纸电泳法分离单核苷酸

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1、纸电泳法分离单核苷酸实验目的学习电泳技术的基本原理了解RNA碱水解的原理掌握纸电泳分离单核苷酸的原理和方法什么是电泳?带电物质在电场中可以向其所带电荷相反的电极移动的现象称电泳。电泳分离生物大分子的原理:由于混合物中各组分所带电荷性质、电荷数量以及分子量的不同,在同一电场的作用下,它们泳动的方向和速度也不同。因此,在一定时间内各组分移动的距离不同,从而达到分离和鉴定的目的。生物大分子在电场中受到的作用力在电场中,推动带电质点运动的力(F)等于质点所带净电荷量(Q)与电场强度(E)的乘积。F=EQ质点的前移同样要受到阻力(f)的影响,对于一个球形质点,服从Stoke定律,即:f=6πrην(r

2、为质点半径,η为缓冲液的粘滞系数,ν为质点移动速度)v=EQ/6πrη影响V的因素颗粒本身:带电、大小、形状外界因素:电场强度E、缓冲液pH、离子强度I、电渗、支持介质的筛孔等。电泳技术的分类自由电泳(无支持体):等电聚焦电泳、等速电泳及密度梯度电泳等;区带电泳(有支持体):滤纸电泳(常压及高压)、薄层电泳(薄膜及薄板)、凝胶电泳(琼脂、琼脂糖、淀粉胶、聚丙烯酰胺凝胶)等。实验原理RNA的水解RNA在酸、碱和核酸酶的作用下,发生水解,降解成为多核苷酸和单核苷酸等产物。CMPRNA用酸水解可得到嘧啶核苷酸和嘌呤碱基;用碱水解,经过2’、3’一环核苷酸中间物,可得到2’一核苷酸和3’一核苷酸的混

3、合物;用5‘一磷酸二酯酶或3’一磷酸二酯酶水解则分别可得到3‘一核苷酸或5’一核苷酸。常用的是碱水解:0.5M的KOH在37℃作用16~24h,即可得到单核苷酸,再用HCLO4中和,除去K+。环状磷酸二酯实验原理电泳碱水解得到的A、U、G、C单核苷酸,是两性电解质,在一定PH值条件下所带电荷多少不同,可用纸电泳的方法进行分离。胞嘧啶核苷酸的解离pKa1=第一磷酸基的pKpKa2=碱基含N环的pK四种核苷酸的解离曲线核苷酸磷酸基电荷氨基的电荷静电荷AMP-1+0.54-0.46UMP-1+0-1GMP-1+0.05-0.95CMP-1+0.84-0.16UMP>GMP>AMP>CMP试剂和器材

4、电泳仪新华1号滤纸毛细管电吹风紫外检测仪A、U、G、C四种标准核苷酸RNA样品PH3.5柠檬酸钠缓冲液实验方法点样在距滤纸边缘10cm的地方用铅笔画一直线,两侧各间隔1.5cm做一个记号(A、U、G、C和RNA),共5点毛细管点样,标准品点4次,RNA样品点8次,在边上点上一滴苦味酸注意:尽量不要用手接触滤纸,点样直径不超过4mm,点一次用吹风机热风吹干后再点第二次实验方法2.电泳将滤纸平整放在电泳槽的塑料架上,纸两端垂于缓冲液中,用滴管湿润滤纸,最后湿润点样处。点样端接负极,电压600V,电泳大约1h。注意:样品处不要接触塑料架,滤纸上不要有水洼。结果观察取出滤纸,用电吹风热风吹干,在紫外

5、灯下观察结果,并画出图谱。值日生11和12组

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