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时间:2020-03-02
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1、动物病毒的分类及常见病毒的分子结构第一节动物病毒的分类一、概述根据国际病毒分类委员会(ICTV)1995年的第六次报告,现在已知的病毒有3600多种,它们分别属于71个病毒科中,其中动物病毒(包括脊椎动物病毒和无脊椎动物病毒)有2000余种,分属27个病毒科,而且可以肯定还有许多未被发现的新的动物病毒存在,或者还有新的病毒即将产生。病毒分类不仅有利于对已知病毒的认识和研究,促进对未知新病毒的发现,而且有助于对病毒的利用以及对病毒病的控制。例如我们可以根据同科或同属病毒之间共同抗原的存在,利用同科异属或同属异种的病毒进行免疫预防。应
2、用牛痘苗预防人的天花就是一例,虽在当时仅仅是一种偶然的发现。应用鸽痘病毒预防鸡痘,应用火鸡疱疹病毒预防鸡的马立克氏病(也是一种疱疹病毒性疾病),用猪呼吸道冠状病毒(PRCV)疫苗预防TGEV,也都是这方面的明显例子。一个理想的动物病毒分类方案,既要反映病毒之间的内在联系,又能被广大病毒工作者所接受,也就是说,应在着重依据病毒本身特性的同时,相应考虑使用时的方便,要有利于人们了解和研究病毒的本质,有利于人们利用和开发病毒以及开展病毒性疾病的预防、诊断和治疗。这也是1966年7月在莫斯科召开的第九届国际微生物学会议上专门成立国际病毒命
3、名委员会(简称ICNV,1973年后改称国际病毒分类委员会,简称ICTV)的原因,ICTV的任务是建立适合所有病毒通用的分类系统,以便统一协调病毒的分类和命名。二、病毒分类和命名的规则1.病毒的分类规则ICTV的分类规则以病毒的基本特性为依据,这些特性概括起来包括以下几个方面。(1)病毒的形态学:病毒粒子的大小和形状,呈球形、子弹状、砖形、卵形或杆状、丝状还是多形态;有无表面纤突及纤突的特征;有无囊膜;衣壳对称型和结构、立体对称、螺旋对称、还是复合对称;立体对称病毒粒子的壳粒数目或螺旋对称病毒的核衣壳直径。(2)理化学特性:
4、病毒粒子的分子量、浮密度、沉降系数,对酸碱(pH)的稳定性,对热的稳定性,对两价离子(Mg++和Mn++)的稳定性,对脂溶剂(乙醚或氯仿)的稳定性,对去污剂的稳定性,对幅射的稳定性。(3)基因组:核酸类型(DNA或RNA);基因组大小(kb);是单股还是双股、线状还是环状;正义、负义或双义;是整个的还是分节段的,节段的大小和数目;核酸的序列或部分序列,是否具有重复序列,是否有同聚物,G+C含量;5'端帽的存在与否和类型,5'端共价结合蛋白存在与否,3'端多聚A尾的存在与否。(4)基因组组成和复制策略,开放阅读框架的数目和位置,转录
5、特征,翻译特征,翻译后加工特征。(5)蛋白质:结构蛋白的数目、大小和功能活性,非结构蛋白的数目、大小和功能活性;蛋白质的特殊功能活性,尤其是转录酶、反转录酶、血凝素、神经氨酸酶和融合特性;氨基酸序列或部分序列,糖基化、磷酸化、豆寇酸化的程度;表位图谱。(6)脂质含量和特性;糖类含量和特性。(7)在细胞培养中的生长特性:包括对细胞种类的特异性,病毒蛋白的聚集场所,病毒粒子的装配场所,病毒粒子成熟和释放的部位和性质。(8)抗原性:与其它相关病毒的血清学关系。(9)生物学特性:包括自然宿主范围,传播方式,传播载体,地理分布,致
6、病性及与疾病的关系;组织嗜性,病理学和组织病理学。2.病毒的命名规则一般规则(1)病毒的分类和命名应是国际性的,应普遍适用于所有病毒。(2)通用的病毒分类系统采用目、科、亚科、属和种的等级制度,在种的命名尚不完善的情况下,许多病毒可用国际通用的俗名。(3)ICTV不统一规定病毒种以下的分类和命名。关于血清型、基因型、病毒株、变异株等的命名由公认的国际专家组决定。(4)对人工产生的病毒和实验室杂交株不予分类考虑,这些病毒的命名也同样由公认的国际专家组决定。(5)当代表成员病毒经过充分鉴定并在发表的文献上描述后,才能建立一
7、个类,以便与相似的类区别。同样,命名一个病毒时,该病毒必须经过充分鉴定并在文献上发表以明确区别于相似的病毒。关于类和病毒的命名规则(6)现有的类和病毒的名称无论是否适用均应予保留。(7)在类和病毒的命名中不遵守优先率。(8)不使用人名。(9)类和病毒的名称应便于使用,容易记忆,最好使用听起来悦耳的名称。(10)不使用下标、上标、连字符、斜杠和希腊字母。(11)新名称不应与已通过的名称有重复,应选用与正在使用的或过去使用的名称不相近的名称。(12)如果缩拼词对病毒学家有意义,且得到公认的国际专家组的推荐,可以接受作为类
8、的名称。(13)由一个类或病毒的名称所隐含的任何意义都会因在名称中涉及不是所有成员或潜在成员所具有的特征以及不是均等地适用于不同类的特征而排斥该类中的合适成员病毒,这种情况应当避免。(14)新名的选用应考虑国家或民族敏感性问题。应采用那些被病毒学家
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