微生物的分类与鉴定.ppt

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1、Chap.10微生物的分类和鉴定1）通用分类单元2）微生物在生物界的地位3）各大类微生物的分类系统纲要4）微生物分类鉴定方法●分类:在研究微生物相似性的基础上，把每一微生物编排在一定的分类单元中，制定出检索表。●鉴定：运用现代分类系统，通过具体菌株描述，给未知物一个具体的分类位置。●命名：按照国际命名法规，给每个新的分类群一个新的学名。（一）种的概念●种：微生物的基本分类单位，具有许多共同特征的菌株的集合。●典型菌株（typestrain）:最具种特征的代表菌株。(Kribbellaamoyensissp.nov.typestrainisXMU198

2、T)●模式种（typespecies）：典型菌株的实体，常保藏于标本室中。(Typespecies:CCTCCAB2011012T)§.1通用分类单元●亚种：在种内有一个稳定特征不同于模式种的菌株，为最低等级的分类单元。●型：非分类单位，种内特征小差异的菌株。●菌株：同种的不同个体。1995,Haemophilusinfluenzae和Mycoplasmagenetalium最早被测序●细菌新种发表的要求1）在IJSB（IJSEM)等国际刊物上发表2）国内发表应送副本给IJSB编辑，以获有效目录公布3）提供模式种4）符合命名法规要求5）符合优先律●菌

3、种保藏中心与菌种目录ATCC：美国典型菌种保藏中心DSMZ:德国典型菌种保藏中心CCTCC：中国典型菌种保藏中心：下设：CCGMC等6个中心菌种目录及菌种保藏和购买二、学名的命名及有关法规●双名法：Bacillussubtilis（属名＋种名加词）Acetobacterpasteurianussubsp.pasteurianus(三名法)●学名(科学名):拉丁文,斜体●属名第一字母大写●性、数、格一致BacillussubtilisCMCC63501BacillussubtilisCohn1874Bacillussp.Bacillusspp.●缩写：

4、B.Subtilis●学名与俗名●名字的应用：§.2微生物在生物界的地位五界系统：●三域学说（Woese等）●真核生物起源的内共生学1）同一祖先2）古细菌吞噬了G-菌、蓝藻进化为真核生物？原始真核生物吞噬了G-菌、蓝藻进化为真核生物？3）内共生过程线粒体、叶绿体细胞器的进化证据：G-菌外膜与细胞器外膜相似性；内共生体如蓝色小体、真核生物（如蚜虫）与原核内共生体的发现；建议读物建议读物●古细菌生物学特征：§.3各大类微生物的分类系统纲要一、细菌、古生菌分类系统纲要《Bergey’sManualofSystematicBacterialogy》1,2版《

5、Bergey’sManualofDeterminativeBacterialogy》1-9版1.古生菌：《系统手册》（二版）原核生物:细菌界;古生菌界（2门63属208种）泉古生菌门广古生菌门●广古生菌门●泉古生菌门2.细菌的分类●《系统手册》（一版，1984-1989年，共4卷）卷类型群（Section）主要代表Vol.1G-1-11肠杆菌，假单孢菌，Vol.2G+12-17芽孢杆菌，梭菌，Vol.3古生菌等18-25甲烷菌，嗜盐菌，光合细菌Vol.4产孢放线菌26-33链霉菌《系统手册》（二版，2000~年，共5卷）Bergey'sManualo

6、fSystematicBacteriology(2ed)Vol.1:TheArchaea&theDeeplyBranching&PhototrophicBacteria,(2001)Vol.2:Proteobacteria(2004)Vol.3:TheLowG+CGramPositives(2000)Vol.4:TheHighG+CGramPositives(2000)Vol.5：ThePlanctomycetes,Spirochetes,Fusobacteria(2001)《系统手册》（二版）原核生物：古生菌界、真细菌界真细菌界：16门变形杆菌门（

7、Proteobacteria)厚壁菌门（Firmicutes)蓝细菌门（Cyanobacteria)…………..3.真菌（Fungi）的分类系统●Ainsworth系统《Thefungi》,Ainsworth,1973《AinsworthandBisby’sDictionaryoftheFungi》----7版，1983年，Hawksworth----8版，1995年，Hawksworth书355Cavaliner-Smith的6界系统§.4微生物分类鉴定方法一、经典分类鉴定方法◆传统分类的细菌鉴定程序●细菌自动鉴定系统API数值鉴定系统BBL鉴定系

8、统Biolog鉴定系统程序：1、获取辅助特征2、培养菌悬液加入生化反应板培养自动扫描自动鉴定打印