广西东兰乌鸡的遗传多样性分析.pdf

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1、南方农业学报JournalofSouthernAgriculture2015,46(4):692-696ISSN2095—1191;CODENNNXAABhttp://www.nfnyxb.cnDOI:10.3969/j:issn.2095—1191.2015.4.692广西东兰乌鸡的遗传多样性分析莫国东,黄英飞,廖玉英+,韦凤英(广西畜牧研究所。南宁530001)摘要:【目的】了解广西东兰乌鸡的遗传多样性及保种效果,为下一步的种质资源保护和育种研究提供参考依据。【方法】采集片羽东兰乌鸡和丝羽东兰乌鸡的翅静脉血样,提取总DNA,PcR扩增

2、18个微卫星位点并对其基因片段进行扫描,利用PopGen32生物软件分析测定东兰乌鸡群体的等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、杂合度(H)、多态信息含量(PIG),并与其他广西地方品种鸡进行聚类分析。【结果】18个微卫星标记在广西东兰乌鸡群中均表现出较高的多态性,从所检测的80个东兰乌鸡样本中共检测出98个等位基因,每个位点的平均Na为5.44个,Ne为2.78个,PIC为0.5382,H为0.5963。其中,丝羽东兰乌鸡和片羽东兰乌鸡分别检测到93和98个等位基因,平均每个位点的Ne分别为2.62和2.76个,P贮为0.5088

3、和0.5398,H为0.6247和0.5991。聚类分析结果显示,东兰乌鸡与广西三黄鸡、霞烟鸡、南丹瑶鸡的遗传距离(D^)均较远,与其品种的进化、地理分布和选育历史基本相符。【结论】广西东兰乌鸡保种群的遗传变异较大,具有丰富的遗传多样性,其选育潜力较高。关键词:东兰乌鸡;微卫星标记;等位基因;遗传多样性;聚类分析中图分类号:$831.89文献标志码:A文章编号:2095—1191(2015)04—0692—05AnalysisofgeneticdiversityofGuangxiDonglanblack—bonechickenM0Guo—

4、dong,HUANGYing—fei,LIAOYu-ying+,WEIFeng-ying(GuangxiAcademyofAgriculturalSciences,Nanning530001,China)Abstract:【Objectiv]ThepresentstudywasconductedtoanalysisthegeneticdiversityandpreservingbreedseffectofGuangxiDonglanblack-bonechickentoprovidereferenceforresourcesconserv

5、ationandbreeding.【Method】Thewingve.nousbloodwascollectedfromDonglanblack—bonechicken(silkyfeatherandcontourfeather).anditstotalDNAWasex.tracted.Then18microsatellitelOCiwereamplifiedbyPCRtechnology.thegenefragmentsobtainedwerescanned.Thenumberofalleles(Na),effectivenumbero

6、falleles(Ne),heterozygosity(H),polymorphisminformationcontent(P圯)weredeterminatedbyusingPopGen32biologicalsoftwaretodoclusteranalysisofGuangxiindigenouschickenbreeds.【Result】The18microsatellitelociofDonglanblack—bonechickenwerefoundtobehighlypolymorphic.Atotalof98allelesW

7、eredetectedoutfrom80Donglanblack—bonechickensamples.theaveragesofNa,Ⅳe,P配,HperlOCUSwere5.44,2.78and0.5963,respectively.Outofwhich,93and98allelesweredetectedoutfromDonglanblack—bonechickensofsilkvfeath—erandcontourfeather,respectively.AndtheaveragesofNeperloeuswere2.62and2

8、.76.respectively.theaveragesof肌perlocus0.5088and0.5398,respectively,theaveragesofHperlocusO.6247

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