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1、成绩基因组学课程论丈RNA测序的研究进展薛璐学号:20094735专业:生物技术班级:生物技术一班论文提交日期2011年10刀19日RNA测序的研究进展薛璐(生物技术一班生命科学学院黑龙江大学哈尔滨150080)摘要:继人类基因纽计划完成后,RNAX成为分子生物学研究的一个新的热点和焦点,在短短儿年内已取得突破性的进展,而在RM研究进展中,测序技术是最重耍的而且是最关键的一项技术,本文详细的介绍了RNA测序的原理和方法,并同时也概括了H前对RNA测序的研究进展,RNA测序在生物研究中占有十分重要地位,RNA测
2、序己成为基因表达和转录组分析新的重要手段。因此随着科学技术的发展,RNA测序技术将会越來越成熟,并显现出重要的作用。关键词:RNA测序研究进展RNAsequencingresearchprogressXuelu(ThefirstclassofBiologicaltechnology,CollegeofLifeScience,HeilongjiangUniversity,Harbin,150080)Abstract:Followingthecompletionofhumangenomeproject,RNAan
3、dbecomemolecularbiologyresearchofanewhotspotandfocus,inafewshortyearshasmadebreakthroughprogress,andresearchprogressinRNA,RNAsequencingtechnologyisthemostimportantandthemostisoneofthekeytechnology,thispaperintroducedtheprincipleandmethodofRNAsequencing,anda
4、lsotosummarizethecurrentresearchprogressofRNAsequencing,RNAsequencinginthebiologicalresearchholdstheveryimportantposition,theRNAsequencinggeneexpressionandhasbecomeanimportantmeansnewtranscriptomicanalysis・Sowiththedevelopmentofscienceandtechnology.RNAseque
5、ncingtechnologieswillmoreandmoremature,andappearimportantrole.Keywords:RNASequencingResearchProgress正文:在牛•物学研究屮,随着新一代高通量DNA测序技术的快速发展,RNA测序(RNA・seq)已成为基因表达和转录组分析新的重要手段,并且随着RNA的重要性逐渐被人所认识,研究人员也开发出多种方法来研究它。1.RNA测序的产生诞生于20世纪70年代的Sanger法是最早被广泛应用的DNA测序技术[7],也是完成人
6、类基因组计划的基础但是,由于它测序通量低,费时费力,科学家们一直在寻求通量更高速度更快价格更便宜自动化程度更高的测序技术自2005年以來,以Roche公司的454技术、Illumina公司的Solexa技术和ABI公司的SOLiD技术为标応的新一代测序技术相继诞住,新一代测序技术乂称作深度测序技术,主要特点是测序通量高,测序时间和成木显苦下降。把这种高通量测序技术应用到lIlmRNA逆转录牛成的cDNA上,从而获得来自不同基因的mRNA片段在特定样本屮的含量,这就是mRNA测序或mRNA-seq同样原理,各种
7、类型的转录木都可以用深度测序技术进行高通检测,统称作RNA-scq或RNA测序。2.RNA测序的介绍2.1RNA测序的分类冃前RNA测序技术主耍分为两类,一类是将DNA高通量测序技术应用到由mRNA逆转录生成的cDNA±,从而获得来自不同基因的mRNA片段在特定样木中的含量,各种类型的转录木部可以用深度测序技术进行高通量定量检测。另外一类就是最新的肓接测序方法:利用单分子测序技术來进行RNA直接测序。2.1.1第一类第一类的主要代表是Illuniina/Solexa测序技术,LifeTechnologies公
8、司在这一技术的基础上也开发出了一种单细胞转录组测序技术,可以用于研究细胞从内细胞团发育成胚胎干细胞时的基因表达变化。Illumina/Solexa新测序技术基本原理是边合成测序(sequencingbysynthesis,SBS),即测序过程是以DNA单链为模板,在牛成互补链时,利用带荧光标记的dNTP发岀不同颜色的荧光來确定不同的碱基,新加入dNTP的末端被可逆的保护基团封闭,既保证单次反应只能加