基因芯片在乙肝病毒检测中的应用

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1、现代预防医学2008年第35卷第2期ModernPreventiveMedicine,2008,Vol.35,NO.2·319·文章编号:1003-8507(2008)02-0319-03中图分类号:R373.2文献标识码:A【实验技术及其应用】基因芯片在乙肝病毒检测中的应用12122211聂涌,王长本,丁显平,冯天芬,李良琼,罗德生,魏萍,朱一剑摘要:[目的]评价基因芯片技术在同时进行乙肝病毒基因分型及耐药突变基因检测中的准确性、敏感性和临床应用价值。[方法]50例血清标本都用荧光定量PCR和基因芯片两种方法进行检测,然后对两种方法的结果进行

2、比较,同时对基因芯片技术检测结果中乙肝病毒基因分型和耐药突变基因的情况进行分析。[结果]荧光定量PCR的阳性检出率为46%。基因芯片的阳性检出率为38%,其中10例为B型,9例为C型,结合荧光定量的结果,在整个基因芯片的检测结果中检测到的最低拷贝数为1.387e3copies/ml。19例阳性都存在拉米夫定敏感位点,共检测到3例对拉米夫定耐药的患者(2例为rt204I突变,1例为rt108M、rt204V突变)。[结论]基因芯片技术在同时进行乙肝病毒基因分型和耐药突变基因的检测中,结果准确、灵敏度高、通量性好,适合各大临床单位开展应用。关键词:

3、基因芯片;乙肝病毒;基因型;耐药突变基因APPLICATIONOFMICROARRAYINDETECTIONOFHEPATITISBVIRUSNIEYong,WANGChang-ben,DINGXian-ping,etal.(InstituteofMedicalGenetics,SchoolofLifeScience,SichuanUniversity,Chengdu610064,China)Abstract:[Objective]Toevaluatethesensitivity,accuracyandclinicalapplicationva

4、lueofmicroarraytechniqueinsi-multaneousdetectionofhepatitisBvirusgenotypesanddrugresistancemutationgenes.[Methods]50serumsampleswerede-tectedbothbyFluorescentquantitivePCRandMicroarray.Thenresultsofthesetwomethodswerecompared,equally,hepatitisBvirusgenotypesanddrugresistance

5、mutationgenesdetectedbymicroarraywereanalyzed.[Results]PositivedetectionratesofFQ-PCRandMicroarraywere46%and38%,respectively.Amongthesepositivesamplesdetectedbymicroarray,10casesweregenotypeB,and9casesweregenotypeC.ConnectedwiththeresultsofFQ-PCR,thelowestcopynumberswere1.38

6、7e3copies/mlamongthethosedetectedbymicroarray.Lamivudinesensitivegeneswerefoundedinall19positivecasesandLamivudineresistancemutationgenesweredetectedfrom3of19positivecases(twocaseswerert204I,onecasewasrt108Mandrt204V).[Conclusion]Microarraytechniqueisamethodwithhighaccurate,

7、sensitive,specificityandthroughputforthedetectionofHBVgenotypesanddrugresistancemutationgenes,whichcouldbeappliedtobeadiagnostictechniqueintheclinicallaboratory.Keywords:Microarray;HepatitisBvirus;Genotypes;Drugresistancemutationgenes乙型肝炎病毒(HBV)感染人类的肝脏,它的DNA含有和灵敏度,并为这项技术的临床应

8、用做评估。部分双链结构[1]。根据HBV全基因序列的同源性>92%或者S基因序列同源性>96%,可将HBV分为A-H等8种基因型[2,3],1对象和方