【精品】药学本科分子生物学实验指导

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1、实验项目一:总RNA的提取(必做)一、实验学时:6学时二、实验目的通过本实验学习总RNA的捉取和分析方法。三、实验内容利用匀浆裂解细胞,采用TRilzol试剂盒抽提RNA去除蛋白质和DNAo四、实验耍求学会提取基因组RNA的方法和操作过程提取RNA吋,要特别注意防止RNase的污染,所用玻璃器皿均应用0.1%的二乙基焦碳酸盐(diethylpyrocarbonate,DEPC)处理。塑料器材均使用一次性用品,并高压灭菌处理,必要时,也可用0.1%DEPC处理。五、实验所需仪器设备移液器及吸头,电泳

2、仪,台式高速离心机,恒温水浴锅,微量移液枪等六、实验原理TRIzol试剂适用于从细胞和组织中快速分离RNAo最大特点是可同时分离一个样品的RNADNA蛋白质.TRIzol使样品匀浆化,细胞裂解,溶解细胞内含物,同时因含有RNase抑制剂可保持RNA的完整性。在加入氯仿离心后,溶液分为水相和有机相,RNA在水相中。取出水相用异丙醇沉淀可冋收RNA;七、实验步骤1.颈椎脱臼法处死大鼠,打开大鼠腹腔,取出肝脏2.将肝脏用ddH20冲洗几遍,去除血液3.将大鼠肝脏放入研钵,用剪刀剪成绿豆大小的组织块,

3、4•冷冻离心机冷却到4°C(预冷半个小时)。准备冰盒。5.戴口罩,戴手套。6.每个EP管中,加入lOOmg左右的组织,加入ImLTrizol试剂,7.超声破碎仪破碎细胞8.剧烈震荡30秒,室温静置10分钟。9.加入200uL氯仿(三氯甲烷),剧烈震荡30秒,室温静置5分钟。10.离心:4°C,13,OOOrpm,lOmin。11.取新EP管。将上层水相(约600uL)加入新EP管,12.再加入500uL异丙醇,室温静置10分钟。13.离心:4°C,13,OOOrpm,lOmirio解RNA。15・

4、-70度保存提取的总R7A。八、注意事项1.RNA酶是一类生物活性非常稳定的酶类,除了细胞内源RNA酶外,外界环境中均存在RNA酶,所以操作吋应戴手套。2.RNA提取用品准备:1)普通的玻璃器皿:180°C烘干8小时(玻璃),研钵,小勺,试剂瓶若干个。2)一次性使用的塑料制晶:枪头、EP管等先用DEPC水处理然后高压灭菌,烘干。3)用烘烤过的药勺称取试剂。4)用DEPC水配制试剂:0.1%DEPC水:37°C至少处理12小时,高压灭菌15mino实验结果:成功从植物中分离得到总RNA实验项目二:总

5、RNA的纯化和鉴定(必做)一、实验学时:6学时二、实验目的通过本实验学习总RNA的纯化和利用琼脂糖电泳鉴定的方法三、实验内容1、通过选择性沉淀RNA分子去除DNAo2、琼脂糖凝胶电泳鉴定总RNA四、实验要求1、学会纯化植物总RNA的方法2、学会定量、定性检测RNA的方法五、实验所需仪器设备移液器及吸头,水平式电泳装置,电泳仪,台式高速离心机,恒温水浴锅,微量移液枪,微波炉或电炉,紫外透射仪,照相机、紫外分光光度计六、实验原理乙醇能够消除核酸的水化层,使带负电荷的磷酸基团暴露出来。在阳离子的足量时,

6、可以中和暴露的磷酸残基的电荷,使RNA沉淀。反复利用乙醇沉淀RNA,可以起到纯化RNA的作用。由于细胞中70-80%的RNA为rRNA,总RNA电泳后UV下应能看到非常明显的rRNA条带。动物rRNA大小分别约为5kb和2kb,分别相当于28S和18SrRNA;植物叶片屮由于含有大量的叶绿体RNA,可见4条或更多rRNA;细菌rRNA大小分别约为4kb和2kb,分别相当于细菌23S和16SrRNAoRNA样品中最大rRNA亮度应为次大rRNA亮度的1.5-2.0倍,否则表示RNA样品的降解。出现弥

7、散片状或条带消失表明样品严重降解。0D260/0D280比值是衡量RNA样品中蛋白质污染程度的指标。高质量的RNA样品,0D260/0D280值(lOmMTYis,pH7.5)在2.0左右。0D260/0D280读数受测定所用溶液的pH值影响。同一个RNA样品,假定在10mMTris,pH7.5溶液中测出的OD260/OD280读数在1.8-2.1之间,在水溶液中所测读数则可能在1・5-1.9之间,但这并不表示RNA不纯。取一定量的RNA提取物,用RNase-free水稀释n倍,用RNasc-fr

8、cc水将分光光度计调零,取稀释液进行0D260测定,按照以下公式进行RNA浓度的计算:终浓度(ng/p1)=OD260Xn(稀释倍数)X40七、实验步骤(-)总RNA的纯化1.提取的总RNA,加入75%乙醇500uL洗涤。2.离心:4°C,7,500rpm,5mino3.去上清液,加入无水乙醇500uL洗涤。4离心:4°C,7,500rpm,5mino5.去上清液,空气干燥5-10分钟。(RNA不可以完全干燥,防I上复溶的吋候困难)5.加入20-30uLDEPC水,55°C10mi

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