雀形目六种鸟类线粒体基因组测定及其系统发生分析.pdf

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4、发生分析张华彬安徽师范大学硕士学位论文二〇一五年四月本论文经答辩委贵会全体委员审查，确认符合安徽师范大学硕±学位论义质量要求。答辩委员会签名：主席：王作单位、职称（）碱谢為麻系ＣＫＷ＇＇郝細导师：雀形目六种鸟类线粒体基因组测定及其系统发生分析摘要雀形目是鸟类中数量最多的一个类群，其形态多样、行为复杂、分布广泛。有关该类群的系统发生关系一直是研究的热点和焦点。随着分子生物学的发展，越来越多的基于线粒体基因组的鸟类系统发生研究成果得以发表，这在一定程度上解决了雀形目部分鸟类的分类地位和基部关系，仍有部分分枝节点以及科属间的关系比

5、较混乱，需要进一步增加物种种类和改善分析方法。本研究通过PCR扩增测定了雀形目鸫科红胁蓝尾鸲（Tarsigercyanurus）、北红尾鸲（Phoenicurusauroreus）、灰背鸫（Turdushortulorum），画眉科灰翅噪鹛（Garrulaxcineraceus）、黑脸噪鹛（Garrulaxperspicillatus），鸦雀科棕头鸦雀（Paradoxorniswebbianus）共三科六个物种的线粒体全基因组序列，并对每个物种的线粒体基因组进行了注释和分析。以鸡形目的原鸡（Gallusgallus）和雁形目的豆雁（Anserfabal

6、is）为外群，利用GeneBank中已公开的雀形目部分鸟类的全基因组和本研究测定的六种鸟类的全基因组中除ND6基因外的蛋白编码序列组成的数据集，以四种分析方法构建雀形目鸟类系统发生树，对雀形目的系统发生关系进行了分析。主要结果如下：红胁蓝尾鸲（T.cyanurus）、北红尾鸲（P.auroreus）、灰背鸫（T.hortulorum）、灰翅噪鹛（G.cineraceus）、黑脸噪鹛（G.perspicillatus）、棕头鸦雀（P.webbianus）的线粒体全基因组长度分别为16803bp、16772bp、16759bp、17873bp、17800b

7、p、16960bp。线粒体全基因组都包含37个基因：22个tRNA基因、13个蛋白编码基因和2个核糖体基因（12srRNA和16srRNA），以及1至2个控制区。灰翅噪鹛与黑脸噪鹛含有两个控制区，棕头鸦雀含有1个控制区和一段短的非编码区。其线粒体基因组的基I本特点与其它鸟类相似。重建雀形目系统发生关系表明，雀形目的单系地位是毋庸置疑的。支持将雀形目划分为鸣禽和亚鸣禽亚目；山雀科的单系性得到支持，但莺总科的单系性被拒绝；支持将戴菊属从鹟科中独立出来，称为一个科；鹟科与鸫科为姐妹群的关系，鸦雀科与莺科其他类群嵌套在一起，说明莺科与鸦雀科的亲缘关系较近；支持

8、将山雀科合并到鹟科，这与以前的研究结果相一致。关键词：系统发生；雀形目；线粒体基因组；碱基组成