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《分子标记技术在水产动物表型性状遗传分析中的应用【文献综述】》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、毕业论文文献综述生物技术分子标记技术在水产动物表型性状遗传分析中的应用摘要:综述了DNA分子标记技术的类型及代表性分子标记技术的基本原理和优缺点。随着DNA分子标记技术的发展,其在动物遗传上发挥了重大作用,使用DNA分子标记可以观察到整个基因组的遗传多样性。DNA分子标记的应用使得人们对遗传多样性、近亲繁殖、种类和品系鉴定以及遗传连锁图谱建立的研究都取得了很大进展,也加快了数量性状位点(QTL)基因的鉴定作为分子标记辅助选择(MAS)的研究。关键字:分子标记遗传技术近年来,随着生物技术的不断发展,诞生了一系列DNA分子标记技术,如限制性片断长度多态性(
2、restrictionfragmentlengthpolymorphism,简称RFLP)、随机扩增多态性DNA(randomamplifiedpolymorphicDNA,简称RAPD)、扩增片断长度多态性(amplifiedfragmentlengthpolymorphism,简称AFLP)、简单序列长度多态性(simplesequencelengthpolymorphism,简称SSLP)、随机扩增微卫星多态性(Randomamplifiedmicrosatillitepolymorphism,简称RAMP)、序列标签位点(Sequence-ta
3、ggedsites,简称STS)、DNA扩增指纹(DNAamplifiedfingerprinting,DAF)、扩增子长度多态性(ampliconlengthpolymorphism,简称ALP)、特异扩增子多态性(Specificampiliconpolymorphism,简称SAP)、单链构象多态性(singlestrandconformationpolymorphism,简称SSCP)和单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphisms,简称SNPs)等。DNA分子标记具有以下多种优点:(1)直接以遗传物质DNA的形式表
4、现,在生物体的不同组织和发育时期均可检测到,受季节和环境的影响较少;(2)数量多、分布广,遍及整个基因组;(3)多态性高,自然存在着许多等位变异,不需专门创造特殊的遗传材料;(4)表现为“中性”,即不影响目标性状的表达,与不良性状无必然的连锁;(5)有许多分子标记表现为共显性(codominance),能够鉴别出生物品种或品系的纯合基因型与杂合基因型,为育种利用提供极大的便利。1、分子标记技术的种类、基本原理及优缺点1.1RFLPRFLP是Grodzicker于1974年创立的。该技术最早用于DNA水平上的品种鉴定分析。其基本原理是首先利用特定的限制性
5、内切酶将生物基因组DNA进行酶切,获得大小不等的DNA片断,然后通过凝胶电泳分析形成不同的条带,最后经Southern杂交和放射自显影,即可揭示出DNA的多态性。但是,由于RFLP的技术要求高,检测时间长,且成本较高,使得大规模应用受到限制。1.2RAPDRAPD是1990年由美国杜邦公司科学家Williams和加利福尼亚生物研究所的Welsh等发明的一种分子标记技术。它是以基因组DNA为模板,以一个随机的寡核苷酸序列作引物,通过PCR扩增,产生不连续的DNA产物,用以检测DNA序列的多态性。它可以在对物种没有任何分子生物学研究的情况下,对其进行基因组
6、指纹图谱的构建。与RFLP技术相比,具有DNA用量少、简单快速、引物无种属特异性和不使用放射性同位素等优点。但是RAPD技术也有以下不足之处:(1)稳定性差,结果重复性不好;(2)RAPD一般为显性标记,不能鉴定杂合子;(3)RAPD标记在基因组中分布不均匀,每个标记提供的信息量较少。1.3AFLPAFLP是荷兰Keygene公司Zabeau等发明的一种DNA分子标记技术。其基本原理是选择性扩增基因组DNA的酶切片段,由于不同材料的DNA酶切片段存在差异,因而便产生了扩增产物的多态性。选择性扩增是通过在引物3’端加上选择性核苷酸而这现的,改变选择性核苷
7、酸的数目,就可以预先决定所要扩增的片段的数目。研究表明,AFLP产生的多态性远远超过RFLP和RAPD等技术,因而被认为是指纹图谱技术中多态性最丰富的一项技术。但该技术已申请专利,在生产及商业上的应用受到一定的限制。1.4SSRSSR是简单序列重复,称为微卫星DNA(microsatalliteDNA),是近几年在PCR基础上发展起来的第二代分子标记。SSR是一种真核生物基因组中普遍存在的重复序列,重复序列一般由1~6个碱基组成,重复次数在不同物种或同一物种不同基因型之间是高度可变的。这些重复序列两端大多是保守的单拷贝序列,因此可以根据保守序列设计特异
8、引物,通过PCR技术将中间的核心重复序列扩增出来,利用琼脂糖电泳或聚丙烯酰胺凝胶电泳分析技术可