育厅项目(~JZY250)。.114.基因比例为:种群稳定后,存活下来的个体中,lna模型。所有在第个基因位上是坏基因的个体数之和(即第J.个基因位上是l的个体数之和)除以群体中的个体总数。不同的对应的群体中个体坏基因的比例分布结果见图2。模拟过程中Nmax:10,一l
6、—T=2,R=8,M=2,B=32,一7’:上一——。。age从图2中可以看出,当=T兰L一的数取不同的值,种群规模随时间的变化图。,=lagefGINumberofindividualsversusgenerations控制下,当<1,age=1,2,3,4时,上式很难成立,{.ordiferent.此时个体不易因疾病死亡。因此当略小于l时,越小存活下来的个体中,age=1,2,3,
7、4的坏基因的比例越高。但当远小于1(例如=0.0l,是1的一百分之一)时,存活下来的个体中低于25岁的个体的坏基因的比例普遍比t2'=l时个体的坏基因比例低。这是因为此时,对同一age,越晚发病对个体的影响越大。当>1,age-1,2,3,4时,个体的坏基因比例低于=l时个体的坏基因比例。这是因为当略大于1,age=l,2,3,4时,age一age—一很氩蚴参数取不同的值,个体坏基因的分布图FIG2Thefractionofbadgenesateveryage因疾病死亡。因此当略大于1时,越大存活o
8、findividualsfordifierent.下来的age=1,2,3,4个体的坏基因的比例越低。但訇1可见,在此规则下,无论取什么值,当达到一定程度(例如:10O,是1的100莫都先是减小,然后增大,最后都能趋向倍),存活下来的个体的坏基因比例在前20岁时、但种群稳定所用的时间长短与稳定后种比=l时个体的坏基因比例高。这是因为此时对内大小与的取值有关。当>l时,越同一age,个体越晚发病对个体的影响越小。我们群稳定所用的时间越短,稳定后种群规模可以通过坏基因分布
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