实验五DNA限制性酶切和琼脂糖凝胶电

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1、实验五DNA限制性酶切和 琼脂糖凝胶电泳限制性内切酶EcoRIRestrictionEnzyme识别序列:------G↓AATTC------------CTTAA↓G------HindIIIRestrictionEnzyme识别序列:------A↓AGCTT------------TTCGA↓A------每一种限制性内切酶都有特定的反应条件pH范围:7.5~8.0缓冲液组份:Tris(三羟甲基氨基甲烷)NaCl、MgCl2、巯基乙醇温度:37℃琼脂糖凝胶电泳是一种简便、快速的分离纯化和鉴定核酸的方法。琼脂糖是一种线性多糖聚合物。琼脂糖粉末加热到熔点后冷却凝固,会形成良好的电泳介质。

2、电泳在电场的作用下,在某种支持介质上,将一个混合物分离成若干条区带的过程。琼脂糖凝胶的浓度与DNA分离范围琼脂糖浓度(%)线型DNA分离范围(Kb)0.35~600.61~200.70.8~100.90.5~71.20.9~61.50.2~312.00.1~2试剂TBE电泳缓冲液45mmol/LTris-硼酸,1mmol/LEDTA,pH8.0加样缓冲液0.25%溴酚蓝(深蓝色,300bp)0.25%xylenecyanloFF(天蓝色,2000bp)40%蔗糖EB(溴化乙锭)染色液(有毒)0.5ug/ml,用水配制溴化乙锭(ethidiumbromide,EB)是一种扁平分子荧光染料,可嵌

3、入核酸的碱基对之间,在紫外线激发下,发出桔红色荧光。电泳结束后,将凝胶浸入0.5ug/ml的EB溶液中染色10min。在紫外光照射下可见核酸电泳带,DNA量一般>5ng。操作步骤酶切反应反应体系λ-DNA5ul10xBuffer2ulHindIII3ulH2O10ulTotal20ul混匀,37度保温30分钟制胶用电极缓冲液(0.5×TBE)配制0.7%的琼脂糖胶20mL0.14g琼脂糖,20mL0.5×TBE微波炉加热至沸腾,确定琼脂糖完全溶解冷却至60℃左右准备好梳子和胶槽,倒入琼脂糖溶液,冷却凝固点样Sample1自提DNA5ul+2ulLoadingDyeSample2自提DNA酶切

4、液20ul+4ulLoadingDyeSample3λ-DNA5ul+2ulLoadingDyeSample4λ-DNA酶切液20ul+4ulLoadingDye点样:Sample1和3各7ulSample2和4各10ul电泳接通电源,150v电泳0.5小时染色和观察切断电源,取出胶模,将凝胶放入EB染色液中,染色10分钟取出凝胶,紫外灯下观察DNA电泳带型警告EB诱变染色和观察时一定要带手套!1234←RNA提示1自提DNA2自提DNA/HindIII3λ-DNA/HindIII4λ-DNA结果记录与分析绘制电泳图谱λ-DNA/HindIIIMarkerλ-DNA/HindIIIMarke

5、r用HindIII彻底降解λ-DNA贮藏缓冲液:10mmol/LTris-HCl(pH7.5),10mol/LNaCl,1mol/LEDTAλ-DNA/HindIIIMarkers片段大小(bp)和电泳带型示意图点样孔2313094166557436123222027

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