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时间:2020-03-29
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1、Cometassay简介单细胞凝胶电泳技术(Singlecellgelelectrophoresis,SCGE),又称彗星试验(Cometassay),是在核酸沉淀法(Nucleoidsedimentation)和晕圈分析(Holoassay)等检测技术基础上逐步发展起来的一种在单细胞水平检测有核细胞DNA断裂的新技术。它主要包括Olive等建立的测定DNA双链断裂的中性单细胞凝胶电泳技术和Singh等建立的测定DNA单链断裂的碱性单细胞凝胶电泳技术。此技术已经被广泛应用于放射生物学、DNA断裂与修复、毒理学、肿瘤治疗评价、细胞凋亡等领域的研究。是碱性单
2、细胞凝胶电泳可以检测DNA链的断裂和碱不稳定点,请问碱不稳定点是不是DNA上的脱嘌呤/嘧啶位点呀?还有个问题就是彗星试验检测到的DNA断裂其实是DNA损伤与修复的共同作用的结果,而且DNA修复的一个重要方式就是核苷酸切除修复,因此DNA修复过程也会造成DNA链的断裂,所以彗星试验所反映的时间-效应关系,可能并非与真实的DNA损伤有偏差,因为它无法鉴别修复过程中的DNA断裂。SCGE技术的原理:细胞核中的DNA为负超螺旋结构,而且很致密,通常DNA双链以组蛋白为核心,盘旋而形成核小体。一般情况下,偶然的DNA单链断裂对核酸分子双股结构的连续性影响不大,而且
3、不易释放出来,但是,如果用去污剂破坏细胞膜和核膜,用高浓度盐提取组蛋白,DNA残留而形成类核。如果类核中的DNA有断裂,断裂点将引起DNA致密的超螺旋结构松散,在类核外形成一个DNA晕圈。将类核置于电场中电泳,DNA断片可从类核部位向阳极迁移,经荧光染色后,在阳极方向可见形似彗星的特征性图像,故称“彗星试验”。彗星尾部即为迁移出类核的DNA片段。此时彗星尾部有可能还与头部以单链或双链的形式相连。DNA损伤越严重,导致DNA超螺旋结构越松散,产生的断裂点越多,DNA片段越小,从而在彗星尾部出现的DNA断片越多,则慧尾的长度、面积和荧光强度越大。通过测量彗星
4、尾部的长度、面积或荧光强度等指标,可以对DNA的损伤程度进行定量分析。随着SCGE技术的发展,可测量的指标也越来越多,而且更准确。目前,用于SCGE分析的指标主要分为四类,包括形状指标、距离指标、强度指标和矩类指标。其中形状指标有彗星细胞率;距离指标包括彗星尾长、彗星全长、彗星头部半径、尾部半径;强度指标包括头部DNA百分含量、尾部DNA百分含量、头部面积、尾部面积等;矩类指标包括尾矩、Olive尾矩等。依靠目镜测微尺人工测量彗星距离指标,主观性较强,人为误差较大,而且矩类指标更需要人工通过公式计算得出,使研究人员的工作量加大。因此,研究人员渴望开发出一
5、种专14用的彗星图像分析软件。近年来,各国研究机构纷纷推出各自的图像分析软件,这些分析软件可以快速提供一系列评价参数,如彗星总长、尾长、尾DNA含量、尾矩和Olive尾矩等,更好地客观定量DNA损伤。目前,用于彗星分析的软件包括英国KineticImaging公司的Komet5.5、PerceptiveInstruments公司的CometAssayⅢ、LAI公司的LACAAS、美国NIH的ImagJ、TriTek公司的CometScoreTM、印度原子能研究所的SCGE-Pro、奥地利癌症研究所开发的自动分析软件等。其中的部分软件可以到其相应网站下载,
6、但最好与相应的彗星分析系统硬件设备配套使用,价格昂贵,提高了研究成本。新近研发的彗星分析软件(CometAssaySoftwareProject,CASP)很好地解决了这一问题,该软件可以在普通微机上运行,界面友好,使用方便,分析速度快,可以一次同时给出最多达13个指标,分析结果避免了人为误差,更加客观和准确,结果可以以.txt文件直接输出,SPSS等统计软件可以直接读取其输出结果,便于统计学分析,节省大量人力物力。14中性电泳与碱性电泳在适合的实验条件范围内,没有损伤的细胞在中性或碱性条件都不可能做出尾巴。中性检测DNA双链断裂,碱性检测DNA单链断裂
7、。根据实验设计的需要,可以选择不同的实验条件,也可以同时选择两种条件,结果进行对比。拿电离辐射来说,中性和碱性检测的敏感范围不同,碱性SCGE的敏感范围值偏低,如可以小到0.05Gy,而中性SCGE的敏感范围值偏高,它可能检测不到0.05Gy的DNA损伤,但可以检测大到100Gy的损伤,而相对中性SCGE来说,碱性SCGE在大剂量照射时的各项指标容易形成平台。从修复方面来说,双链断裂的修复较单链断裂的修复慢,损伤重,后果更严重,双链断裂是后来形成染色体畸变和微核的主要物质基础。从文献上来看,药物引起的DNA损伤多采用碱性SCGE检测单链断裂,A:碱性电泳
8、是在1988年建立的,而最开始彗星方法都是在中性条件下做的(1984),所以我认
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