假微型海链藻DGAT基因cDNA全长序列的分子克隆和分析【开题报告】

假微型海链藻DGAT基因cDNA全长序列的分子克隆和分析【开题报告】

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1、毕业论文开题报告海洋生物资源与环境假微型海链藻DGAT基因cDNA全长序列的分子克隆和分析一、选题的背景与意义1.微藻制备生物柴油1.1生物柴油近年来,随着全球经济的快速增长,石油和煤炭等化石能源的消耗大幅度上升,化石能源短缺危机已迫在眉睫,对生物质能等可再生能源的关注逐渐成为热点。生物柴油,又称单烷基脂肪酸酯,是以动、植物油脂为原料,与醇类经转酯作用获得的单烷基脂肪酸酯。生物柴油作为化石燃料的替代品,与化石柴油和燃料乙醇等其他液体燃料相比,有着突出的特性:生物柴油不含石蜡,闪点高,燃烧性能和效率要高于普通柴油,使用时更安全;可以通过种植、养殖或培养源源不断地得到

2、,因而属于可再生资源;生物柴油产品中含硫和氮较少,可以减少产生SO2和NO对大气的排放量。以淀粉类作物和木质纤维素类物质发酵产生的燃料乙醇,燃烧后尾气排放污染小,但其热值只有普通汽油的2/3,比柴油更低,且乙醇易吸水使燃烧值下降。1.2微藻制备生物柴油的优势作为新一代生物柴油原料,微藻拥有很多优势。例如:微藻种类繁多,分布极其广泛。全球已经鉴定的微藻大约有40000种,且其数量还在不断增加。大多分布在江海湖泊中,不与农作物争地,可以整年生长。微藻通常呈单细胞或丝状体,结构简单,整个生物体都能进行光合作用,所以光合作用效率高,生长周期短、速度快。微藻还可利用微生物发

3、酵技术,在光反应器中高密度、高速率培养。在同样条件下,微藻细胞生长加倍时间通常在24h内,对数生长期内细胞物质加倍时间缩短至3.5h。微藻油脂含量高。例如葡萄藻(Botryococcusbraunii)的含油量为细胞干重的25~75%。而高等植物种子的脂肪酸含量仅为干重的15%~20%左右。其油脂组成与一般油料植物相似,以C16、C18系脂肪酸为主。微藻能吸收并利用工农业生产中排放出的大量CO2和氮化物或从废水中取得氮、磷等,有利于改善环境。1.3假微型海链藻假微型海链藻属于中心硅藻纲,圆筛藻目,海链藻属。通过尼罗红染色法对宁波大学微藻种质库的63株微藻进行筛选,

4、研究结果显示,中性脂含量最高的为假微型海链藻(T.pseudonana),虽然假微型海链藻的中性脂含量最高,但是其细胞密度在整个生长期都比较低,因此对它的分子研究及培养条件的优化极为重要。1.3.1DGATDGAT(二酰甘油酰基转移酶)催化TAG(三酰甘油)合成途径的最后一步反应,也是该途径的限速酶,对它的研究对于进一步提高微藻含油量,降低生物柴油生产成本,有着十分重要的意义。另外,DGAT基因全长的克隆为下一步转入到拟南芥中提供目的基因。二、研究的基本内容与拟解决的主要问题:1.研究的基本内容1.1假微型海链藻(T.pseudonana)DGAT基因全长cDNA

5、的克隆1.2DGAT基因全长cDNA序列分析、比对2.拟解决的主要问题2.1得到假微型海链藻DGAT基因全长cDNA的克隆2.2分析和比对DGAT基因全长cDNA序列三、研究的方法与技术路线:1.假微型海链藻(T.pseudonana)DGAT基因全长cDNA的克隆1.1材料实验材料假微型海链藻(T.pseudonana)取自宁波大学微藻种质库,于5000mL三角瓶中,在温度20℃,盐度25~30‰,光照强度为50μmol/(m2·s),光暗比12h:12h的条件下采用NML3#培养液(表1)培养10d。表1.NML3#培养液配方Table.1.Compositi

6、onofculturefluid营养成分含量(g/L)KNO3100KH2PO410EDTA-Na220C6H5O7Fe.5H2O1MnSO40.5VB16×10-3VB125×10-5Na2SiO321.2方法1.2.1总RNA的提取首先,将三角瓶中的假微型海链藻(T.pseudonana)离心,去上清,得到100mg的藻泥于2mlEP管中。然后加入1mL的Trizol试剂,超声波清洗机中超声5min后提取总RNA。最后用20μLDEPC水(RNaseFree)溶解RNA,测定RNA的浓度和OD260/OD280的值。1.2.2反转录合成cDNA的第一条链取各样

7、品RNA1μg按TakaraPrimeScriptTMRT-PCRKit(宝生物工程有限公司)操作方法:在一个DEPC水处理过的PCR管中加入总RNA1μg,OligodTPrimer(2.5μM)1μL,dNTPMixture(10mMeach)1μL,加RNaseFreedH2O补至10μL,PCR仪上65℃反应5min后,离心数秒使模板RNA、引物等的混合液聚集于PCR管底部。然后加入5×PrimeScriptTMBuffer10μL,RNaseInhibitor(40U/μL)0.5μL,PrimeScriptTMRTase(for2step)0.5μL,

8、RNase

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