微生物的分类和鉴定.ppt

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1、第十一章微生物的分类和鉴定Classificationandidentification概论地球上到底有多少物种至今仍无准确答案，估计有分类记录的各类物种大约有150万，其中微生物超过10万。微生物学工作者要认识、研究和利用微生物或控制有害微生物，必须对它们进行分类（classification）。微生物分类学（microbialtaxonomy）是一门按微生物的亲缘关系把它们安排成条理清楚的各种分类单元或分类群（taxon）的科学。它的具体任务有：分类、鉴定（identification）和命名（nomenclature）。11.1通用分类单元11.1.1分类单元及其等级分类单元（tax

2、on）是指具体的分类群，如原核生物界（Procaryotae）、肠杆菌科（Enterobacteriaceae）、枯草芽胞杆菌（Bacillussubtilis）等都分别代表一个分类单元。微生物的分类单元一般也分为七个基本的分类等级（rank或category）或分类阶元。由上而下依次是：界、门、纲、目、科、属、种。分类单元的等级（阶元）只是分类单元水平的概括，它并不代表具体的分类单元。种以上的分类单元Domain（域）Kingdom（界）Phylum（门）Class（纲）Order（目）Family（科）Genus（属）Species（种）11.1.2种的概念种（species）是生物分

3、类中基本的分类单元和分类等级。指一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与同属内其他种有着明显差异的菌株的总称。在微生物中，一个种只能用该种内的一个典型菌株（typestrain）来作具体标本，故这一典型菌株就是该种的模式种（typespecies）。11.1.3学名（一）双名法学名是指一个菌种的科学名称，它是按照《国际细菌命名法规》命名的、国际学术界公认并通用的正式名字。一个种的学名是用拉丁词或拉丁化的词组组成。Escherichiacoli(Migula)CastellanietChalmers1919学名=属名+种的加词+（首次定名人）+现名定名人+定名年份属（或亚属）名：是一个表

4、示该种微生物主要特征的名词或用作名词的形容词，单数，其第一个字母应大写。种的加词：代表一个种的次要特征，同样由拉丁词或拉丁化的外来词所组成。字首一律小写，可以是一个形容词或名词。学名的发音：均应按拉丁字母发音规则发音。（二）三名法当某种微生物是一个亚种（subspecies,简称subsp)或变种(variety,简称var，是亚种的同义词）时，学名就应该按三名法拼写：学名=属名（斜体）+种的加词（斜体）+符号subsp或var（正体）+亚种或变种的加词（斜体）例1：苏云金芽孢杆菌蜡螟亚种（蜡螟苏云金芽孢杆菌）Bacillusthuringiensis(subsp)galleria例2：酿

5、酒酵母椭圆变种（椭圆酿酒酵母）Saccharomycescerevisiae(var)ellipsoideus11.1.4亚种以下的分类单元亚种以下的分类单元（infrasubspecifictaxa）很多，其提出和使用均不受细菌命名法规的限制。1.亚种（subspecies,subsp.,ssp.）2.变种（variety,var.）3.型（form）4.类群（group）5.菌株（strain）6.小种（race）7.相（phase）8.态（state）11.2微生物在生物界的地位(1)两界系统：1753年，瑞典博物学家林奈，在其名著《植物种志》中，第一次科学地提出动物界（Animal

6、ia）、植物界（Plantae）两界系统。（2）三界系统：1866年，德国动物学家E.H.Haeckel建议在动物界和植物界之外，应加上一个由低等生物组成的第三界：原生生物界，它主要由一些单细胞生物和无核类生物组成。（3）四界系统：1956年，Copeland提出了生物可分为四界的学说，即：动物界、植物界、原始生物界（原生动物、真菌、部分藻类）和菌界（细菌和蓝细菌）。1生物的界级分类学说（4）五界系统：1969年，R.H.Whittaker在Science上发表了“生物界级分类的新观点”的著名论文。在吸取前人工作经验的基础上，提出了五界学说。五界系统包括：动物界（Animalia）、植物界

7、（Plantae）、原生生物界（Protista）（包括原生动物、单细胞藻类、粘菌）、真菌界（Fungi）、原核生物界（Monera）(包括细菌、蓝细菌）。（5）六界系统：1977年，我国学者提出六界的设想，即在上述Whittaker五界系统的基础上再加上一个病毒界。2.三域学说：1977年，C.R.Woese比较研究了多种生物的16SrRNA或18SrRNA的核苷酸序列，在1978年由R.H.Whittaker等人提出