04 实验四 DNA限制性酶切和琼脂糖凝胶电泳.ppt

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1、实验四DNA限制性酶切和琼脂糖凝胶电泳EcoRIRestrictionEnzyme识别序列------G↓AATTC------------CTTAA↓G------实验原理---限制性内切酶及酶切反应BamHIRestrictionEnzyme识别序列:------G↓GATCC------------CCTAG↓G------HindIIIRestrictionEnzyme识别序列:------A↓AGCTT------------TTCGA↓A------每一种限制性内切酶都有特定的反应条件:pH范围:7.5~8.0缓冲液组份:Tris(三羟甲基氨基甲烷)、NaCl、

2、MgCl2、温育温度:37℃反应体系:DNA(1ug或更少)5ul10xBuffer2ulRestrictionEnzyme3ulH2O10ulTotal20ul混匀,37度保温30分钟实验原理---琼脂糖凝胶电泳电泳是在一个电场的作用下,在琼脂糖支持介质上,能将一个混合物分离成若干条区带(若干个组分)的过程。琼脂糖凝胶电泳是一种简便、快速、最常用的分离纯化和鉴定核酸的方法。琼脂糖是一种线性多糖聚合物。将琼脂糖粉末加热到熔点后冷却凝固便会形成良好的电泳介质。琼脂糖琼脂糖凝胶的浓度与DNA分离范围琼脂糖浓度(%)线型DNA分子的分离范围(Kb)0.35~600.61~200.

3、80.8~100.90.5~71.20.9~61.50.2~312.00.1~2电泳法的优点凡是能带电的物质,都可以用电泳法分离。样品用量少。设备简单。可在室温进行。操作简便,费时不多不同类型的电泳,有不同的用途。改进或找到更好的支持介质,就有可能大大地提高分辩率。1、TAE电泳缓冲液Tris-base冰醋酸EDTA2、琼脂糖凝胶(0.8%)琼脂糖:0.8gTAE:100ml试剂3、溴化乙锭(ethidiumbromide,EB)EB染色液工作液浓度:0.01~0.03mg/mlEB是一种荧光染料,其扁平分子可嵌入核酸双链的碱基对之间,在紫外线激发下,发出红色荧光。4、6x

4、LoadingDye组成0.25%bromophenolblue(深蓝色)0.4%orangeG(黄色)10mol/LTirs-HCl(pH7.5),50mol/LEDTA使用量5份DNA样品溶液加1份Blue/6xLoadingDye操作步骤一、酶切反应反应体系:λ-DNA5ul10xBuffer2ulHindIII3ulH2O10ulTotal20ul混匀,37度保温30分钟二、电泳。1、电泳前的准备工作轻轻刷干净电泳制胶的梳子,模板,电泳槽,用蒸馏水洗净晾干,把制胶槽放入模板中。2、制胶(1)每组称取琼脂糖0.24g,倒入三角瓶,再往其中加入30ml电泳缓冲液,微波炉

5、加热直到琼脂糖溶化。 (2)每组将琼脂糖液冷却到约70℃,轻轻倒入胶槽,并插 上梳子。凝固约30min. (3)取出梳子,把胶放在电泳槽中,准备电泳。3、点样和电泳987654321987654321(1)将酶切产物、自制DNA与6xLoadingDye混合,每个样品混合后体积均为24ul。a.自制DNA20ul+4ulLoadingDyeb.酶切产物20ul+4ulLoadingDye(2)将标准λDNA/HandIII、λDNA、酶切产物、自制DNA各10ul点入点样孔。(3)电泳。(4)EB染色10min。(注意不要污染实验室环境)λ-DNA/HindIIIMarke

6、rs片段大小(bp)和电泳带型示意图点样孔23130941665574361232220274、紫外分析仪下看胶2313023222027941665574361警告胶染色和观察时一定要带手套!!!EB(溴化乙锭) 诱变!!!结果记录与分析绘制电泳图谱

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