基于ITS 序列探讨南瓜属植物系统发育.doc

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1、后记:苦心人,天不负,三千越甲可吞吴;有志者,事竟成,百二秦关终属楚。希望大家在工作中万事如意,心想事成。不要斤斤计较,快乐开心每一天!活的潇洒、自在。题记:看大地花开花落,望天空云淡云舒!悲催的80后,在这个悲催的时代,我们别无选择。参加工作几年了,积累了一些资料,我曾经花费大量心血在网上下载、修改、有时候熬夜熬到凌晨2点多钟。现在,我把它们拿出来,希望大家不要像我一样,花费时间、精力;到最后落个腰酸背疼。记住:不要后悔、彷徨、犹豫;时间就是金钱,效率就是生命!以此文献给悲催的80后、90后基于ITS序列探讨南瓜属植物系统发育<1.福建省农科院农业生物资源研究所,

2、福建福州350003;2.福州市农业科学研究所,福建福州350018)摘要:基于ITS序列对南瓜属三个种(中国南瓜、美洲南瓜和黑籽南瓜)的系统发育进行了研究。结果发现,ITS1全长188-191bp,ITS2全长251-263bp;南瓜ITS1序列的变异位点数为33,占ITS1全序列的的17.55%,ITS1序列的信息位点数为24,占ITS1全序列的12.77%,南瓜ITS2序列的变异位点数为45个,占ITS2全序列的17.93%,ITS2的信息位点数为31个,占ITS2全序列的12.35%;ITS1的G+C含量变化范围为51.60%-54.60%JTS2的G+C含

3、量变化范围为53.78%-56.98%;基于ITS1和ITS2分别构建的系统树可以看出,中国南瓜和美洲南瓜的亲缘关系较近,与黑籽南瓜的亲缘关系较远。本研究对南瓜的系统演化具有一定指导意义。关键词:核糖体,内转录间隔区,南瓜属,系统发育收稿日期:修回日期:基金项目:省科技厅璽点项目(200710037);省自然基金(2009J01069)第一作者简介:吴宇芬(I965-),女.副研究员,研究方向:主耍从牢西瓜、甜瓜及砧木新品种选育与栽培技术研究・通讯作者简介:周先治.男,1976年出生,助理研究员,博士,从事生物资源研究.E-mail:xianzhizhou©126.

4、com.PhylogenyoftheGenusCucurbitaBasedonITSSequenceDataWUYu-fen1,ZHOUXian-zhi1,CHENSheng1,CHENYang1,ZHAOYi-jie2(1.AgriculturalBio-resourcesResearchInstitute.FujianAcademyofAgriculturalSciences>Fuzhou>Fujian350003,China;2.FuzhouInstituteofAgricuhuralSciences,Fuzhou,Fujian350018,China)Aba

5、tract:Therelationshipsanddifferencesamongthespeciesofnioschata.pepoandficifofia(Cucurbitaceae:Cucurbita)wereexaminedusingdatafromtheinternaltranscribedspacer(ITS)regionofthenuclearribosomalDNA・TheITSsequenceswereobtainedfrom13speciesofnioschata^4speciesofpepoand2speciesofficifofia.Ther

6、esultsshowedthat,WithinCucurbita,ITS1is188-191bp(C.nioschataC・pepoandC.ficifofia)andITS2rangesfrom251一263bp(C・nioschataC・pepoandC・ficifofia).33variablepositions(17.55%)and24informativesites(12.77%)withinCucurbitciarefoundintheITS1sequences,45variablepositions(17.93%)and31informativesit

7、es(12.35%)withinCucurbitaarefoundintheITS2sequences.TheG+CcontentofITS1is51.60%-54.60%andthatofITS2rangesfrom53.78%to56.98%・TheresultingtreesfromITS1andITS2sequencesshowedthattherelationshipbetweenC.nioschataandC.pepowascloserthanthatbetweenC・nioschataandC.ficifofia・Thisstudywassigni

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